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Name : lldp_1 (hp908_0149) Accession : YP_005764654.1 Strain : Helicobacter pylori 908 Genome accession: NC_017357 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 142120 - 143688 bp Length : 1569 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGTTGAGCGCTTTAGTGGCTCTATCGCCTATTGCGCTCTT TTTTATCTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGCGCTTTCAATCCTTATTGCAT TATTTGTGTATAAAATGCCTGTTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGTTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCA TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AAGCTTGACGCCGGATCATCGCATTTTAGTGATTTTGATCGGGTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGCGCGATTGGTT TTGGAGGTCCGGTAGCGATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGTGCGGTGGGTATCCCTATCACGGCGATGGCTAGC GTGGTGGGTATTCCTGAATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGTAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGCATTCCTTTTTT CATCGTGTTTTTAATGGATGGCTTTAGAGGGATTAGAGAAACCTTTCCTGCAGTGGCCGTTACGGGCTTTAGCTTCGCTA TTGCGCAATTTTTAAGCTCTAATTATTTAGGGCCGCAGCTCCCGGATATTATTTCAGCTTTAGTGTCCTTAGTCGCTACC ACTTTATTTTTAAAATTCTGGCAGCCCAAACACATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCAACGATCAGCACAGAAAAACA CCATATTTGTAAGGTGGTTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACGATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGT TTAAAGCGCTCTTTAAAGAAGGTGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTCAATTCTATCAGTCAAAAGATT TTTAAAACCGTTCCCATTGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTGGTGTTCAAACTCCCTTTGATTTTAACGACAGGCAC TTCCATTTTTTTAGCCGCCCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCTA CTTTAAAAGAAATGCGTTTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATG AGCGCTACGCTCGCTTTAGCGTTAGCGGATACCGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTGGTAGGTTGGCTTGGGGA TACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGATCTTTACAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTAG CGGCCAACACTTCCGGGGGCGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGTTA GTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTTAGATTTACAGTAAAATATTCTATCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTGTCTTCAC TCTTATCGCTTATGTTTTCCCCTTTATTATTCCAGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLALSILIALFVYKMPVQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILSLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAIANTAPVAFGAVGIPITAMAS VVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLSSNYLGPQLPDIISALVSLVAT TLFLKFWQPKHIFTSNGKEPTISTEKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFKEGGALAFSSFAFEFNSISQKI FKTVPIVTEATNFPVVFKLPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMRLPILTIGVVLAFAYVANYSGM SATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFLAANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGL VGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 7e-110 | 51 |
