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Name : Hprae_1736 (Hprae_1736) Accession : YP_005837021.1 Strain : Halanaerobium praevalens DSM 2228 Genome accession: NC_017455 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Tex-like protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1901042 - 1903213 bp Length : 2172 bp Strand : - Note : COGs: COG2183 Transcriptional accessory protein; InterPro IPR003029:IPR018974:IPR006641; KEGG: hor:Hore_00510 RNA binding S1 domain protein; PFAM: Tex-like protein-like; RNA binding S1 domain protein; SMART: Resolvase RNase H domain protein fold; SPTR: RN DNA sequence : ATGACAGAATATATTAGTGTAGATTTAATTGAATTAGCAGCAAAAAAATTAAAATTGAAGTCAAATAAAGTTAAAGCAAC AGTTGAGCTCTTAGATTCGGGGAATACAGTTCCTTTTATAGCTCGCTATCGTAAAGAAATGACAGGTAGTTTAGATGAAG AAGAAATAAGGAATGTAGAAGAAAAAGTAAATTATTTAAGAAGATTATATGAGCGAAAAAATGAAGTAGCAAATGCTGCA GATAAACAAGATAAATTAAATAAAGAAATCTTAAATAAACTTAAAAAGGCAAAGACTTTACAAGAAGTAGAAGATTTATA CAGACCATTTAAAGTTAAAAAACAAACTAAAGCTGCTAAGGCATTAGCAAAAGGTTTAAAGCCTTTAGCAAAAATGATTT TTGAGCAGCAAAAAAATAAAACTGAAATAGAAAATATCGCCCTAAAATATATTGACCCTGAAAAAAAGTTAAAAACTATA GAAGAAGTTTTAAGTGGGGCTGAAGATATTATAGCAGGTGATATTTCTGATGATGCTGATTTGCGTAAAAAATTAAGAGA ATATGTTTTCCAAAATGCTAAAATAGTTGCTGTTCAAAAAAATGAAGATGAAACAGGAAAATACCAAGATTATTATGATT TCAAAGAATCAATTAATAAAATACCACCACATAGAATTTTAGCCTTAAATAGAGGTGAAAAAGATGATGTTTTAAGAGTT AAAGCTGAAGTTGATGATGAACGAGCAGTTAATATGATTTATAATTTTTATGAGTTTGAGAACAAAAAAAGTAGTACATT CGAAAATTTAATTAAGGCAGTTGATTATGCTTATAAAAGATTAATTTTTCCTGCTCTAGAAAGAGAAATTAGAAATGAGC TAACTGAAAAAGCTGAAATAAAGGCGCTTAATAATTTTTCGACAAATCTAAAATCTTTATTAATGCAGCCACCATTAGAA GGTAAAAAAGTTTTGGCTGTTGATCCTGCTTTTAGAACAGGTTGTAAGTTAGCTGCTTTGACAGAAAAAGGTTCACTTTT AGAAACAGGTGCTATTTATCCTCATCCACCAATTAACAAGCCAGAAACAGCTGCTAAGACTATTGAAAACTTAGTTAAAG AACATAAAATTGATTTAATTGTAATTGGTAATGGAACTGCTAGTAGAGAGACCGAAACTTTTATTGCTGAACTTATTAAA AATGGACTTGAAGTAGAATATACTATTGTAAGTGAGGCAGGAGCTTCTGTATATTCAGCTTCCAAAATGGCAAGAAAAGA ATTTCCCCAATTAGATGTTTCAATTAGAGGTGCAATTTCTATTGGGAGAAGATTACAAGATCCATTAGCTGAACTTGTAA AAATAGATCCCAAATCACTTGGGGTGGGGATGTACCAACATGATATCTCTCAAAAACGCTTAGAAAAGGCTTTAAATCAA GTTGTTGTAGATGCGGTTAACCATGTAGGTGTAGAAATTAATACTGCTTCAGCTGCCCTTTTAACATATGTAGCAGGTAT TAGCTCTAATAATGCTCAAAAGATAATTGAATATAGAGATCAGAATGGTGATTTTAACAAAAGAGAAGAATTATTTGAAG TTTATGGCTTTGGACCTAAAACTTATGAACAGGCAGCTGGTTTTCTTCGTTTAGATTCAGCCTTAGATCCTTTAGCTTTA ACTCCAATTCATCCTGAATCTTATCAAGCAGCTCAAAATATTTTAAAAGAGATTAATTTTAAAATGGCTGATATTAGAGA TAAAAATAAAGTAGAAGAATTGAGAAAAAAATTAACTGAAATAAATTTAACTAAAATAGTTTCTAAATTAGAGATTGGAA TTCCAACTGCTCGAGATATAATAAAATCTCTAAAACAGCCAGGGCGTGATCCAAGAGCTTCAATGCCAGCTCCAATTTTT AGAAAAGATATCTTGAAAATTGAAGATATTAAGCCTGGTCTGATTTTTAAGGGTAAAGTGCGAAATATAGTAGATTTTGG GGCTTTTATTGATATTGGTTTAAAACAAGATGGTTTATTACATATTTCAGAAATGAGTCAGATGTATGTTAATGATCCAT TTGAAATTGTCGAAATTGGTCAAAATATAGATGTTCAAGTTCTAGCTGTTGATCAAAGTAGAGGTAGAATTTCTTTAACC TTAAAATTTTAG Protein sequence : MTEYISVDLIELAAKKLKLKSNKVKATVELLDSGNTVPFIARYRKEMTGSLDEEEIRNVEEKVNYLRRLYERKNEVANAA DKQDKLNKEILNKLKKAKTLQEVEDLYRPFKVKKQTKAAKALAKGLKPLAKMIFEQQKNKTEIENIALKYIDPEKKLKTI EEVLSGAEDIIAGDISDDADLRKKLREYVFQNAKIVAVQKNEDETGKYQDYYDFKESINKIPPHRILALNRGEKDDVLRV KAEVDDERAVNMIYNFYEFENKKSSTFENLIKAVDYAYKRLIFPALEREIRNELTEKAEIKALNNFSTNLKSLLMQPPLE GKKVLAVDPAFRTGCKLAALTEKGSLLETGAIYPHPPINKPETAAKTIENLVKEHKIDLIVIGNGTASRETETFIAELIK NGLEVEYTIVSEAGASVYSASKMARKEFPQLDVSIRGAISIGRRLQDPLAELVKIDPKSLGVGMYQHDISQKRLEKALNQ VVVDAVNHVGVEINTASAALLTYVAGISSNNAQKIIEYRDQNGDFNKREELFEVYGFGPKTYEQAAGFLRLDSALDPLAL TPIHPESYQAAQNILKEINFKMADIRDKNKVEELRKKLTEINLTKIVSKLEIGIPTARDIIKSLKQPGRDPRASMPAPIF RKDILKIEDIKPGLIFKGKVRNIVDFGAFIDIGLKQDGLLHISEMSQMYVNDPFEIVEIGQNIDVQVLAVDQSRGRISLT LKF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 1e-117 | 42 |
