Gene Information

Name : Hprae_1411 (Hprae_1411)
Accession : YP_005836699.1
Strain : Halanaerobium praevalens DSM 2228
Genome accession: NC_017455
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : PTS system IIB component, Glc family
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1557769 - 1559280 bp
Length : 1512 bp
Strand : -
Note : COGs: COG1263 Phosphotransferase system IIC components glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific; InterProIPR018113:IPR011535:IPR003352:IPR001996:IPR 013013; KEGG: hap:HAPS_2092 PTS system, IIBC components; PFAM: phosphotransferase system EIIC; Phospho

DNA sequence :
TTGTTTAAACAACTACAAAAAATTGGGAAATCTTTTATGCTGCCGATTGCAATTTTGCCAGCAGCAGGTCTATTGCTCGG
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ATATTCTTTGCCGAACTTGCTGATCCAAATCATACAGGACTTTTTACAGAGGGAACTAGATTTTTTGCCGGTCGTTTTGC
AACAATGATGTTTGGTTTACCAGCTGGTGCTCTTGCTATGTATCACACAGTTAAAAAATCAAAAAGGGGAGCTGTTGTAG
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CCCTGGCTTTATGTAATTCACTCTATTTTTGATGGTTTATCTTTTGCAATAGCTGATATTTTAAATATTTCTATTGGAAA
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TAATTGTTGGACCTATCTGGTCAGCATTATACTATTTCTCATTTAGGTTTTTAATTCAAAAATTTGATGTTGCAATCCCA
GGTAGAGGAGATGAAAATCTGGAAGAGGAAGAAGTAGAAGCAGTTAACGGAGATCATTCATTATTTGAAAAATCAAAAGC
TGTTTTAGATGCCTTAGGTGGTCGAGAAAATATTGAAGAAATAGATGCCTGTATTACAAGATTAAGAGTTTCTGTTTATA
ATAAAGATAATGTTGATAAAACTAAATTGAAAAAATTAGGAGCTACAGGTGTATTAGAGGTGAAAGGTGGAGTGCAGGCA
ATTTTTGGTGCCTTAGCTGATCCACTTAAACAAAATATTGAAGATATTCTGGAAGATAGAAAGGTGATTTAA

Protein sequence :
MFKQLQKIGKSFMLPIAILPAAGLLLGIGGALSNPNTVQAYPFLDIGWLQALFAIMSSAGSIVFGNLALIMTVGLSLGLA
KKDKGTAALAGLVAFLVMNASIDGMITAFNVDVKSIDTGVVGSIVIGTMVSFLHNRYRNIKLPRFLGFFGGSRFIPIVSS
FASIAVGFVFFMTWPTFQDWLVSAGQAIAGFGVIGTFLYGFLLRLSGAVGLHHMIYPLFWYTELGGIAQVAGETIAGAQK
IFFAELADPNHTGLFTEGTRFFAGRFATMMFGLPAGALAMYHTVKKSKRGAVVGLFFSAALTSFITGITEPIEFMFLFVA
PWLYVIHSIFDGLSFAIADILNISIGNTFSGGLIDYLLFGVLQGNAATNWIYVLIVGPIWSALYYFSFRFLIQKFDVAIP
GRGDENLEEEEVEAVNGDHSLFEKSKAVLDALGGRENIEEIDACITRLRVSVYNKDNVDKTKLKKLGATGVLEVKGGVQA
IFGALADPLKQNIEDILEDRKVI

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ef0067 AAM75272.1 EF0067 Not tested Not named Protein 8e-132 60