Gene Information

Name : FN3523_1397 (FN3523_1397)
Accession : YP_005824451.1
Strain : Francisella novicida 3523
Genome accession: NC_017449
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : transketolase
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 2.2.1.1
Position : 1439784 - 1441775 bp
Length : 1992 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGTCTTTATCTATTCCACGCGAGTTTTCAAACGCTATAAGGTTTTTATCTATTGATGCAACACTTAAGGCTAAATCAGG
ACATCCTGGAATGCCTATGGGGATGGCTGATATTGCCACAGTGTTATGGACAAAGTTTCTTAAGCACAATCCAAATAATC
CACATTGGATAAATAGAGATAGATTTGTTCTTTCAAATGGACATGGCTCAATGCTTTTATATTCTCTACTACATCTGACA
GGTTACGATCTATCTATTGAGGATATTAAAAACTTCAGACAGTTACACTCAAAAACTCCAGGACATCCTGAGTACGGCTA
TGCACCAGGAGTTGAGACAACAACTGGCCCATTAGGACAAGGAGTAGCAAATGCTGTTGGTATGGCTTTAGGTGAGAAGC
TTTTGTCAGCTAGATATAATACACCTGATTTAAAAATTATAGATCATCATACTTATGTGTTTCTAGGTGATGGATGTCTG
ATGGAAGGTGTTTCACATGAAGCATGCTCATTGGCAGGGACTCTAGGTTTAAACAAATTAGTTGCATTTTGGGATGATAA
TAATATTTCGATAGATGGTGATACTAAGGGTTGGTTTAGTGATAATACACCTCAAAGATTTAGAGCATATGGTTGGCACG
TTATAGAAAATGTCGATGGTCATGATTATGCTGCGATAGAAAAAGCTATAAATGAAGCTCATGCACAGCAGCAAAAACCG
ACTTTAATTTGTTGTAAAACGGTTATAGGATTTGGCTCTCCAGAAAAGGCTGGTACTGCCTCTGTACATGGCTCGCCTTT
GAGTGAGCAAGAAAGAGCCTCAGCTGCTAAAGAACTTGATTGGAATTATGCTCCTTTTGAAATCCCTAATGATATATACA
AATACTGGGATGCTAAAGAAAAAGGGAAAGCTTTAGAGGCAAATTGGCAGAACCAATGGGATTTATATAAGAATAATCCT
AAGTTTGAAGAATTTGATAGAGTGTTGAAAAAACAGTTGCCCGCAAACCTTGAGCAGGAAGTTAATCAATATATTGCTTC
ACAGTTAGCGAATCCTGTCAAAGTGGCAACACGTAAAGCTTCACAAATGGCGCTTGAAGTATTGTGTAAGAATATGCCTG
AGATGTTTGGTGGATCAGCAGACTTGACAGGATCAAATAACACTAATTGGAGTGGCTCAGTTTGGCTAAATAATACTCAA
GAGGGTGCAAATTACCTTTCTTATGGTGTTAGAGAGTTTGGCATGGCTGCAATAATGAATGGTCTAAGCCTTTATGGCGC
TATCAAACCTTATGGTGGCACATTCTTAGTATTTAGCGATTACTCAAGAAATGCTATAAGGATGTCAGCACTAATGAAGC
AGCCTGTAGTACACGTTATGTCGCATGACTCTATTGGTTTAGGTGAGGACGGGCCAACACACCAGCCTATAGAACATATT
CCAAGCTTAAGACTTATACCTAATCTTAACGTTTGGCGACCTGCTGATACAATTGAAACAATGATAGCATGGAAGGAGGC
TGTAAAATCTAAAGATACGCCAAGTGTAATGGTATTAACGCGTCAAAACTTAATGCCAATAGTGCAAACACAACATCAAG
TTGCAAATATTGCTAAAGGTGGATATCTAGTCAAAGATAATCCTGATGCTAAATTAACTATCGTTGCAACAGGATCTGAA
GTTGAACTTGCTGTCAATGTTGCAAATGAATTTGAAAAGAAAGGTATGAATTTAAATGTTGCTTCTATACCGTGTGTAGA
AGTTTTTGCTACTCAAGTTCAAGAGTATAAAAAAACAGTAATAAAAGATGATATCCCAGCAGTTTTTATTGAAATGGCAC
AACCTGATATATGGTATAAATATATGCCAAAAGCTGGAGGAGAAGTAAAAGGAATCTACAGCTTTGGTGAGTCAGCACCA
GCTGAAGATTTGTTTGAGTATTTTGGATTTACTGTAGAAAATATTAGCAATATTGTTGCTAAATATGTTTAA

Protein sequence :
MSLSIPREFSNAIRFLSIDATLKAKSGHPGMPMGMADIATVLWTKFLKHNPNNPHWINRDRFVLSNGHGSMLLYSLLHLT
GYDLSIEDIKNFRQLHSKTPGHPEYGYAPGVETTTGPLGQGVANAVGMALGEKLLSARYNTPDLKIIDHHTYVFLGDGCL
MEGVSHEACSLAGTLGLNKLVAFWDDNNISIDGDTKGWFSDNTPQRFRAYGWHVIENVDGHDYAAIEKAINEAHAQQQKP
TLICCKTVIGFGSPEKAGTASVHGSPLSEQERASAAKELDWNYAPFEIPNDIYKYWDAKEKGKALEANWQNQWDLYKNNP
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EGANYLSYGVREFGMAAIMNGLSLYGAIKPYGGTFLVFSDYSRNAIRMSALMKQPVVHVMSHDSIGLGEDGPTHQPIEHI
PSLRLIPNLNVWRPADTIETMIAWKEAVKSKDTPSVMVLTRQNLMPIVQTQHQVANIAKGGYLVKDNPDAKLTIVATGSE
VELAVNVANEFEKKGMNLNVASIPCVEVFATQVQEYKKTVIKDDIPAVFIEMAQPDIWYKYMPKAGGEVKGIYSFGESAP
AEDLFEYFGFTVENISNIVAKYV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
tktA AAO17218.1 TktA Not tested tcd island Protein 0.0 57
APECO1_2641 YP_859417.1 transketolase Not tested Not named Protein 1e-180 55