Name : lldP_1 (hp2018_0148) Accession : YP_005790961.1 Strain : Helicobacter pylori 2018 Genome accession: NC_017381 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 143256 - 144905 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGTTGAGCGCTTTAGTGGCTCTATCGCCTATTGCGCTCTT TTTTATCTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGCGCTTTCAATCCTTATTGCAT TATTTGTGTATAAAATGCCTGTTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGTTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AAGCTTGACGCCGGATCATCGCATTTTAGTGATTTTGATCGGGTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGCGCGATTGGTT TTGGAGGTCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTGGGTCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGGTTGTGTTTG ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGTGCGGTGGGTATCCCTATCACGGCGATGGCTAGCGTGGTGGGTATTCCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGTAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGCATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGCTTTAGAGGGATTAGAGAAACCTTTCCTGCAGTGGCCGTTACGGGCTTTAGCTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATTTAGGGCCGCAGCTCCCGGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCCTTAGTCGCTACCACTTTATTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAACACATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCAACGATCAGCACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACGATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGTGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTCAATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTGGTGTTCAAACTCCCTTTGATTTTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CCCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCTACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACCGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTGGTAGGTTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGATCTTTACAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCCAACACTTCCGGGGGCGTTGTGGGCAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTTAGATTTACAGTAAAATATTCTATCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATCGCTTATGTTTTCCCCTTTATTATTCCAGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLALSILIALFVYKMPVQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILSLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLVATTLFLKFWQPKHIFTSNGKEPTISTEKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKLPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 8e-128 | 56 |