|
Name : virD4-1 (HPF57_0296) Accession : YP_005777010.1 Strain : Helicobacter pylori F57 Genome accession: NC_017367 Putative virulence/resistance : Virulence Product : conjugal transfer protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 299080 - 300837 bp Length : 1758 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGAGAAAAATTCAAAACATTAAGAGATAAATTTAAGGATAAAATCAGCAATTTATTCCATAAGCTTAATAGTGTTCA AAAAGATTATTACACTAAAACTCTCCCTAAGGCTTGCAAAGATGTCTTTACGCTAGGTTCTTCTAATAGTTATCCTATGA CCTTAAATTTTAACAAAGGTTTTTGTGTGGGGTTATATAAAGGTTTAAATTCACTTAAGCCTACTTATTATGATGCTCCG CTTTCTACTTTAATTATCGTTCCTCCTGGAAGTGGTAAAACCGCAGCTGTGGCTGTGCCTAATCTTTTAAATGTGCCTAG CTCTTATGTGGTGTTAGATATTAAAGGAGAGTTGTTTGATTTAACGGCTGGTTACAGACAACAAGTTCTAAAAAATAAAA TTTTTGTATTTGATCCCTTAGGAAATGATAACACGCTTAAATTCAATCCGTTTGATAAACGCATTGTAGAAAAATTAGAT TTTAACAGAAAGCGAAGGCTTGTAGATGAAGTGGGTAATACTATTTTTGCTGAAGATGTGGCAAATAAAGACCCTCATTG GACACAGCAAGCTAAAAATTTATTTGTATTTTACGCTCTTTATGATTTGTGTGTACATAACACTAGCACCTTTTTTGAAA TTGCAAGCGCTCCTATAAAAAATTATGTCCCCTTAATCAATCCACAAAGCCGATTTTACACTGAATTATATGAATGTCAA AGTAGCGATAATGGTTTTGTTAAAGAGAATGGGCGTTATATGGCTAAAGTAGAAAATGGCGTTAAGAAAATGAAACCTAA TGTCAATGTAGAATTGCTATGGTATAAACAAGTAGCCGAACAAGTCTATACTGACCCAGAAAATCCTAAAAATTATGATG GATCTGTGAATGATTTAGAAAAAGACGATCAAGGCAATATTATAATGAAAGAGGGTATGTTAGATCCTGTTATTAGAAAC GAAGCGAACAAATGGGCTAAGGCGAATGATAAAGAGTTTGCGAGCATTAAATCAGTTTATAGCCGTTTTATGCAAGTCTT TACAAGCTATCAAGTTAAAAGCGCTACAGATAGCATGAGTTTTGAATACGGGGATTTAAGGGCTGACAATATTTCACTCT ATATTAAAATCGCTCAAACAGATATTGACACGCTTGCACCGCTTATCCGTATCCTTTTGGAAAGTATTGCTAAAAATCTT TTATTGAAAGAGAGTAAGAAATTTGAAGAAAGGGTTTATCTGTTTTTAGATGAATTTGTGCGTTTTGGTAAATTGCCTTT TTTATTAGAAATGCCCGCATTAAGTAGGAGCTATGGTGTGGTTTTAATTTTTATCACGCAATCCAACGCTCTTATTGAAA AATATTATGGTAGAGAAGATGCAAGAATTGTTAATAGCACCGTGGCTTACAAAGTGATTTTCAAAATGGATGATTTAGAA TATGCTAAACAAATGAGCGAAGAAGTCGGTAAGATGACTAGAAAAACACGAAGCCACTCTACAGAAAAAGGACAACTCAT TACCGGAGGGACTTCTAGTATAGGTAAAGAGGCGTGGGACTTATTGAGTGCGCAAGATATTATGAATATTGATAAAGATG AAGTGATCATTTTAGTAAGTGGTCATAAGGCTAAACCCTTAAAATTAAAAGCGAATTATTATTTCAAAAACAAAGAATTA CTCTCTTTAACTGGGAAGTCAAGCCCAATGAAGAAGTGTTTTGATGGATTAAAAAAGTTTTGCATGAGCACTTTTTAA Protein sequence : MREKFKTLRDKFKDKISNLFHKLNSVQKDYYTKTLPKACKDVFTLGSSNSYPMTLNFNKGFCVGLYKGLNSLKPTYYDAP LSTLIIVPPGSGKTAAVAVPNLLNVPSSYVVLDIKGELFDLTAGYRQQVLKNKIFVFDPLGNDNTLKFNPFDKRIVEKLD FNRKRRLVDEVGNTIFAEDVANKDPHWTQQAKNLFVFYALYDLCVHNTSTFFEIASAPIKNYVPLINPQSRFYTELYECQ SSDNGFVKENGRYMAKVENGVKKMKPNVNVELLWYKQVAEQVYTDPENPKNYDGSVNDLEKDDQGNIIMKEGMLDPVIRN EANKWAKANDKEFASIKSVYSRFMQVFTSYQVKSATDSMSFEYGDLRADNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRILLESIAKNL LLKESKKFEERVYLFLDEFVRFGKLPFLLEMPALSRSYGVVLIFITQSNALIEKYYGREDARIVNSTVAYKVIFKMDDLE YAKQMSEEVGKMTRKTRSHSTEKGQLITGGTSSIGKEAWDLLSAQDIMNIDKDEVIILVSGHKAKPLKLKANYYFKNKEL LSLTGKSSPMKKCFDGLKKFCMSTF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virD4-1 | YP_002301090.1 | VirD4 coupling protein | Virulence | cag PAI | Protein | 0.0 | 98 |
