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Name : HPSA_07700 (HPSA_07700) Accession : YP_005772092.1 Strain : Helicobacter pylori SouthAfrica7 Genome accession: NC_017361 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 1565098 - 1566360 bp Length : 1263 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGTCGCTCCACTACTTGCTCTGCCCTTTCTTTCTAACCCTTTAGTGCTTGGTGCTTTAGCTGTCATAGGAGTGGGTGC TTACTTGTATTCCAACAAGCAAGATTCTTTAGTTGTGCAAGCAGATGGGCTTTATAGTGAAATTCTTGGGTTTTTTATTT CGTTTTCTAGTAAGATCTTGAAAGGAATTGGTGAGCCTTTAGCTGGTGTTATCCAACCTTTTGGTATGGTCTTAGGAGTG CTTTTAATCCTTTTGTATTCTTTTAAACGCTATCAAAACAACGATTTATTTGAAATAAAAACCTTTTTAATGCTTTTTGT GTTTGTAGGATACCTTTCTTTGTACCATTATGCTTTTAAATCTGATGGTTCTAGTAACGGTAATGGTCGCTCTAGTTTTG CCTTTCAAAATCATGTAACAGAAATTTTTGACACGCCTGCTAACTTGCTAAATGCCGGAATTTCTAATGTGGTTAAGGAA TATCAAACAAATAGTGTAGGAGAATATAAGAAGATAGACACGCACCACAGCATCACTAACGCTAATATTTCATTCCATGT CAGACAAATTTTAACGAGTTTGAATAAACTATATGAAGACTTCAAAATTAATAATGGACTATCGCCAAAAACCATTATTG CAGCTGTTTTATTATTAGTTATTTTAGGATTAGAATTATTTTTATTATTCAAAGTTTTCTGTTATGTTTTTATGACTTAT TTAGAAAAAATTATTTATTTGTCTTTGGTTATTTTCATGCTACCGCTAGGGTTTTTTCAGCAGACTAGAGGTTTTTTAGT ATCTTATGTGAAAAAAATTATTTCATTGACTTTTTACATGCCTTTGTTGTTGCTATTAGTGTTATTCAACTCTTTTGCAT TACAATACGCAATCAAAGTGGGATGGAGCAATGAAATAGTGGCTAAATTTGGCATTATTGTAGCAATAGGAATTTCACTG ACTTTCATTCAAAAAGTCCCCGAAATGATTAACGCTATCTTTGGCACACAAGGTGGTCTAACGGATGCTAAAAGCTTTAT ATATCAAGGTGTGCAAATAGCTAGTGCTGGAGCTGGAGTCATAGCTGGAAGTCTTAAGAGTGTGGGTCATTCAGCATTTG GTAGAACGCTAGAAGCTTACAAAGACACAAAATCTACGATAAACAGCACCACGGCTAACATGAGAGACATGCCAGGACAT CCTGGTGTTAGAGTGGGTGTGGAGACGATTGAACTTCCCAAGTCTCATAGAGCTAGCAAATGA Protein sequence : MVAPLLALPFLSNPLVLGALAVIGVGAYLYSNKQDSLVVQADGLYSEILGFFISFSSKILKGIGEPLAGVIQPFGMVLGV LLILLYSFKRYQNNDLFEIKTFLMLFVFVGYLSLYHYAFKSDGSSNGNGRSSFAFQNHVTEIFDTPANLLNAGISNVVKE YQTNSVGEYKKIDTHHSITNANISFHVRQILTSLNKLYEDFKINNGLSPKTIIAAVLLLVILGLELFLLFKVFCYVFMTY LEKIIYLSLVIFMLPLGFFQQTRGFLVSYVKKIISLTFYMPLLLLLVLFNSFALQYAIKVGWSNEIVAKFGIIVAIGISL TFIQKVPEMINAIFGTQGGLTDAKSFIYQGVQIASAGAGVIAGSLKSVGHSAFGRTLEAYKDTKSTINSTTANMRDMPGH PGVRVGVETIELPKSHRASK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virb6 | YP_002301075.1 | VirB6 type IV secretion protein | Virulence | cag PAI | Protein | 1e-142 | 94 |
