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Name : lldP-2 (HPF30_1154) Accession : YP_005774899.1 Strain : Helicobacter pylori F30 Genome accession: NC_017365 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1223007 - 1224662 bp Length : 1656 bp Strand : - Note : - DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGTTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTACCGATTTTGCT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATGTGGCGGCTTTTTTGAGCGTGGCTCTGTCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATTATCATTGCAGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCAGCGATTTTAGTGGGTTTAGGGTTAAGCCCCTTATATTCTGCCGGATTGTGC CTAATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTTTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTCCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTATCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTGGGACCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAACCTAAAGTGATTTTTAGAAGCGATGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAATAGTAACCATCATATCTGTAAGA TCTGTGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTTTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTGATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGCACGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTTCTTAATCAACACAGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTTTTAAGCTTTGCCTATGTGTCCAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGATTAGCTTTTACTTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAGCTCACCGCCCAACGGTTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTAGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC AGTGGGATTGGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTAATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYVAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYSAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAIAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDGKAASFTNSNHHICKICVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSDFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSTSFPVVFKFFLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-98 | 52 |
