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Name : virD2-1 (HPF57_0299) Accession : YP_005777013.1 Strain : Helicobacter pylori F57 Genome accession: NC_017367 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 301996 - 303906 bp Length : 1911 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCGTTAGAAAAAAGTTATAGTAAAAACTTTGAAAGCGATGAGCTTTTTGATTATGAGATCATCAAGCCCAAAAAGAC GATTAAGATACAATACACTTATGCTAAACGCTACTATAAAGAAGTAGAAAAGTTTGCTAAAAATTTAACTCAACTGACAC AAGAAGAATTTATGCGTTTAAGAGAACCACAAAAACAAGTGGTCATCAAAAACATAGGCAATATGACATGCCTGCATTCA AAAAGAGCGATGGATTATATCGCTAAACATGGTGAGCTAGTGAGAGATGAATTTTTTAGTAGAGTTAATTATAATGATAT AGCAGAGCAATGGAATGAGCAATTTGAAAAATTATTAGAAAATAAGAGCCGTGTTAAAAATTGTGCTTTACATCTAGTGT TTAGCATTAATGAAAATTGTAATGAAAAAAATTTAAAAGCTTTGGAATTAAGTGTGTATCAAACACTCACTAACACGCTA GGTTATGATTATCCTTTTATAATGAAACTCCATACACACCAAAACAATCCGCATGTGCATGTGATTATCAACAAAACTAA CAAAATTACCAATAAGCAACTACGCTTTAATTCTAAAGATAGCTGTAAAGAGTTTTACCACACACTAAGAGAAACATTTA AAGATTATTTATTTGCTAACTCAAAAGGCGAATTGCAATATTCTAACACGCCCAATATTTATAAGGCGATTAAAGGCATA GAAACAGAGTTAGATACGCTAGAAAAACAGGCTAGAAACAATAAGAGTTTTAGGCATGAAAACTATTTTTATAAAGTTTT GGGCAGTGCAACTTCTCAAATAGAAATCTTAAAAAAAAGAGAAGATGCCCTATCTGATCATTTAGATAGTCTAAAAAGTT TATTAGAAAAAACACATTGGGAAAAAGAAAAATTCACGCACCCAACAAATGAAAAGGAATTTAACCAACAACTTAAAGAA ATAAGATGGTTAAATAAAGAATCTTTAACTCCTAAAAACACTTATAAAAAAATTCAAAAATTAGCTGTCTGTAAAAGCCC TTTAATAAAAGATTATCTTTATACCATCAAAAAACTTTTTGCCACACAGAAAAAGATTATAGATTTAGAAAAAGATTATA AAGATTTAAAAGTTTTGAAAGAAGAATTTAGCAAAGATTTAGAAGTCGATTTATCCCATTCAAAAAAACGCTTTGAGCTT TACACTAAACTAAAAAGCATGAGCAAAGTTTTTACAAGTAAAAGTATTGTTAAAAATTTAGAAAAAATTGCTTTAGATTT TAAAAGCGATAGACATAGTATTTCGCAAAGAGCTTTTGAATTTTTTAGGTATATGAATTATCAAAATTTAAGCTTGACTG ATAAAGGCAATATGTTTTTAGTGGCTAAGTTTTTTAAAGATAGTGCTTTACTTGTTAATATTGCTAGGTTTGAAATGAAA AAGATAGATGATAGTGTTAAAAATTCTAACCCACAAGACAACTTACTAGGCAAACAAGTTTGGCTTAATCTTTTAGAACA TTTAAAAAGACTTGAAGAGGAAAACTATTGTTTTGCTAAGAAGCGAAAAGGATTCTTAGAAACTAGAGCTATGGAGCTAT CAAAAGATTTAAAATTTTTAAAACAAGCTCATGAAAATGATTTGCCCATTTATGAAAGAGGGCAAAGGGATAAAATCATT AAACGCTGTGAAAAATCGCTTAATTTTTTGCAGAAAGAATTACAATGCTTTAAAACCTTATTAAAAAGTGCAAGTATAGC TTTAGAAAACTTGCAAAGCAACCATCAAATCACAGCCGTTACACAAACCGCACAAGAAAACACAAACGCGCTCAAAAATA CCACTCAAGATTTTAACAAAACTACCAATGAACCCATAAACCCTAACAATAACCATGAAATGGATTTTTAA Protein sequence : MALEKSYSKNFESDELFDYEIIKPKKTIKIQYTYAKRYYKEVEKFAKNLTQLTQEEFMRLREPQKQVVIKNIGNMTCLHS KRAMDYIAKHGELVRDEFFSRVNYNDIAEQWNEQFEKLLENKSRVKNCALHLVFSINENCNEKNLKALELSVYQTLTNTL GYDYPFIMKLHTHQNNPHVHVIINKTNKITNKQLRFNSKDSCKEFYHTLRETFKDYLFANSKGELQYSNTPNIYKAIKGI ETELDTLEKQARNNKSFRHENYFYKVLGSATSQIEILKKREDALSDHLDSLKSLLEKTHWEKEKFTHPTNEKEFNQQLKE IRWLNKESLTPKNTYKKIQKLAVCKSPLIKDYLYTIKKLFATQKKIIDLEKDYKDLKVLKEEFSKDLEVDLSHSKKRFEL YTKLKSMSKVFTSKSIVKNLEKIALDFKSDRHSISQRAFEFFRYMNYQNLSLTDKGNMFLVAKFFKDSALLVNIARFEMK KIDDSVKNSNPQDNLLGKQVWLNLLEHLKRLEEENYCFAKKRKGFLETRAMELSKDLKFLKQAHENDLPIYERGQRDKII KRCEKSLNFLQKELQCFKTLLKSASIALENLQSNHQITAVTQTAQENTNALKNTTQDFNKTTNEPINPNNNHEMDF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virD2-1 | YP_002301087.1 | relaxase | Virulence | cag PAI | Protein | 0.0 | 92 |
