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Name : lldP-1 (HPF16_0149) Accession : YP_005778384.1 Strain : Helicobacter pylori F16 Genome accession: NC_017368 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 156806 - 158455 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTTTATGACCCATTAGGCAATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTGGCGCTATCGCCTATTGCACTCTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAGGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGTGCTTTCAATCATTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCTGCTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCT TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGCATTTTGGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCGGCT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTATGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGTGCGGTGGGTATTCCTATTACGGCAATGGCTAGCGTGGTGGGTATCCCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCTATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAAACTTTTCCTGCAGTGGCTGTTACCGGGTTTAGTTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCACAACTCCCGGACATTATTTCAGCCTTGGTGTCATTGATCGCTACCACTTTATTTTTAAAAGT CTGGCAGCCCAAGCGCATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCTGCAATCAGCACACAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGAGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTTAATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTCGTGTTTAAATTCCCTTTGATCCTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTATTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCTAATCTCTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACAGTAAAATATTCTATCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCGGTTACTCCTACCTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGNIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSIIIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKVWQPKRIFTSNGKEPAISTQKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-133 | 55 |
