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Name : HPIN_00680 (HPIN_00680) Accession : YP_005781478.1 Strain : Helicobacter pylori India7 Genome accession: NC_017372 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 140759 - 142414 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGCTAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGTTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTACCGATTTTGCT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATGCGGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCTCTGTCGGCCGTTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTAGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATCTTAAAAGAAAGCGT CCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGATCGTTTTTAGAAGGGGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCAGCGATTTTAGTGGGGTTGGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCTGGGTTATGT TTGATCGCTAACACCGCTCCTGTGGCTTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGCGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTCTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCCTGTTAGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTACTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACGGCTGTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGCGATGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGG TTTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGCTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTGGCTTTTTCCAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGCAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAAGCCGATCAAAGCGTGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTCTAGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCAGTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGCTATCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCTTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGATTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTAGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACAAGCTCTAATCTTTTATTTGGATCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCAGC AGTGGGGTTAGCCGGAAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATACCTGAAGTGGTGCCTATGGTAAAGTAG Protein sequence : MLEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVALSAVIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATAVFLKFWQPKAIFRSDGKAASFTKSNHHICKVYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEADQSVSFPVVFKFFLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDAVSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPMVK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-100 | 52 |
