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Name : nupC (HMPREF0462_1193) Accession : YP_005785759.1 Strain : Helicobacter pylori 83 Genome accession: NC_017375 Putative virulence/resistance : Unknown Product : CNT family concentrative nucleoside transporter Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1202079 - 1203335 bp Length : 1257 bp Strand : - Note : COG: COG1972; Pfam: PF01773,PF07670,PF07662; InterPro: IPR008276 DNA sequence : ATGATTTTTAGCTCTCTTTTTAGTGTTGTAGGGATGGCGGTGCTTTTTCTTATTGCTTGGGTGTTTTCTAGCAATAAAAG GGCTATTAATTATCGCACGATTATTAGCGCGTTTGTGATCCAGGTGGCTTTAGGGGCGTTGGCTTTATATGTGCCTTTGG GTAGGGAAATGCTGCAAGGTTTAGCTAGTGGCATACAAAGCGTGATTGGTTACGGCTATGAAGGGGTGCGCTTCCTGTTT GGTAATCTCGCTCCAAACGCTAAGGGCGATCAAGGGATAGGAGGCTTTATCTTTGCGATCAATGTTTTAGCGATCATTAT CTTTTTTGCTAGTTTGATTTCACTCCTATACTATTTAAAAATCATGCCTTTAGTGATCAATCTCATCGGTGGGGCGTTGC AAAAATGCTTAGGCACTTCTAAAGCAGAAAGCATGAGCGCAGCGGCTAATATTTTTGTAGCGCACACAGAAGCGCCCTTA GTCATTAAACCTTATTTGAAAAGCATGAGCGATTCAGAGATTTTTGCGGTCATGTGCGTGGGCATGGCTAGCGTTGCGGG GCCTGTGTTAGCCGGGTATGCGAGCATGGGCATTCCTTTACCTTATTTAATAGCCGCTTCGTTTATGTCCGCTCCTGGGG GTTTGTTGTTCGCTAAAATCATTTACCCGCAAAACGAAACCATTTCTAGCCATGCAGATGCTTCTGTAGAAAAGCATGTC AATGCCATAGAAGCTATCGCTAATGGGGCAAGCACAGGGCTAAATTTAGCTTTGCATGTGGGAGCGATGCTTTTAGCCTT TGTGGGGATGCTTGCACTCATTAACGGGCTTTTAGGGGTTGTAGGGGGGTTTTTAGGCATGGAGCATTTGTCTTTGGGGT TAATTTTAGGCACGCTCTTAAAACCATTAGCCTTTATGCTAGGCATTCCTTGGAGTCAGGCCGGGATTGCTGGAGAAATC ATAGGCATTAAAATTGCGCTCAATGAATTTGTGGGCTATATGCAATTTTTACCTTATTTGGGCGATAACCCTCCTTTAAT CTTGAGCGAGAAAACTAAAGCGATCATCACTTTTGCGTTGTGCGGGTTTGCTAACTTAAGTTCAGTCGCTATGCTCATTG GAGGGCTTGGCAGTTTAGTGCCTAAAAAGAAAGATCTCATTGTAAGGCTTGCTTTAAAAGCGGTGCTTGTAGGCACGCTT TCTAATTTCATGAGCGCGACTATCGCTGGGTTATTCATAGGGCTAAACGCTCATTAA Protein sequence : MIFSSLFSVVGMAVLFLIAWVFSSNKRAINYRTIISAFVIQVALGALALYVPLGREMLQGLASGIQSVIGYGYEGVRFLF GNLAPNAKGDQGIGGFIFAINVLAIIIFFASLISLLYYLKIMPLVINLIGGALQKCLGTSKAESMSAAANIFVAHTEAPL VIKPYLKSMSDSEIFAVMCVGMASVAGPVLAGYASMGIPLPYLIAASFMSAPGGLLFAKIIYPQNETISSHADASVEKHV NAIEAIANGASTGLNLALHVGAMLLAFVGMLALINGLLGVVGGFLGMEHLSLGLILGTLLKPLAFMLGIPWSQAGIAGEI IGIKIALNEFVGYMQFLPYLGDNPPLILSEKTKAIITFALCGFANLSSVAMLIGGLGSLVPKKKDLIVRLALKAVLVGTL SNFMSATIAGLFIGLNAH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 5e-49 | 41 |
