Name : lldP-2 (HPF32_0149) Accession : YP_005775373.1 Strain : Helicobacter pylori F32 Genome accession: NC_017366 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 154992 - 156647 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGTTGAGCGCTCTTGTGGCTTTATTACCGATTTTATT GTTTTTCTTATCTTTAATTGTGTTCAAATTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCTCTGTCAGCCATTGTTG CGGTTTTGGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTTTTTATGGCTTCCTCTATGGCCTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT CCAGTCCATCACTTTAGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GTTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCGGCGATTTTAGTGGGCTTAGGCTTAAGCCCCTTATATGCTGCTGGATTGTGC CTAATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCCATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTATCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTGGGGCCAGAATTGCCTGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTGGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGTCATTTTTAGAAGCGATGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGA TCTGTGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAAACTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATTTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGCGCGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTGGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCACTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGCTTAGCTTTTACTTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGAAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAGCTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTAGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC AGTGGGATTGGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TTGTGATTAGCGTGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLIVFKFKGYTAAFLSVALSAIVAVLVYKMPVSMVGSSFFYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAIAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDGKAASFTKSNHHICKICVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKTLF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSASFPVVFKFFLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMHYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISVIAYLIPEVVPAIK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-93 | 52 |