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Name : Hprae_1915 (Hprae_1915) Accession : YP_005837200.1 Strain : Halanaerobium praevalens DSM 2228 Genome accession: NC_017455 Putative virulence/resistance : Unknown Product : protein translocase subunit secA Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 2101361 - 2103928 bp Length : 2568 bp Strand : - Note : COGs: COG0653 Preprotein translocase subunit SecA (ATPase RNA helicase); InterProIPR000185:IPR011115:IPR011130:IPR001650:IPR 011116:IPR004027:IPR014018:IPR020937; KEGG: hor:Hore_16440 preprotein translocase, SecA subunit; PFAM: SecA DEAD domain protein; S DNA sequence : ATGCTTAAGTTCCTCAAGAACTTATTTAAAGATCCAAATCAAAAAGAATTAGAAAAATTAGAACCTTTAGTAGAAGCAAT AAATGCCTTAGAGCCCCAAATAAAGGCTTTAAGTGATTTCGAATTGAAAGCGAAAACAGAAGAATTTAAAAAAAGACTAG AAAAAGGTGCAAGTCTTGATGATTTATTAGTAGAAGCCTTTGCTGTTGTTAGAGAAGCTGCACAGCGAGCAACTGAAGCT GGTTTTAGACATTATGATGTACAGCTTTTAGGTGGAATTGTACTTCATCAGGGTAAAATTGCAGAAATGAAAACAGGTGA AGGTAAAACTTTAGCTGCTACTCTACCAGTTTATTTAAATGCCCTAACAGGCAAAGGGGTCCATGTAATTACAGTTAATG ACTATTTAGCTGAAAGAGATAGTGAGTGGATGGGCCAAATTTATCGCTTTTTAGGAATGTCTGTTGGAGTAATTTTAAGT GGAATGACTCCTGCAGCCAGAAAAGAAGCTTATAATTGTGATATTACCTATGGTACAAATAATGAATTTGGTTTTGATTA TTTGCGAGATAATATGGCTTACAAAGAAGAGAATTTAGTCCAAAGAGATCATCATTATGCTATTTTAGATGAAGTAGATA GTATTTTGATTGATGAAGCCAGAACTCCTCTAATTATTTCTGGCCCAGTTCAGGAAAAAAGTTCAGATTATAAGAAATTT AATCGAGTTATACCAGCTTTAGAAGCAGAAGTCGATTATGAAATTGATGAAAAAAATAAATTAGTTACTTTAACAGAAGC TGGAGTTAGCAAAGCAGAAAAAAAATTAAATTTAGATAATCTTTATTCTGAAGAAAATTTTAAATTAAATCACCAGCTCA ATCAGGCTTTAAAAGCTCATACTTTAATGAAAAAAGACAGAGATTATATTGTTAAAGATGGAGCAGTTAAAATTGTAGAT GAGTTTACAGGTCGAGTTATGGAGGGCCGCCGCTATAGTGAGGGGCTTCACCAGGCAATTGAGGCTAAAGAAGGAGTAGA AGTCCAAAAAGGAAGTCAGACTTTTGCTAAAATAACTCTCCAAAACTTTTTTAGAATGTATAATAAATTAGCAGGAATGA CAGGTACAGCTGAAACTGAAGCTGAAGAATTTATTAAAATTTATGATATGTCAGTAGTTGTTATCCCCACAAATGAGCCC ATGATTAGGGAAGATATGCCAGATTTAGTTTTTACAAATAAGGAAGCTAAATACAAACATGTTATTGCTGAAATTACAAG ACTTTATCAAAAAGGTCAGCCTGTTTTAGTTGGTACAGCTGATATTGAAAACTCAGAAATGTTGAGCAGAGAATTAAAAA GAGCACGAGTTCCTCACCAAGTTTTAAATGCTAAAAATCATGAGCGAGAAGCTGAAATTATTAAAGATGCTGGTCAGAAA AAAAGTGTAACAATTGCTACTAATATGGCTGGTCGAGGAACAGATATAGTTTTAGGAGAAGGAGTAGTAGAATTAGGTGG