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Name : Hprae_0216 (Hprae_0216) Accession : YP_005835533.1 Strain : Halanaerobium praevalens DSM 2228 Genome accession: NC_017455 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha amylase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.2.1.10 Position : 255844 - 257508 bp Length : 1665 bp Strand : + Note : COGs: COG0366 Glycosidase; InterPro IPR006047:IPR006589; KEGG: ate:Athe_0165 alpha amylase catalytic region; PFAM: alpha amylase catalytic region; SMART: alpha amylase catalytic sub domain; SPTR: Alpha amylase catalytic region; PFAM: Alpha amylase, cataly DNA sequence : ATGAATAAAAAGTGGTGGAAAGAAGCGGTAGTTTATCAAATTTATCCTCGGAGTTTTAATGATAGTAATCAAGATGGAAT TGGTGATTTGAGAGGAATAATAGAAAAGATTGACTATTTAGATCAACTGGGGGTTGATGCTATTTGGTTAAATCCAGTTT ATAAATCTCCAAACGATGATAATGGTTATGATATTAGTGATTATAAAGCTATAATGGATGAATTTGGAACAATGGAAGAT TTAGAAGAATTAATGCAAGTTTTAGATGAGCATAATATTAAATTAATTATGGACTTAGTTTTAAATCATAGTTCAGATGA ACATCATTGGTTTCAAAAGTCACGTCAAAGTAAAGATAATCCTTATCGTGATTATTATATTTGGCGAGATGGTAAAAATG GTGGTCCACCTAATAATTGGCAGTCATTTTTTGGTGGTTCAGCCTGGAAATATGATCAACAGACTGAGCAATATTATCTC CACCTTTTTTCCGAAAAACAGCCTGATTTAAATTGGGAAAATCAAGAATTAAGAGCAAAAATTTATGAGATTATCAACTG GTGGTTAGAAAAAGGAGTCGATGGTTTTAGACTAGATGTAATTAATTTAATTTCTAAAGACCAAGATTTTCCAGATGGCA AAAAAGAAGGACTTAGAGGTCATGAATATTTTGCTAATGGACCTCGAGTTCATGAATTCATCCAAGAAATGGCAGCTAAA ACTTATAATAAATATCAAGCTATGACAGTTGGAGAAACTCCCTTTGTAGATAAAGATGAAGCTCTAAATTTTGTCAAAGC AGAAAGAAAAGAATTTTCGATGATTATTCCTTTTGAACATTTAGAGTTTGATAGTAAAGAGGGTTGGGCTCAAATATCTG ATTGGAAATTAAAAGAGCTGAAGGATTTAATGAGTGATTGGCAGTTCAAATTACAAGAAAATAATGGTTGGACAAGTCTT TATTTTTGTAATCATGATCAACCCCGGATTGTATCTCGCTATGGAGATGATGGTCAATATAGAAGAGAATCTGCTAAAAT GTTAGGAACTATGCTTCATACTTTAAGAGGAACTCCTTTTATTTATCAAGGAGAAGAAATCGGAATGACTAATATTAATT TTGACTCTTTGGCAGATTTTGATGATATTGAAACCAGAGCTAAAATTAGAGAAGAACAGGCAAAAGGGAACTTAAGCCAA GCTGAAATTTTAGAAATTGCAAATTATAGAACTAGGGACAATGCTCGAACTCCTATGCCCTGGAATGAAGAAGAATATGC TGGATTTTCAGAAACTAAACCTTGGTTAAAATTAAATAGTAATTATCCAGAGATTAATGTTGAAAAAGAACTGGCAGCTT CAGATTCGATTTTTAAATACTATCAAAAACTAATTGCTTTAAGAAAAAAATATCCAGTTTTTGCTTATGGGAAATATAAA CTATTATTAGCAGAACATCCAGATATTTATGCTTATCAACGTTTAGGCTCAAAAAATAATTTATTAGTACTTTTAAACTT TAGTTCTCAAGCAGCTGTTTTTGATTTAAGGACTGAATTGTCTGTAAATCAGGCAGAATTATTGCTAACTAATTACCAGT CAGAAAATAAATTCAGTTTAAAAGGCAGTTTAAAACCATATGAAGCTAGAGTTTATCTTCTTTAA Protein sequence : MNKKWWKEAVVYQIYPRSFNDSNQDGIGDLRGIIEKIDYLDQLGVDAIWLNPVYKSPNDDNGYDISDYKAIMDEFGTMED LEELMQVLDEHNIKLIMDLVLNHSSDEHHWFQKSRQSKDNPYRDYYIWRDGKNGGPPNNWQSFFGGSAWKYDQQTEQYYL HLFSEKQPDLNWENQELRAKIYEIINWWLEKGVDGFRLDVINLISKDQDFPDGKKEGLRGHEYFANGPRVHEFIQEMAAK TYNKYQAMTVGETPFVDKDEALNFVKAERKEFSMIIPFEHLEFDSKEGWAQISDWKLKELKDLMSDWQFKLQENNGWTSL YFCNHDQPRIVSRYGDDGQYRRESAKMLGTMLHTLRGTPFIYQGEEIGMTNINFDSLADFDDIETRAKIREEQAKGNLSQ AEILEIANYRTRDNARTPMPWNEEEYAGFSETKPWLKLNSNYPEINVEKELAASDSIFKYYQKLIALRKKYPVFAYGKYK LLLAEHPDIYAYQRLGSKNNLLVLLNFSSQAAVFDLRTELSVNQAELLLTNYQSENKFSLKGSLKPYEARVYLL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 3e-143 | 53 |
