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Name : lldp1 (hp2017_0145) Accession : YP_005783121.1 Strain : Helicobacter pylori 2017 Genome accession: NC_017374 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 141078 - 142664 bp Length : 1587 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGTTGAGCGCTTTAGTGGCTCTATCGCCTATTGCGCTCTT TTTTATCTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGCGCTTTCAATCCTTATTGCAT TATTTGTGTATAAAATGCCTGTTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGTTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AAGCTTGACGCCGGATCATCGCATTTTAGTGATTTTGATCGGGTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGCGCGATTGGTT TTGGAGGTCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTAGCTTTTGGTGCGGTGGGTATCCCTATCACGGCGATGGCTAGC GTGGTGGGTATTCCTGAATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGTAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGCATTCCTTTTTT CATCGTGTTTTTAATGGATGGCTTTAGAGGGATTAGAGAAACCTTTCCTGCAGTGGCCGTTACGGGCTTTAGCTTCGCTA TCGCGCAATTTTTAAGCTCTAATTATTTAGGGCCGCAGCTCCCGGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCCTTAGTCGCTACC ACTTTATTTTTAAAATTCTGGCAGCCCAAACACATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCAACGATCAGCACAGAAAAACA CCATATTTGTAAGGTGGTTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACGATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGT TTAAAGCGCTCTTTAAAGAAGGTGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTCAATTCTATCAGTCAAAAGATT TTTAAAACCGTTCCCATTGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTGGTGTTCAAACTCCCTTTGATTTTAACGACAGGCAC TTCCATTTTTTTAGCCGCCCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCTA CTTTAAAAGAAATGCGTTTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATG AGCGCTACGCTCGCTTTAGCGTTAGCGGATACCGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTGGTAGGTTGGCTTGGGGT GTTTTTAACCGGAAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGATCTTTACAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGC CTGAAGTGCTTTTCTTAGCGGCCAACACTTCCGGGGGCGTTGTGGGCAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCT TGCGCGGCGGTGGGGTTAGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTTAGATTTACAGTAAAATATTCTATCGCTTTGGCGATCAT TATGGGGATTGTCTTCACTCTTATCGCTTATGTTTTCCCCTTTATTATTCCAGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLALSILIALFVYKMPVQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILSLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVAFGAVGIPITAMAS VVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLSSNYLGPQLPDIISALVSLVAT TLFLKFWQPKHIFTSNGKEPTISTEKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFKEGGALAFSSFAFEFNSISQKI FKTVPIVTEATNFPVVFKLPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMRLPILTIGVVLAFAYVANYSGM SATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFLAANTSGGVVGKMISPQSIAIA CAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 6e-114 | 52 |
