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Name : HPSNT_00395 (HPSNT_00395) Accession : YP_005786245.1 Strain : Helicobacter pylori Santal49 Genome accession: NC_017376 Putative virulence/resistance : Virulence Product : conjugal transfer protein (traG) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 84137 - 85864 bp Length : 1728 bp Strand : - Note : COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components DNA sequence : ATGAGAAAAAAATTTAAAACATTAAAAGATAAATTTAAGGATAAAGCCAGCAATTTATTCCACAAGCTTAATAGCATTCA AAAAGATTATTACACTAAAACTCTCCCTAAGGCTTGCAAAGATGCCTTTACGCTAGGTTCTTCTAAAAGTTATCCTATGA CCTTAAATTTTAACAAAGGTTTTTGTGTGGGGCTATATAAAGGTTTAAATTCGCTTAAGCCTACTTATTATGATGCTCCG CTTTCTACCTTAATTATCGCTCCTCCTGGAAGTGGTAAAACTGCAGCTGTGGCTGTGCCTAATCTTTTAAATGTGCCTAG CTCTTGTGTGGTGTTAGATATTAAAGGAGAGTTGTTTGATTTGACGGCTGGTTACAGACAACAAGTTCTAAAAAATAAAA TTTTTGTATTTGATCCCTTAGGGAATAATAACACGCTTAAATTCAATCCGTTTGATAAACGCATTGTAGAAAAATTAGAT TTTAACAGAAAGCGAAGGCTTGTAGATGAAGTGGGTAATACTATTTTTGCTGAAGATGGGGCAAATAAAGACCCTCATTG GACACAGCAAGCTAAAAATTTATTTGTCTTTTACGCTCTTTATGATTTGTGTGTGCATAACGCTAGCACTTTTTTTGAAA TTGCAAGCGCTCCTATAAAAAATTATGTCCCCTTAATCAATCCACAAAGCCAATTTTATACTGAATTATATGAATGTCAA AGTAGCGATAATGGTTTTGTTAAAGAGAACGGGCGTTATATGGCTAAAGTAGAAAATGGCGTTAAAAAAATGAAACCTAA TGTCAATGTGGAATTGCTATGGTATAAACAAGTAGCTGAACAAGTCTATACTGACCCAGAAAATCCTAAAAATTATGATG GCTCTGTGAATAATTTAGAAAAAGACGATCAAGGCAATATTATAATGAAAGAGGGTATGCTAGATCCTATTATTAGAAAC GAAGCGAACAAATGGGCTAAGGCGAATGATAAAGAGTTTGCGAGCATTAAATCAGTTTATAGCCGTTTTATGCAAGTCTT TACAAGCTATCAAGTTAAAAGCGCTACAGATAGCATGAGTTTTGAATACGAGGATTTAAGGGCTGACAACATTTCACTCT ATATTAAAATCGCTCAAACAGATATTGACACGCTCGCACCGCTTATCCGCATCCTTTTGGAAAGTATTGCTAAAAATCTT TTATTGAAAGAGAGTAAGAAATTTGAAGAAAGGGTTTATCTCTTTTTAGATGAATTTGTGCGTTTTGGTAAATTGCCTTT TTTATTAGAAATGCCAGCATTAAGTAGGAGCTATGGTGTGGTTTTAATTTTTATCACGCAATCCAACGCTCTTATTGAAA AATATTATGGTAGAGAAGATGCAAGAATTGTTAATAGCACCGTGGCTTACAAAATAATTTTCAAAATGGATGATTTAGAA TATGCTAAACAGGTGAGCGAAGAAGTTGGTAAGATGACTAGAAAAACACGAAGCCACTCTACAGAAAAAGGACAACTCAT TACCGGAGGGACTTCTAGTATAGGTAAAGAGGCGTGGGACTTATTGAGCGCACAAGATATTATGAATATTGATAAAGATG AAGTGATCATTTTAGTAAGCGGTCATAAGGCTAAACCTTTAAAATTAAAAGCGAATTATTATTTCAAAAACAAAGAATTA CTCTCTCGTATTAATTGGGAAGTCAAGCCCAATGAAGAAGTGTTTTGA Protein sequence : MRKKFKTLKDKFKDKASNLFHKLNSIQKDYYTKTLPKACKDAFTLGSSKSYPMTLNFNKGFCVGLYKGLNSLKPTYYDAP LSTLIIAPPGSGKTAAVAVPNLLNVPSSCVVLDIKGELFDLTAGYRQQVLKNKIFVFDPLGNNNTLKFNPFDKRIVEKLD FNRKRRLVDEVGNTIFAEDGANKDPHWTQQAKNLFVFYALYDLCVHNASTFFEIASAPIKNYVPLINPQSQFYTELYECQ SSDNGFVKENGRYMAKVENGVKKMKPNVNVELLWYKQVAEQVYTDPENPKNYDGSVNNLEKDDQGNIIMKEGMLDPIIRN EANKWAKANDKEFASIKSVYSRFMQVFTSYQVKSATDSMSFEYEDLRADNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRILLESIAKNL LLKESKKFEERVYLFLDEFVRFGKLPFLLEMPALSRSYGVVLIFITQSNALIEKYYGREDARIVNSTVAYKIIFKMDDLE YAKQVSEEVGKMTRKTRSHSTEKGQLITGGTSSIGKEAWDLLSAQDIMNIDKDEVIILVSGHKAKPLKLKANYYFKNKEL LSRINWEVKPNEEVF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virD4-1 | YP_002301090.1 | VirD4 coupling protein | Virulence | cag PAI | Protein | 0.0 | 99 |
