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Name : HPPN135_00705 (HPPN135_00705) Accession : YP_005789369.1 Strain : Helicobacter pylori Puno135 Genome accession: NC_017379 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease (lctP) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 142054 - 143709 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGCTAGAATTTCATCAAATTTATGACCCTTTGGGCAATATTTGGTTGAGCGCTCTTGTAGCCTTATTGCCGATTTTGTT ATTTTTCTTATCTTTAATCGTGTTCAAACTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGTTCTGTCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCACGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCATGGATCATCATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT TCAATCCATCACTTTGGATCATAGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCAGCGATTTTAGTGGGATTAGGGTTAAGCCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGC CTAATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCAGTGGGTATCCCTATAAGCGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTTGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTATTGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTACTTGGGACCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACGGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGTGATTTTTAGAAGCGACAACAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAACGCGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTGGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAAACTCTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTTTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTGGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGCTTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAGCTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGATT TTAACTCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTAGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCAGC GGTGGGATTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTGTTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TTGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MLEFHQIYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLIVFKLKGYTAAFLSVVLSAIIAVLVYKMPVSTVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAIAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDNKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQNASFPVVFKFFLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-95 | 52 |
