Gene Information

Name : Hprae_0094 (Hprae_0094)
Accession : YP_005835413.1
Strain : Halanaerobium praevalens DSM 2228
Genome accession: NC_017455
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Na+/H+ antiporter NhaC
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 116279 - 117595 bp
Length : 1317 bp
Strand : +
Note : COGs: COG2056 permease; InterPro IPR018461:IPR001991; KEGG: amt:Amet_3313 Na+/H+ antiporter NhaC; PFAM: Na+/H+ antiporter NhaC-like; SPTR: Na+/H+ antiporter NhaC; PFAM: Na+/H+ antiporter family

DNA sequence :
TTGTTAACAAATCCTGTAGTTATTTCGGTATTAGTAATGTTAGGCCTAAGTTTATTAAATTTAAATGTAATTTTAGCTTT
ACTAGTAGCTGCTCTTGTGGGAGGAACAGTTTCGGGAATGGGTTTAAATGAAACAATGTCAGTTTTAATTAATGGAATGG
GAGGTAATGCTGAGACTGCTTTAAGTTATATTTTATTAGGTGCTTTGGCAGTTGCTGTTCAGAAAACAGGCTTAGCAACT
ATCTTGGCTAAAAAGATTGCCCGTGTTATTAAGGGTAAAAAAATGATTTTAGTTGGAATTATTGCAGTTGTTGCTTCTTT
TTCACAAAATTTGATTCCTGTGCATATAGCTTTTATTCCAATACTGATTCCACCTTTAATTGGAGTAATGAACAAGTTGA
AAATTGATAGAAGGGCAGTGGCATCAGCTTTAACCTTTGGTTTGAAGGCTCCTTATGTAGCTATACCAGTTGGTTTTGGT
TTGATTTTCCATAATATTATTAGAGATGAAATGGCTGCAAATGGTCTTGAAATAACTACTTCTTCTGTATCTAGTGTAAT
GTGGCTTCCAGGTTTAGGAATGGTAGTTGGTTTATTAGTAGCTATCCTTATTACTTATAGAAATCCTAGAGAATATAAAT
CGCTTCAAGAAACAGGGATAGAAGGTGAAGTTTCAGAAGATAATCAAGAAAAATTAGGTTTAGAAACTAAGCACTATGTT
GCTTTAGTAGGAGCTTTATCAGCCCTTGTTGTGCAGCTAACAATAGGTTCTTTACCTTTAGGTGCCATAATAGGTATTGC
AATTATGGTTATTTTTAGAGCTATTAAATGGGAAAATATCGATGACTTAATAAATGGTGGAATAGGTTTAATGGGTTTTA
TTGCTTTTGTAATGCTGATTGCTTCTGGTTATGGAGCAGTAATTAGAGAAACAGGAGCAGTTGCTCAGTTGGTTCAGTCA
GCATCTAATGCAATTGGTAGCAATCAATTAATGGCTTCTACAATTTTAATTGGAGTTGGCTTAATTGTGACAATGGGAAT
TGGTACTTCATTTGGGACAATACCAATTTTAGCAACCATTTATGTTCCCTTAGGCTTAGAACTTGGTTATGGCCCTTTGG
CTATTGTTGTTTTAATAGGTACAGCAGCAGCACTTGGTGATGCTGGTTCACCAGCTTCAGATAGTACTTTAGGTCCTACA
GCTGGTTTGAATGTTGATGGCCAGCATGATCATATTTGGGATACTTGTGTTCCAACCTTTTTGCATTTTAATATTCCCTT
AATGATCTTTGGAATAATAGGATCTTTAATATTTTAA

Protein sequence :
MLTNPVVISVLVMLGLSLLNLNVILALLVAALVGGTVSGMGLNETMSVLINGMGGNAETALSYILLGALAVAVQKTGLAT
ILAKKIARVIKGKKMILVGIIAVVASFSQNLIPVHIAFIPILIPPLIGVMNKLKIDRRAVASALTFGLKAPYVAIPVGFG
LIFHNIIRDEMAANGLEITTSSVSSVMWLPGLGMVVGLLVAILITYRNPREYKSLQETGIEGEVSEDNQEKLGLETKHYV
ALVGALSALVVQLTIGSLPLGAIIGIAIMVIFRAIKWENIDDLINGGIGLMGFIAFVMLIASGYGAVIRETGAVAQLVQS
ASNAIGSNQLMASTILIGVGLIVTMGIGTSFGTIPILATIYVPLGLELGYGPLAIVVLIGTAAALGDAGSPASDSTLGPT
AGLNVDGQHDHIWDTCVPTFLHFNIPLMIFGIIGSLIF

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00352 YP_008207817.1 putative permease Not tested AbaR25 Protein 5e-69 46
BJAB0868_00356 YP_008211682.1 putative permease Not tested AbaR26 Protein 5e-69 46
CpI19_1481 YP_005685924.1 Na+/H+ antiporter NhaC Not tested PiCp 5 Protein 3e-59 44
Cp1002_1472 YP_005681739.1 Na+/H+ antiporter NhaC Not tested PiCp 5 Protein 3e-59 44
cpfrc_01481 YP_003783881.1 hypothetical protein Not tested PiCp 5 Protein 3e-59 44
CpC231_1474 YP_005683838.1 Na+/H+ antiporter NhaC Not tested PiCp 5 Protein 3e-59 44