Name : HPSAT_00665 (HPSAT_00665) Accession : YP_005767795.1 Strain : Helicobacter pylori Sat464 Genome accession: NC_017359 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 133117 - 134766 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCAATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTGGCGCTATCGCCTATTGTGCTCTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGTGCTTTCAATCATTATTGCGT TGTTTGTGTATAAAATGCCTGCTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCT TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCGGCT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATTCCTATTACGGCAATGGCTAGCGTGGTGGGTATCTCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAAAGGGATTAGAGAGACTTTTCCTGCAGTGGCCGTTACCGGGTTTAGTTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGACCGCAACTCCCGGATATTATTTCAGCCTTAGTGTCATTGATCGCTACCACTTTGTTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAACGCATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCCGCAATCAGCACAGAAAAACACCATATTTGTAAAGTGA TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTCAATTCTATCAGTCAAAAGGTTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTCGTGTTCAAATTCCCTCTAATTCTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCTACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCCACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGTG ATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACAGTAAAATATTCTATCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCGGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGNIWLSALVALSPIVLFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSIIIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGISELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFKGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPAISTEKHHICKVIVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKVFKTVPIVTEATNFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-134 | 56 |