Name : FNFX1_0386 (FNFX1_0386) Accession : YP_005825294.1 Strain : Francisella novicida Fx1 Genome accession: NC_017450 Putative virulence/resistance : Resistance Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.6.3.4 Position : 362555 - 364720 bp Length : 2166 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGTAACAAACAACAATATCTAAATTTTAAAGTATATGGTTTAGATTGTATTGAAGAAGTCAACATCATTAAAAAAGC ATTAAGTAAAAAAGTTGCTGAAGAGTATATGCAGTTTGATCTACTTAATGGCAAACTTTCAATCAACTCTAGTGATATCT CTACAAAAGAAATTATAGCTTTGATAAACAAATCAGGGTTAAAAGCATCAACATGGGATCAATATATTTCAAAAAATCAC GATACTAATTTTTACAGTAAATACTCAAGGTTAATTACAACGATAATCAGTGGAATGTTTATTGTTTTTGGCTATGTTTA TCATGGTTTAACCGCTGGATTTATAGATGCATTTGTTGCTAATGATAGCTCTACACAGCTAACCCCTTTGATTTCACAAA TATCTTATCTATTAGCTATATTGTTTGGTAGTTGGTTTGTTATACCTAAGGCTTTAGCTTCGCTTAAGAGATTTAGTGCT GATATGAATCTATTAATGCTAATTGCTATAGTTGGTGCAATAATTATTGGTCAACACTTTGAAGCATCTATAGTAAGTTT TTTATTTGCCTTTTCACTTTTACTTGAGTCATGGAGTGTCAGTAACGCTCGTAAAGCTATCACTAAGCTTATGCAACTAA CTCCAGATAAAGCATTAGTTTACTGCTGCCATGATAAGCAATTTGAAGAAAAGCCTATAGCAGAAATAAATATAGGCAAG AGAGTATTGATAAAACCAGGGCAAAGAATCCCTTTAGATGGAATTATTATCAAAGGTAGTGGTTATATCAACCAAGCGCC TATCACGGGCGAATCAATCCCTGTAGAAAAAACAATCAATGATGAAGTTTTTGCTGGGAGTATAAATGGTAGCTCTAGTA TTGAAATAAAAACCACAAAAACTGCTGATAATTCATCAGTTGCAAAAATAATCCAAGCTATTGAACACGCGCAAACAAAA CGCTCTAAAGCTGAGAAATGGGTCGATAAGTTCGCACGAATTTATACCCCTACAATGATAGCTTTAGCCCTACTAATAGC AATCTTACCACCTTTATTACTCGGGCAAGCTTGGCTTAAATGGATATATCAAGCATTAGTTATACTTGTCATAGCCTGTC CTTGCGCATTGGTGATATCAACACCAATTTCGATAGTTTCAAGCTTAGCAAAAGCTGCTAGAAATGGTATTTTGATAAAA GGTGGTGAATTTATAGAAATACCAGCAACACTTAAAGCTATTGCGTTTGATAAAACTGGTACCTTAACTTTAGGACAACC TACCATTACTGAAATATTTGTAGCTGAGAACTTTTCTGAACAATATTTAATCACTATAGCAGCTAGTCTTGAAAGCAGCG TTGATCATCCAATAGCTAAGGCTGTTTTAGACTATGCCACTAATGATAATATAGAATTCACACCAGCTAGTAATACTCAG GTTATCATTGGTAAAGGCGTAACTGGAGAGATTGATAATAATAGTTTTTGGCTTGGTAATCATGCTTTTGCTCATGAAAA ACAGCTTTGTAATAATAGTCTATTACATAAAAAAGCTATACAGCTTGCAGATAGTGGTCTAACACTTATATTTGTTGGCA ATAGTAAAGATATAATTGGTATTATAGCTCTACAAGATAAGATAAAAGCAAATATAAATATTTGTCTAAAACAACTAAAA AACCTTGGGATTATGCAAACAATCATGCTTACCGGTGATAATACTGCAACTGCGAAGGCTATTGCAACACAAGCTGAAAT TGATGAATTTTATGCTGAGCTTTTACCACAAGATAAGGTTACTAAGGTTGAGGAGTTAGTCAATAACTATGCTAGTGTTG CAATGGTTGGTGATGGTATTAATGATGCTCCAGCCCTAGCAACGGCTAACTTAGGAATTGCTATGGCTGCAATTGGCAAC GATATCGCGATAGAGACAGCAGACATTGCTTTGATGACAGATGACATCTCAAAAATTAGTTGGCTTATCAAACATTCAAA GAGAACATTGTCAATAATAAAACAAAATATAAGCTTTGCTATAGCTATAAAAGTTATTTTTATATCTTTAGCTGTGTTTG ATTTAGCTACCTTATGGATGGCGATAGCTGCTGATATGGGAGCTACGCTAATTGTTATAATAAACTCACTGAGACTGCTA AAATAG Protein sequence : MSNKQQYLNFKVYGLDCIEEVNIIKKALSKKVAEEYMQFDLLNGKLSINSSDISTKEIIALINKSGLKASTWDQYISKNH DTNFYSKYSRLITTIISGMFIVFGYVYHGLTAGFIDAFVANDSSTQLTPLISQISYLLAILFGSWFVIPKALASLKRFSA DMNLLMLIAIVGAIIIGQHFEASIVSFLFAFSLLLESWSVSNARKAITKLMQLTPDKALVYCCHDKQFEEKPIAEINIGK RVLIKPGQRIPLDGIIIKGSGYINQAPITGESIPVEKTINDEVFAGSINGSSSIEIKTTKTADNSSVAKIIQAIEHAQTK RSKAEKWVDKFARIYTPTMIALALLIAILPPLLLGQAWLKWIYQALVILVIACPCALVISTPISIVSSLAKAARNGILIK GGEFIEIPATLKAIAFDKTGTLTLGQPTITEIFVAENFSEQYLITIAASLESSVDHPIAKAVLDYATNDNIEFTPASNTQ VIIGKGVTGEIDNNSFWLGNHAFAHEKQLCNNSLLHKKAIQLADSGLTLIFVGNSKDIIGIIALQDKIKANINICLKQLK NLGIMQTIMLTGDNTATAKAIATQAEIDEFYAELLPQDKVTKVEELVNNYASVAMVGDGINDAPALATANLGIAMAAIGN DIAIETADIALMTDDISKISWLIKHSKRTLSIIKQNISFAIAIKVIFISLAVFDLATLWMAIAADMGATLIVIINSLRLL K |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SE0075 | NP_763630.1 | cadmium resistance protein B | Not tested | SCCpbp4 | Protein | 3e-112 | 43 |
unnamed | BAB47609.1 | cadmium resistance protein B | Not tested | Type-III SCCmec | Protein | 1e-112 | 43 |
cadA | BAC57487.1 | Probable cadmium-transporting ATPase (Cadmium efflux ATPase) | Not tested | Type-IIIinv SCCmec | Protein | 1e-112 | 43 |