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Name : HPGAM_00725 (HPGAM_00725) Accession : YP_005779876.1 Strain : Helicobacter pylori Gambia94/24 Genome accession: NC_017371 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 148273 - 149922 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTGGCTCTATCGCCTATTGCGCTCTT TTTTATCTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGTGCTGGGTTTTTAAGCTTAGCGCTTTCAATCCTTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCTGTTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGTTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AAGCTTGACGCCGGATCATCGCATTTTAGTGATTTTGATCGGGTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGCGCGATTGGTT TTGGAGGCCCAGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGGTTGTGTTTG ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATCACGGCGATGGCTAGCGTGGTGGGTATCCCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGCATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAAACCTTTCCTGCAGTGGCCGTTACGGGCTTTAGCTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATTTAGGGCCACAGCTCCCGGATATTATTTCAGCTTTAGTTTCATTGATTGCTACCACTTTATTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAACACATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCCACGATTAGCACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACGATTACGATTATTATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCACTCTTTAAA GAAGGTGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTCAATTCTATCAGTCAAAAGATTTTCAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTGGTGTTCAAACTCCCTTTGATTTTAACGACAGGTACTTCCATCTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCTACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTCGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACCGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTGGTAGGTTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGATCTTTACAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCCAACACTTCCGGGGGCGTTGTGGGCAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCAGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACAGTAAAATATTCTATCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATCGCTTATGTTTTCCCCTTTATTATTCCAGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLALSILIALFVYKMPVQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILSLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKHIFTSNGKEPTISTEKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKLPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 9e-128 | 55 |
