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Name : nupC (HPF30_0211) Accession : YP_005773956.1 Strain : Helicobacter pylori F30 Genome accession: NC_017365 Putative virulence/resistance : Unknown Product : pyrimidine nucleoside transport protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 210866 - 212122 bp Length : 1257 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGATTTTTAGCTCTCTTTTTAGTGTTGTAGGGATGGCGGTGCTTTTTCTTATTGCTTGGGTGTTTTCTAGCAATAAAAG GGCTATTAATTATCGCACGATTATTAGCGCGTTTGTGATCCAGGTGGCTTTAGGGGCGTTGGCTTTATATGTGCCTTTGG GTAGGGAAATGCTGCAAGGTTTAGCCAGTGGTATACAAAGCGTGATCGGTTATGGCTATGAAGGGGTGCGTTTCTTATTT GGCAATCTCGCTCCAAACGCTAAGGGCGATCAAGGGATAGGAGGCTTTATCTTTGCTATTAATGTTTTAGCGATCATTAT CTTTTTTGCTAGCTTGATTTCACTCCTATACTATTTAAAAATCATGCCTTTAGTGATCAATCTCATCGGTGGGGCGTTGC AAAAATGCTTAGGCACTTCTAAAGCAGAAAGCATGAGCGCAGCGGCTAATATTTTTGTAGCGCACACAGAAGCGCCCTTA GTCATTAAACCTTATTTGAAAAGCATGAGCGATTCAGAGATTTTTGCGGTCATGTGCGTGGGCATGGCTAGCGTTGCGGG ACCTGTGTTAGCCGGGTATGCGAGCATGGGTATTCCTTTGCCTTATTTAATAGCCGCTTCGTTTATGTCCGCTCCTGGGG GTTTGTTGTTCGCTAAAATCATTTATCCGCAAAACGAAACCATTTCTAGCCATGCAGATGCTTCTGTAGAAAAGCATGTC AATGCCATAGAAGCTATCGCTAATGGGGCAAGCACAGGGCTAAATTTAGCTTTGCATGTGGGAGCGATGCTTTTAGCCTT TGTGGGGATGCTCGCGCTCATTAACGGGCTTTTAGGGGTTGTAGGGGGGTTTTTAGGCATGGAGCATTTGTCTTTAGGAT TGATTTTAGGCACGCTCTTAAAACCCTTAGCTTTTATGTTAGGCATTCCTTGGAGTCAGGCCGGGATTGCTGGAGAAATC ATAGGCATTAAAATCGCGCTCAATGAATTTGTGGGCTATATGCAATTTTTGCCTTATTTGGGCGATAACCCTCCTTTAAT CTTGAGCGAGAAAACTAAAGCGATCATCACTTTTGCGTTGTGCGGGTTTGCTAATTTAAGCTCAGTCGCTATGCTCATTG GAGGGCTTGGCAGTTTAGTGCCTAAAAAGAAAGATCTCATTGTGAGGCTTGCTTTAAAAGCGGTGCTTGTAGGCACGCTC TCTAATTTCATGAGCGCAACTATCGCTGGGTTATTCATAGGGCTAAACGCTCATTAA Protein sequence : MIFSSLFSVVGMAVLFLIAWVFSSNKRAINYRTIISAFVIQVALGALALYVPLGREMLQGLASGIQSVIGYGYEGVRFLF GNLAPNAKGDQGIGGFIFAINVLAIIIFFASLISLLYYLKIMPLVINLIGGALQKCLGTSKAESMSAAANIFVAHTEAPL VIKPYLKSMSDSEIFAVMCVGMASVAGPVLAGYASMGIPLPYLIAASFMSAPGGLLFAKIIYPQNETISSHADASVEKHV NAIEAIANGASTGLNLALHVGAMLLAFVGMLALINGLLGVVGGFLGMEHLSLGLILGTLLKPLAFMLGIPWSQAGIAGEI IGIKIALNEFVGYMQFLPYLGDNPPLILSEKTKAIITFALCGFANLSSVAMLIGGLGSLVPKKKDLIVRLALKAVLVGTL SNFMSATIAGLFIGLNAH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| yutK | YP_005163383.1 | putative sodium/nucleoside cotransporter | Not tested | Not named | Protein | 5e-49 | 41 |
