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Name : HPLT_08359 (HPLT_08359) Accession : YP_005773739.1 Strain : Genome accession: NC_017363 Putative virulence/resistance : Virulence Product : conjugal transfer protein (traG) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 10071 - 12278 bp Length : 2208 bp Strand : - Note : COG3505 Type IV secretory pathway, VirD4 components DNA sequence : ATGCATAAATACCGCCCTTTTATTTACTTGTTAAGTATTGTATTAGCACCTATTGTATTTTTAATTGCGTTATTCTATTT AATGGACATGAAAAGCTTTCACTCTACCATTTTGCTCAGTCAAGAAATTTTTGCAAATTTAAAGCATTTTAAATCCTTTA AGCTCCAAATTCACTTGGCCTTTATCTACGCTCTTACTCCGTTGATTTTCACTATCTATTTGTTTTTTAACGGCGTGAAT ATGAATATTTATGGTAAGGCCAAATGGGCTAGTATTAAAGATATTGAAACCTACAAATACTCGCTTGTTTCTTGGGTTAA ATCCATTTGTGCTTTGTTTTTTCTGTCTTTATTCGCTCCATTAAGCATCTTTGCCATTTTCAAAAGGCACTTAATAATCT TTTGTAATGAAAGAGTGTTTGAAGATAAAACAGGTTTTAGGATTTTTGATTTCAAAACCTACTATAACACCTTAAAGATT ATAATAAGACAAATTTTTTACGAAAATTTTTTAAGCGGTTTGATGTTGATGCTTAAAAATCAAAAAACTTATTACCAAAA CTTATTGGAACACCTAAAAGGCTCTATGTTATTAGGTTTAAAAAAAGAAAATCCCATCACCTTAAATTTTGATAATGGAC TGCCTTTAGGCGTGTATAATGCGATGACTAGAGCTAAAGTAGTGTATTACAATTCTCCACTTTCTACTTTAATTGTTGCT CCTCCTGGTGCTGGTAAAACTTCTGCAGTAGCTATCCCAACACTTTTGAGCGTGCCTAGCTCTTGTGTGGTGTTAGACAT CAAAGGCGAATTGTGCGATTTAACGGCTGGATACAGACAAAAGCATTTTAAAAATAAGATTTTCATTTTCAATCCTTATG GAACTGATAATAGTTTATATTTCAATCCTTTTGACAAGAATATTGTTTCTAAAATGAGCTTTAGCGAAAAACGCCGTTTG GTTGAAGAGATTGCTAACACTATCTTTAACGAAAAATCTCAAGACCCTCATTGGGTAGAGCAAGCTAAGAATGTCTTTAC TTTCCATGCATTGTATGAGCTATGCGTCAATGAAGAGACCACCCTTTTTGAAATTGCTCTATCATTAGACAAAAACTACA CTCCTTTGATCAATAAAAGAGGGCGTTTCTATCCACAAGTTTTTAAATGTGTTGAAAAAAGCAAAGAGGAAGGTGGTGGT TTTGAGATGAATAATGATGGCACTTACATGTTAGATAAAGACGCTAATGGAAAACCTATACAAATTGCTGATGTTGATGT TAGGAAATTATGGTATCAACAAGTGGCTGAACAAATTTATATTGATATTGATAAAAAAGAAAACTATGATGGCACAATTA ACAAGTTAGAATTGAAGCTAGATAAAGACAAAATGCCTATTTTAGAAGAAGGCATGTTAGATCCTTTCATGCGTTCTTAT GCAAACAGATGGGCGAATGCTAACGACAAGGAATTTAGCTCTATCAAATCTACTTTTGACAGATTTATGCAAGTATTCAC GGATTATAGAGTTAAAAGAGCGACCTCTAAAATGAGTTTTGAATATGAAGATCTAAGAAAAGACAATATCACTCTTTACA TTAAAATAGCTCAAACAGATATTGACATTATTGCTCCATTGATTAGAGTGCTTTTAGAAAGCATGGGCAAAAACTTACTT TTAAAAGAAAGCAAAAGATTTGATGAAAGAATTTATTTCATACTGGACGAGTTTGTTAGATTTGGAAAACTCAGTTTCTT GTTAGAAATGCCAGCATTGAGTAGAAGTTATGGAGTGGTATTACTTTACATCACTCAAAGCAATGCAATGATTGAAAAAT ACTATGGCAAAGAAGACGCTAAGATTTTAAACGGCACGGTGAATTATAGGGTCCTTTTTAGAATGAACGATTATGAATAT GCACAACAAATTTCTAATGAAATCGGCAAGATGACTAGAAAAACACGAAGCCACTCTACAGAAAAAGGACAACTCATTAT GGGAGGGACTTCTAGTATAGGAAAAGAGGCGTGGGATTTGGTCAGTCCGCAAGATATTCTAAATATTGATAAAGATGAAG TGATTATATTAGTAGGCGGTCATCAAGCCAAACCTTTAAAACTAAAAGCGAATTACTATTTTAGAAATCCCAAAATGACA AAATGTTTGAATTGGGAAGTCAAGCCTAATGAAAAAGTGTTTTCCTAA Protein sequence : MHKYRPFIYLLSIVLAPIVFLIALFYLMDMKSFHSTILLSQEIFANLKHFKSFKLQIHLAFIYALTPLIFTIYLFFNGVN MNIYGKAKWASIKDIETYKYSLVSWVKSICALFFLSLFAPLSIFAIFKRHLIIFCNERVFEDKTGFRIFDFKTYYNTLKI IIRQIFYENFLSGLMLMLKNQKTYYQNLLEHLKGSMLLGLKKENPITLNFDNGLPLGVYNAMTRAKVVYYNSPLSTLIVA PPGAGKTSAVAIPTLLSVPSSCVVLDIKGELCDLTAGYRQKHFKNKIFIFNPYGTDNSLYFNPFDKNIVSKMSFSEKRRL VEEIANTIFNEKSQDPHWVEQAKNVFTFHALYELCVNEETTLFEIALSLDKNYTPLINKRGRFYPQVFKCVEKSKEEGGG FEMNNDGTYMLDKDANGKPIQIADVDVRKLWYQQVAEQIYIDIDKKENYDGTINKLELKLDKDKMPILEEGMLDPFMRSY ANRWANANDKEFSSIKSTFDRFMQVFTDYRVKRATSKMSFEYEDLRKDNITLYIKIAQTDIDIIAPLIRVLLESMGKNLL LKESKRFDERIYFILDEFVRFGKLSFLLEMPALSRSYGVVLLYITQSNAMIEKYYGKEDAKILNGTVNYRVLFRMNDYEY AQQISNEIGKMTRKTRSHSTEKGQLIMGGTSSIGKEAWDLVSPQDILNIDKDEVIILVGGHQAKPLKLKANYYFRNPKMT KCLNWEVKPNEKVFS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virD4-1 | YP_002301090.1 | VirD4 coupling protein | Virulence | cag PAI | Protein | 3e-173 | 64 |
