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Name : nupC (HPF32_1114) Accession : YP_005776338.1 Strain : Helicobacter pylori F32 Genome accession: NC_017366 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyrimidine nucleoside transport protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1189055 - 1190311 bp Length : 1257 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGATTTTTAGCTCTCTTTTTAGTGTTGTAGGGATGGCGGTGCTTTTTCTTATTGCTTGGGTGTTTTCTAGCAATAAAAG GGCTATTAATTATCGCACGATTATTAGCGCGTTTGTGATTCAAGTGGCTTTAGGGGCGTTGGCTTTATATGTGCCTTTGG GTAGGGAAATGTTGCAAGGTTTAGCCAGTGGCATACAAAGCGTGATTGGCTACGGCTATGAGGGGGTGCGTTTTTTATTT GGGAGTCTCGCTCCAAACGCTAAGGGCGATCAAGGGATAGGAGGCTTTATCTTTGCGATCAATGTTTTAGCGATCATTAT CTTTTTTGCTAGCTTGATTTCACTTCTATACTATTTAAAAATCATGCCTTTAGTCATCAATCTCATTGGTGGGGCGTTGC AAAAATGCTTAGGCACTTCTAAAGCAGAAAGCATGAGCGCAGCGGCTAATATTTTTGTAGCACACACAGAAGCGCCCTTA GTCATTAAACCTTATTTGAAAAGCATGAGCGATTCAGAGATTTTTGCGGTCATGTGCGTGGGCATGGCTAGCGTTGCGGG GCCTGTGTTAGCCGGGTATGCGAGCATGGGCATTCCTTTGCCTTATCTAATAGCCGCTTCGTTTATGTCCGCTCCTGGGG GTTTGTTGTTCGCTAAAATCATTTACCCGCAAAACGAAACCATTTCTAGCCATGCAGATGTTTCTGCAGAAAAGCATGTC AATGCCATAGAAGCTATCGCTAATGGGGCAAGCACAGGGCTAAATTTAGCTTTGCATGTGGGAGCGATGCTTTTAGCCTT TGTGGGGATGCTCGCGCTCATTAACGGGCTTTTAGGGGTTGTAGGGGGGTTTTTAGGCATGGAGCATTTGTCTTTAGGGT TAATTTTAGGCACGCTCTTAAAACCCTTAGCTTTTATGCTAGGCATTCCTTGGAGTCAGGCCGGGATTGCTGGAGAAATC ATAGGCATTAAAATCGCGCTCAATGAATTTGTGGGCTATATGCAATTTTTGCCTTATTTGGGCGATAACCCTCCTTTAAT CTTGAGCGAGAAAACTAAAGCGATCATCACTTTTGCGTTGTGCGGGTTTGCTAATTTAAGCTCAGTCGCTATGCTCATTG GGGGGCTTGGCAGTTTAGTGCCTAAAAAGAAAGATCTCATTGTAAGGCTTGCTTTAAAAGCGGTGCTTGTAGGCACGCTT TCTAATTTCATGAGCGCAACTATCGCTGGGTTATTCATAGGGCTAAACGCTCATTAA Protein sequence : MIFSSLFSVVGMAVLFLIAWVFSSNKRAINYRTIISAFVIQVALGALALYVPLGREMLQGLASGIQSVIGYGYEGVRFLF GSLAPNAKGDQGIGGFIFAINVLAIIIFFASLISLLYYLKIMPLVINLIGGALQKCLGTSKAESMSAAANIFVAHTEAPL VIKPYLKSMSDSEIFAVMCVGMASVAGPVLAGYASMGIPLPYLIAASFMSAPGGLLFAKIIYPQNETISSHADVSAEKHV NAIEAIANGASTGLNLALHVGAMLLAFVGMLALINGLLGVVGGFLGMEHLSLGLILGTLLKPLAFMLGIPWSQAGIAGEI IGIKIALNEFVGYMQFLPYLGDNPPLILSEKTKAIITFALCGFANLSSVAMLIGGLGSLVPKKKDLIVRLALKAVLVGTL SNFMSATIAGLFIGLNAH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 9e-50 | 41 |
