Gene Information

Name : NE061598_07595 (NE061598_07595)
Accession : YP_005831482.1
Strain : Francisella tularensis NE061598
Genome accession: NC_017453
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 2.2.1.1
Position : 1347772 - 1349763 bp
Length : 1992 bp
Strand : -
Note : COG0021 Transketolase

DNA sequence :
ATGTCTTTATCTATTCCACGCGAGTTTTCAAACGCTATAAGATTTTTATCTATTGATGCAACACTTAAAGCTAAATCAGG
ACATCCTGGAATGCCTATGGGGATGGCTGATATTGCCACAGTGTTATGGACAAAGTTTCTTAAGCACAATCCAAATAATC
CACATTGGATAAATAGAGATAGATTTGTTCTTTCAAATGGGCATGGCTCAATGCTTTTATATTCTCTGTTACATCTGACA
GGTTATGATCTATCTATTGAGGATATTAAAAATTTTAGGCAGTTACACTCAAAAACTCCAGGGCACCCTGAGTATGGCTA
TACGCCAGGAGTTGAGACAACAACTGGTCCATTAGGGCAAGGAGTAGCAAATGCTGTGGGTATGGCTTTAGGTGAAAAGC
TATTATCAGATAGGTATAATACACCTGATTTAAAAGTTATAGATCATCACACTTACGTGTTTTTAGGTGATGGATGTTTG
ATGGAGGGTGTTTCTCATGAAGCATGCTCATTAGCGGGGACTCTAGGTTTAAACAAATTAGTAGCATTTTGGGATGATAA
TAATATTTCGATAGATGGCGATACTAAGGGTTGGTTTAGTGATAATACACCTGAGAGATTTAGGGCGTATGGTTGGCATG
TTATAGAAAATGTTGATGGTCATGATTTTGTTGCGATTGAAAAAGCTATAAATGAAGCCCATTCTCAGCAGCAAAAACCA
ACTTTAATCTGTTGTAAAACTGTAATTGGTTTTGGCTCACCTGAGAAAGCTGGAACTGCCTCTGTGCATGGTTCGCCTTT
AAGTGATCAAGAAAGAGCCTCAGCTGCTAAAGAGCTTAACTGGGATTATCAAGCTTTTGAAATACCTCAAGATGTTTATA
AATACTGGGATGCTAGGGAAAAAGGACAAGCTTTAGAAGCAAATTGGCAAGGGCAATGGAATTTATTTAAAGACAGTCCT
AAGTTTGACGAATTTGAACGAGTTTTAAGTAAAGAGTTGCCAGTTGGATTAGAAAGCGCTATTAATGACTATATAGCTTC
GCAATTGAGTAATCCTGTCAAAGTGGCAACACGTAAAGCTTCACAAATGGTGCTTGAAGTCTTGTGTAAGAATATGCCTG
AGATGTTTGGTGGATCAGCAGATTTGACAGGATCAAATAATACTAATTGGAGTGGTTCAGTTTGGCTAAATAATACTCAA
GAAGGCGCAAATTATCTTTCTTATGGTGTTAGAGAGTTTGGTATGGCTGCAATAATGAATGGTCTAAGCCTTTATGGTGG
TATCAAACCTTATGGTGGTACATTCTTGGTATTTAGCGATTATTCAAGAAACGCGATAAGAATGTCAGCGTTGATGAAAC
AGCCTGTAGTTCATGTTATGTCGCATGACTCAATTGGTTTGGGAGAAGATGGACCAACTCATCAACCTATAGAACATGTT
CCGAGTTTAAGACTTATACCTAACTTAAGTGTTTGGCGACCTGCTGATACAATTGAAACAATGATAGCATGGAAAGAGGC
TGTAAAATCTAAAGATACGCCAAGTGTAATGGTACTTACACGTCAAAACTTAATGCCAGTAGTGCAAACACAGCATCAGG
TAGCAAATATTGCTAGAGGTGGTTATCTAGTTAAAGATAATCCTGATGCTAAATTAACTATTGTTGCTACTGGCTCTGAA
GTTGAGCTTGCTGTCAAAGTTGCTAATGAATTTGAAAAGAAAGGTATAAAATTAAATGTTGCTTCTATACCGTGTGTAGA
AGTTTTTGCTACTCAAGCTCACGAGTATAAAAAAACAGTAATAAAAGATGATATCCCGGCAGTTTTTGTTGAGATGGCGC
AACCTGATATGTGGTATAAATATATGCCAAAAGCAGGAGGGGAAGTAAAAGGAATCTATAGCTTTGGTGAGTCAGCACCG
GCTGAAGATTTATTTAAACGTTTTGGATTTACTGTAGAAAATATTAGCAATATTGTTGCTAAATATGTTTAA

Protein sequence :
MSLSIPREFSNAIRFLSIDATLKAKSGHPGMPMGMADIATVLWTKFLKHNPNNPHWINRDRFVLSNGHGSMLLYSLLHLT
GYDLSIEDIKNFRQLHSKTPGHPEYGYTPGVETTTGPLGQGVANAVGMALGEKLLSDRYNTPDLKVIDHHTYVFLGDGCL
MEGVSHEACSLAGTLGLNKLVAFWDDNNISIDGDTKGWFSDNTPERFRAYGWHVIENVDGHDFVAIEKAINEAHSQQQKP
TLICCKTVIGFGSPEKAGTASVHGSPLSDQERASAAKELNWDYQAFEIPQDVYKYWDAREKGQALEANWQGQWNLFKDSP
KFDEFERVLSKELPVGLESAINDYIASQLSNPVKVATRKASQMVLEVLCKNMPEMFGGSADLTGSNNTNWSGSVWLNNTQ
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PSLRLIPNLSVWRPADTIETMIAWKEAVKSKDTPSVMVLTRQNLMPVVQTQHQVANIARGGYLVKDNPDAKLTIVATGSE
VELAVKVANEFEKKGIKLNVASIPCVEVFATQAHEYKKTVIKDDIPAVFVEMAQPDMWYKYMPKAGGEVKGIYSFGESAP
AEDLFKRFGFTVENISNIVAKYV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 57
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 5e-180 55