|
Name : Hprae_1824 (Hprae_1824) Accession : YP_005837109.1 Strain : Halanaerobium praevalens DSM 2228 Genome accession: NC_017455 Putative virulence/resistance : Unknown Product : NLPA lipoprotein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1996833 - 1997684 bp Length : 852 bp Strand : - Note : COGs: COG1464 ABC-type metal ion transport system periplasmic component/surface antigen; InterPro IPR004872; KEGG: hor:Hore_22280 NlpA lipoprotein; PFAM: NLPA lipoprotein; SPTR: NLPA lipoprotein; PFAM: NLPA lipoprotein; TIGRFAM: lipoprotein, YaeC family DNA sequence : ATGTTAAAGAAAACAATTTTAATTTTAGTTTTATTAAGTATTGTCTTTGTTGGTTCTGTACAGGCTGCTGATCATAAATT AAGTATAGGTGCTACTCCAGTGCCTCATGCAGAAATTTTAGATTTTATTAGAACTGAGTTAAAAGCAGCAGGGATTGATT TAGATTTAGTTGAGTTTACAGATTATGTTACTCCAAATATTGCCTTAGCTGATGGTAGTATTGATGCTAATTTTTTTCAG CATATTCCTTATTTAAAAGAATTTAACAAAAATAGAGCTTTGAATTTAAAAGCTGTGATTAAAGTCCATTTAGAACCAAT TGCTTTATACTCTGAAAAATATAATAGTTTAGAAGAAATTCCAGCTGGAGCTCAAATTGCTATTCCTAATGATCCTTCAA ATGAAGGTAGGGCCCTAATTTTATTAGACAGTAAAGGCTTAATTAGTTTAAAAGATCCTAATAATTTAAATGTAACTCCA GTTGATATTAAGGAAAATCCTAAAAACTTAAAATTTAAAGAGTTAGGTGCAGCACAGCTCCCTCGAGTTTTAAATGATGT AGCAGCTGCAATTATAAATACTAATTATGCTTTAGAAGCAGATTTAAATCCAGTTGCAGATGCTTTATTAATTGAAGGTA AAAATTCACCTTATGTTAATGTAATTGCTGTTCGAGCTGAGGATAAAGATAGTCAAAAAATTAAAATTTTAAAAGCAGTT ATTCAATCTGAGGCTGTTAAAGAATTTATTTTGGAAGAATATGAAGGTGCTGTTGTACCAGCATTTGAGCCGCTAGACAG TGGTCAAGCAGCTGGAGCAGTGAGAAGTAAAACAGGTGATTATATATTTTAA Protein sequence : MLKKTILILVLLSIVFVGSVQAADHKLSIGATPVPHAEILDFIRTELKAAGIDLDLVEFTDYVTPNIALADGSIDANFFQ HIPYLKEFNKNRALNLKAVIKVHLEPIALYSEKYNSLEEIPAGAQIAIPNDPSNEGRALILLDSKGLISLKDPNNLNVTP VDIKENPKNLKFKELGAAQLPRVLNDVAAAIINTNYALEADLNPVADALLIEGKNSPYVNVIAVRAEDKDSQKIKILKAV IQSEAVKEFILEEYEGAVVPAFEPLDSGQAAGAVRSKTGDYIF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SAAV_0786 | YP_003281709.1 | ABC transporter substrate-binding protein | Not tested | SaPIAv | Protein | 5e-43 | 43 |
