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Name : lldp2 (hp2017_0146) Accession : YP_005783122.1 Strain : Helicobacter pylori 2017 Genome accession: NC_017374 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 142713 - 144305 bp Length : 1593 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTGCCGATTTTGTT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAATTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGTCTTATCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTCCTTTATGGCTTTCTTTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATCTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATCGGATTTTGTTTTGGCTCATTTTTAGAAGGGGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATCACAGCGGCGATTTTAGTGGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGCGCTATGGCG AGCGCGGTAGGGGTGCCAGCGATTTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTT TTTTATTGTGTTTTTAATGGATGGTTTTAAGGGGATTAAAGAGACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCG CTGGTGCGCAATTTTTAAGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTCTCACTCGTTGCG ACAGCGCTCTTTTTGAAATTTTGGCAGCCTAAAACGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGTTTCATTCACTAAAACTAA CCATCATATCTGTAAAATCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTAGTTTTAGTCATTGTGCTATGGATACAGCCTT TTTTTAAAGCCTTGTTTGAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAGTTCAATAACATCAGCAACCAC ATCTTTAAAAGCCCGCCTTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAATTTTCCTGTGGTGTTTAAACTCCTCTTAATCAACAC GGTTGGCACTTCCATTTTTTTAGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCAGTGAGCGTCT TTGGCGAGACTTTAAAAGAAATGCGCTACCCCATTCTCACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCTTATGTGTCTAATTAC AGTGGGATTTCTTCCACTCTAGCCTTAGCGCTCACGCATACCGGTTTGGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATTGGGTG GGTAGGCGTGTTTTTAACCGGAAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTGTTTGGCTCTTTACAGCAGCTCACCGCCCAACGAT TGCAACTCCCTGAGATTTTAACCTTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGCATC GCTATCGCTTGCGCGGCGGTAGGATTAGCCGGAAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTT TGTAGCGATCATGGGAGTCGTGATCAGCGCGATCGCATATTGGATCCCTGAAGTGGTACCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKFKGYTAAFLSVVLSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVAFGAVGIPISAMA SAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFLSSNYLGPELPGIISALVSLVA TALFLKFWQPKTIFRSDGKAVSFTKTNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALFEKDGLLAFSNFYFEFNNISNH IFKSPPFVEANQSVNFPVVFKLLLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDAVSVFGETLKEMRYPILTIGLVLSFAYVSNY SGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLQLPEILTLTANTVGGTLGKMISPQSI AIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYWIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 5e-89 | 48 |
