|
Name : lctP2 (HMPREF4655_20384) Accession : YP_005769517.1 Strain : Helicobacter pylori 35A Genome accession: NC_017360 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 374020 - 375675 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG: COG1620; Pfam: PF02652; InterPro: IPR003804 DNA sequence : GTGCTAGAATTTCATCAAATTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGTTGAGTGCTTTTGTGGCCTTATTACCGATTTTATT GTTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATGCGGCGGCCTTTTTGAGCGTGGTTCTGTCAGCCATTATTG CGGTTTTGGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT CCAGTCCATCACTTTAGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GTTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCAGCGATTTTAGTGGGTTTAGGGTTAAGCCCTTTATATTCTGCTGGATTGTGC CTAATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATTCCTATAAGTGCGATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGCGCACAATTTTTA AGCTCTAATTACTTGGGACCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGTGATTTTTAGAAGCGATGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATCTGTAAGA TCTATGTTGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTCTGGTTTTAGTGATTGTTTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGCGCGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTCTTTAATCAACACAGTTGGCACTTCCATTT TTTTGGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTTTTTGGCGAGACTTTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAT TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGATTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGAAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAGCAGCTCACCGCCCAACGGTTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTAGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC GGTGGGATTAGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MLEFHQIYDPLGNIWLSAFVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVVLSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYSAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSASFPVVFKFSLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSILALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-112 | 51 |
