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Name : lldp_2 (hp908_0150) Accession : YP_005764655.1 Strain : Helicobacter pylori 908 Genome accession: NC_017357 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 143737 - 145389 bp Length : 1653 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTGCCGATTTTGTT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAATTCAAAGGTTATACAGCGGCCTTTTTGAGCGTGGTCTTATCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGTGGGTTCAAGCTTCCTTTATGGCTTTCTTTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATCTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATCGGATTTTGTTTTGGCTCATTTTTAGAAGGGGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCACAGCGGCGATTTTAGTGGGCTTGGGGTTAAGCCCTTTATACGCTGCCGGGTTATGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTGGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGCGCTATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCCAGC GATTTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTAGTGCCGTTTTTTATTGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAAGGGGATTAAAGAGACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGTGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATTTAGGGCCAGAATTGCCCGGCATTATTTCAGCCCTTGTCTCACTCGTTGCGACAGCGCTCTTTTTGAAATT TTGGCAGCCTAAAACGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGTTTCATTCACTAAAACTAACCATCATATCTGTAAAATCT ATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTAGTTTTAGTCATTGTGCTATGGATACAGCCTTTTTTTAAAGCCTTGTTTGAA AAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAGTTCAATAACATCAGCAACCACATCTTTAAAAGCCCGCCTTT TGTAGAAGCCAATCAAAGCGTGAATTTTCCTGTGGTGTTTAAACTCCTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTTTTT TAGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCAGTGAGCGTCTTTGGCGAGACTTTAAAAGAA ATGCGCTACCCCATTCTCACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCTTATGTGTCTAATTACAGTGGGATTTCTTCCACTCT AGCCTTAGCGCTCACGCATACCGGTTTGGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATTGGGTGGGTAGGCGTGTTTTTAACCG GAAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTGTTTGGCTCTTTACAGCAGCTCACCGCCCAACGATTGCAACTCCCTGAGATTTTA ACCTTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGT AGGATTAGCCGGAAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAGTCG TGATCAGCGCGATCGCATATTGGATCCCTGAAGTGGTACCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKFKGYTAAFLSVVLSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIATAAILVGLGLSPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLLVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFLS SNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKTIFRSDGKAVSFTKTNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALFE KDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVEANQSVNFPVVFKLLLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDAVSVFGETLKE MRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLQLPEIL TLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYWIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 6e-101 | 51 |
