Gene Information

Name : lldP-1 (HPF30_1155)
Accession : YP_005774900.1
Strain : Helicobacter pylori F30
Genome accession: NC_017365
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : L-lactate permease
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1224711 - 1226360 bp
Length : 1650 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCAATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTGGCGCTATCGCCTATTACGCTCTT
TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAGGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGTGCTTTCAATCATTATTGCGT
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TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT
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ATACAAGTTCTAATCTCTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA
GCGGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT
AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTATTCAGATTTACAGTAAAATACTCTATCGCTTTGGCGATCATCATGGGGATTGTCTTCA
CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCAGTTATTCCTACCTAA

Protein sequence :
MEFYQVYDPLGNIWLSALVALSPITLFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSIIIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA
WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL
IANTAPVAFGAVGIPITAMAGVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAITQFLS
SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPAISTQKHHICKVIVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK
EGGALAFSSFAFEFNSISQKIFKTVPIVTEATHFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR
LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALGDTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL
AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVIPT

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcA CAE85240.1 GlcA protein, putative glycolate permease Not tested PAI V 536 Protein 7e-133 55