ACTCCATGTTTTAGGAACAGAGCGTCACGAAAGTCGTCGGATTGATAATCAGCTGCGAGGAAGAGCAGGTAGACAGGGTG ATCCTGGTGCTTCACAATTCTATGTTTCACTAGAAGATGATCTGCTGAGATTATTTGGCTCAGATAAAATAAATGGGCTT TTAGATAAAATTGGTTTAGATGAAGATAAGCCAGTTGAACACAAGCTGATTTCTAATTCTATTGAGCGAGCTCAGCAAAA AGTAGAAGGCCGTAATTTTGATATTAGAAAGGCTATTTTAGAATATGATGATGTTTTAAATAAGCAGAGAGAAGTAATTT ATGCTCAGCGCAAAACCTTATTAACTACAGCTGAGTTAGAAGAAAAAATTGCTGGAATGTTAGAACAGTTTTTAGAGGAT ATAATGGAGATGCATATTTCCGAAGATTTGCATCCTGATGAATGGGATTTAGAGGGAATGCTCGATTATCTGCAGAATAA GGGGCTGGCCCAGGACTTAAGCTTAGCTGAGCTAGCAAGTAAATCTAGAGCTCAGATTAAAGAAAAAATAACTTTAAGTT CCTTAAGCTCTTACCAAGAGAAAAGAGAAAAAATTGACTCAGATAGATTTAATAGTATTATTAAGTTTTTAGCCTTAAGA GTAATTGATCGCAAGTGGATGACTCACCTTGATAATATGGATGAATTAAGACAGGGGATTGGACTCCGTGCTATTGGTCA AAAAGATCCTTTAACTGAGTATAAATTCGAGTCTTTTGATATGTTTAATGAACTAACTGCTTCAATTAGAGAAGACATAG TTGAAACTGCCTTTCAAATTGAAGTTGAAGCCCAAGAAAATTTACCCAAAAAAGAAATTATGCTTAATCAGTTAAATTAT TCTTCTCCAGAAACTGTCTTAGAAGGTAAGTCAAAAGGGAAAAATAATTCAAATGCTGGTTCTGGAAGTGTAGGCCAGCA GACTATTGTGAAAGAAGAAGAACCAGGTCGCAATGATCCCTGCCCTTGTGGTAGTGGGAAGAAATATAAAAAGTGTTGTG GGAGATGA Protein sequence : MLKFLKNLFKDPNQKELEKLEPLVEAINALEPQIKALSDFELKAKTEEFKKRLEKGASLDDLLVEAFAVVREAAQRATEA GFRHYDVQLLGGIVLHQGKIAEMKTGEGKTLAATLPVYLNALTGKGVHVITVNDYLAERDSEWMGQIYRFLGMSVGVILS GMTPAARKEAYNCDITYGTNNEFGFDYLRDNMAYKEENLVQRDHHYAILDEVDSILIDEARTPLIISGPVQEKSSDYKKF NRVIPALEAEVDYEIDEKNKLVTLTEAGVSKAEKKLNLDNLYSEENFKLNHQLNQALKAHTLMKKDRDYIVKDGAVKIVD EFTGRVMEGRRYSEGLHQAIEAKEGVEVQKGSQTFAKITLQNFFRMYNKLAGMTGTAETEAEEFIKIYDMSVVVIPTNEP MIREDMPDLVFTNKEAKYKHVIAEITRLYQKGQPVLVGTADIENSEMLSRELKRARVPHQVLNAKNHEREAEIIKDAGQK KSVTIATNMAGRGTDIVLGEGVVELGGLHVLGTERHESRRIDNQLRGRAGRQGDPGASQFYVSLEDDLLRLFGSDKINGL LDKIGLDEDKPVEHKLISNSIERAQQKVEGRNFDIRKAILEYDDVLNKQREVIYAQRKTLLTTAELEEKIAGMLEQFLED IMEMHISEDLHPDEWDLEGMLDYLQNKGLAQDLSLAELASKSRAQIKEKITLSSLSSYQEKREKIDSDRFNSIIKFLALR VIDRKWMTHLDNMDELRQGIGLRAIGQKDPLTEYKFESFDMFNELTASIREDIVETAFQIEVEAQENLPKKEIMLNQLNY SSPETVLEGKSKGKNNSNAGSGSVGQQTIVKEEEPGRNDPCPCGSGKKYKKCCGR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| secA2 | YP_006310687.1 | preprotein translocase subunit SecA2 | Not tested | FWisland_3 | Protein | 7e-120 | 42 |
