|
Name : HPSA_00710 (HPSA_00710) Accession : YP_005770773.1 Strain : Helicobacter pylori SouthAfrica7 Genome accession: NC_017361 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 145631 - 147286 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAACATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTGCCGATTTTGTT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAGCTCAAAGGTTATGTAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCCTTATCAGCCTTTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTAGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTTCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATCATTGCGGCAATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATCTTAAAAGAAAGCGT CCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGCGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATCACAGCGGCGATTTTAGTGGGCTTGGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCCGGGTTATGT TTAATCGCTAACACCGCTCCTGTGGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGCGCTATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATCTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTCATCGTGTTTTTAA TGGATGGTTTTAAAGGGATTAAAGAGACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCAGCTTTTTCTTTCGCTGGCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTCTCACTCGTTGCGACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAACGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGTTTCATTCACTAAAACTAACCATCATATCTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTAGTTTTAGTCATTGTGCTATGGATACAGCCTTTTTTTAAAGCCTTGTTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAGTTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAATTTTCCTGTGGTATTTAAACTCCTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTGGCCGCTCTTGTTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCAGTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTCACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCTTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACGCATACCGGTTTGGCTTTTACTTTTTTCTCGCCCTTGATTGGGTGGGTAGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTGTTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGGTT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGAGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC GGTAGGGTTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATCAGCGCGATCGCGTATTGGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYVAAFLSVALSAFIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKTIFRSDGKAVSFTKTNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVNFPVVFKLLLINTVGTSIFLAALVSMLVLRVRVSDAVSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEV LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYWIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 7e-101 | 52 |
