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Name : lldP-2 (HPF57_0161) Accession : YP_005776875.1 Strain : Helicobacter pylori F57 Genome accession: NC_017367 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 166964 - 168619 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGTTGAGTGCTCTTGTGGCCTTATTACCGATTTTATT GTTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATGCGGCGGCCTTTTTGAGCGTGGTTCTGTCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTATGGCTTATGGCCGATT GCATGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT CCAATCCATCACTTTAGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GGTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCAGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGC CTAATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCCATGGCGAGTGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTATCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTGGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTGGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGCGATTTTTAGAAGTGATGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTCTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGATAGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGCGCGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCAATGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTATAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGATTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAGCAGCTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTAGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC AGTGGGATTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATTAGCACGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVVLSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLNPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAIAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKAIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDSLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSASFPVVFKFFLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDAMSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISTIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-98 | 52 |
