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Name : HPCU_00660 (HPCU_00660) Accession : YP_005766226.1 Strain : Helicobacter pylori Cuz20 Genome accession: NC_017358 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 133733 - 135382 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCAATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTGGCGCTATCGCCTATTGCGCTTTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGTGCTTTCAATCATTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCTGCTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCT TGGATTGTGATTGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCGGCT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCGGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATTCCTATTACGGCAATGGCTAGCGTGGTGGGTATCTCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAAAGGGATTAGAGAGACTTTTCCTGCAGTGGCTGTTACCGGGTTTAGTTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCGCAACTCCCGGATATTATTTCAGCCTTAGTGTCATTGATCGCTACCACTTTGTTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAACGCATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCCGCAATCAGTACAGAAAAACACCATATTTGTAAAGTGA TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGTTTTGTGTTTGAATTCAATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTCGTGTTCAAATTCCCCTTGATTCTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCTACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCCACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACAGTAAAATACTCTATCGCTTTGGCGATTATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCGGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGNIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSIIIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGISELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFKGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPAISTEKHHICKVIVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFVFEFNSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-133 | 56 |
