Name : FN3523_0112 (FN3523_0112) Accession : YP_005823166.1 Strain : Francisella novicida 3523 Genome accession: NC_017449 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 112071 - 113504 bp Length : 1434 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTCTAATAATCTTTTAAACAAAGTAATAAGTAAATATTCTTTTGCTGGTAATAGAAGCTTTAGAGTAGTTAATCCTGC GACTAACGAAGTTATATGTAGCCTTGAGCAAAAATCAGCCGAATATGTTGAAGATAGTATTTTGGTTTCAAAACATGCTC AAAATGCATTTAGGAATAAACTTGCTGCTGAAAAATCAAAGCTTTTGGCTAGGTGGTATGATTTAGTTATAAGTAATATT GATGACTTAGCAGAGATTATCACCTTAGAAAGTGGCAAGCCATTAGCTGAGGCAAAAGTCGAAGTTCAATATGGTGCAAA TTTTATTCAATGGTATGCTGAGAAAGCTAAAAGAATAGACTCACGTGTTTTTGATCCTAACATTAGTAATGCTGAGGGTA GGGTGGATTATTATCCTGTTGGTGTGGTTGCAGCAATTACTCCTTGGAACTTCCCATTTGCGATGATTACGCGTAAAGCT GCTCCAGCGTTAGCTGCCGGTTGTAGTGTCATACTTAAGCCATCAGAGCTAACTCCTCTTACAGCACTTGCAGCTAGAGA GCTTTTTATCACTAGTGGAGCTGATGAGAATCTTTTGCAGGTAATTTGTGGTGATTCAAGTGTTATCGGTAAAGAACTAC AAAAGAGTAGCTTAGTCAGAAAAATAACTTTTACAGGCTCTACAAGAGTTGGTAAGATGTTAATGCAACAAGCAGCAGAA ACTGTCAAAAAGATTTCATTAGAGCTAGGTGGTAATGCGCCATTTATAATCTTTGAGAGTGCTAATCTAGAAAAAGCTGT TGAGGGTCTTATTGCCGCTAAAATTAGAAATGCTGGTCAGGTATGCATAGCACCAAATCGAATCTTTGTACATAATTCTA TCAATAAAGAATTTATCATGGTATTAAAAGCCTCGCTTATAAAACTTAAACAAGGTAATGGTTTAGATAATGATGTAAAA ATAGGTCCTTTAATCAATAAGGCTGCGGTTGAGAAAGTCCAACAGCATGTAGATGATGCTTTAGCAAAAGGAGCTAAGTT AGTATGTGGTGGTAGAATAAACCCAGAACTAGGTGGAAACTTCTATGAAGCTACTATTTTAGCTAATATGCAAGATACCA TGATTGCAAGTTGTGAAGAAACTTTTGGTCCTATTATTGCTATTTTTGGCTTTGATTCTGAAGATGAGGTTATCCAGCGA GCAAATAATACTAAATATGGTTTAGCAAGTTATTTCTTTAGTAATGATATTAATCAAATCAGAAGAGTTAGAAATGCTTT AGCATATGGTATGGTTGGTATAAACACCGGGTCAATATCAAATGAAAAAGCACCTTTTGGGGGTATCAAAGAGTCAGGTC TTGGTAGAGAGGGATCTGATGATGGTATTTATGAGTTTCTTGAAGCTAAGTATAGTTTGCAGGTTTTTGGTTAG Protein sequence : MSNNLLNKVISKYSFAGNRSFRVVNPATNEVICSLEQKSAEYVEDSILVSKHAQNAFRNKLAAEKSKLLARWYDLVISNI DDLAEIITLESGKPLAEAKVEVQYGANFIQWYAEKAKRIDSRVFDPNISNAEGRVDYYPVGVVAAITPWNFPFAMITRKA APALAAGCSVILKPSELTPLTALAARELFITSGADENLLQVICGDSSVIGKELQKSSLVRKITFTGSTRVGKMLMQQAAE TVKKISLELGGNAPFIIFESANLEKAVEGLIAAKIRNAGQVCIAPNRIFVHNSINKEFIMVLKASLIKLKQGNGLDNDVK IGPLINKAAVEKVQQHVDDALAKGAKLVCGGRINPELGGNFYEATILANMQDTMIASCEETFGPIIAIFGFDSEDEVIQR ANNTKYGLASYFFSNDINQIRRVRNALAYGMVGINTGSISNEKAPFGGIKESGLGREGSDDGIYEFLEAKYSLQVFG |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 4e-105 | 50 |