Gene Information

Name : traG (hp2018_0979)
Accession : YP_005791827.1
Strain : Helicobacter pylori 2018
Genome accession: NC_017381
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : conjugal transfer protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 997245 - 998987 bp
Length : 1743 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAGAGAAAAGTCCAAAACATTAAAAGATAGATTTAAAGATAAAACTAGCAATTTATTCCATAAGCTTAATAGCATTCA
AAAAGATTATTACACCAAAATGCTTCCTAAGGCTTGCAAAGATGTCTTTACGCTAGGTTCTTCTAAAAGTTATCCTATGA
CTTTAAATTTTAACAAAGGTTTTTGTGTGGGGCTATATAAAGGTTTAAATTCGCTTAAGCCTACTTATTATGATGCTCCG
CTTTCTACTTTAATTATCGCTCCTCCTGGAAGTGGTAAAACCGCAGCTGTGGCTGTTCCTAATCTTTTAAATGTGCCTAG
CTCTTGTGTGGTGTTAGATATTAAAGGGGAGTTATTTGATTTGACAGCTGGTTACAGACAACAAGTTCTAAAAAATAAAA
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TTGCAAGCGCTCCTATAAAAAATTATGTCCCCTTAATCAATCCACAAAGCCGATTTTATACTGAATTATATGAATGTCAA
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TGAATCATTTAGAAAAAGACGATCAAGGCAATATTATAATGAAAGAGGGTATGTTAGATCCTATTATTAGAAACGAAGCG
AACAAATGGGCTAAAGCAAATGACAAAGAGTTTGCGAGCATTAAATCAGTTTATAGCCGTTTTATGCAAGTCTTTACAAG
CTATCAAGTTAAAAGCGCTACAGATAGCATGAGTTTTGAATACGAGGATTTAAGGACTGATAATATTTCACTCTACATTA
AAATCGCTCAAACAGATATTGACACGCTCGCACCGCTTATCCGTATCCTTTTGGAAAGTATTGCTAAAAATCTTTTATTG
AAAGAGAGTAAGAAATTTGAAGAAAGGGTTTATCTCTTTTTAGATGAATTTGTGCGTTTTGGTAAATTGCCTTTTTTGTT
AGAAATGCCCGCATTAAGTAAGAGCTATGGTGTGGTTTTAATTTTTATTACACAATCCAACGCTCTTATTGAAAAATATT
ACGGCAAAGAAGACGCAAGAATTGTTAATAGCACCGTGGCTTACAAAGTAATTTTCAAAATGGATGATTTAGAATACGCT
AAGCAAGTGAGCGAAGAAATCGGCAAGATGACTAGAAAAACACGAAGCCATTCTACAGAAAAAGGACAGCTCATTATGGG
AGGGACTTCTAGTATAAGTAAAGAAGCGTGGGATTTATTGAGCGCGCAAGACATCATGAATATTGATAAAGATGAAGTGA
TCATTTTAGTGAGCGGTCATAAAGCTAAACCCTTAAAATTAAAAGCGAATTATTATTTCAAAAACAAAGAATTATTCTCT
CGTATTAATTGGGAAGTCAAGCCCAATGAAGAAGTGTTTGATGCGTTAAAAAAGGTTGTATGA

Protein sequence :
MREKSKTLKDRFKDKTSNLFHKLNSIQKDYYTKMLPKACKDVFTLGSSKSYPMTLNFNKGFCVGLYKGLNSLKPTYYDAP
LSTLIIAPPGSGKTAAVAVPNLLNVPSSCVVLDIKGELFDLTAGYRQQVLKNKIFVFDPLGNDNTLKFNPFDKRIVEKLD
FNLKRRLVDEVGNTIFVEDGANKDPHWTQQAKNLFVFYALYDLCVHNTSTFFEIASAPIKNYVPLINPQSRFYTELYECQ
SSDNGFVKENGRYMAKVENGVKKMKPNVNVELLWYKQVAEQVYTENPKNYDGSVNHLEKDDQGNIIMKEGMLDPIIRNEA
NKWAKANDKEFASIKSVYSRFMQVFTSYQVKSATDSMSFEYEDLRTDNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRILLESIAKNLLL
KESKKFEERVYLFLDEFVRFGKLPFLLEMPALSKSYGVVLIFITQSNALIEKYYGKEDARIVNSTVAYKVIFKMDDLEYA
KQVSEEIGKMTRKTRSHSTEKGQLIMGGTSSISKEAWDLLSAQDIMNIDKDEVIILVSGHKAKPLKLKANYYFKNKELFS
RINWEVKPNEEVFDALKKVV

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
virD4-1 YP_002301090.1 VirD4 coupling protein Virulence cag PAI Protein 0.0 97