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Name : hp908_1012 (hp908_1012) Accession : YP_005765509.1 Strain : Helicobacter pylori 908 Genome accession: NC_017357 Putative virulence/resistance : Virulence Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 988403 - 990145 bp Length : 1743 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGAGAAAAGTCCAAAACATTAAAAGATAGATTTAAAGATAAAACTAGCAATTTATTCCATAAGCTTAATAGCATTCA AAAAGATTATTACACCAAAATGCTTCCTAAGGCTTGCAAAGATGTCTTTACGCTAGGTTCTTCTAAAAGTTATCCTATGA CTTTAAATTTTAACAAAGGTTTTTGTGTGGGGCTATATAAAGGTTTAAATTCGCTTAAGCCTACTTATTATGATGCTCCG CTTTCTACTTTAATTATCGCTCCTCCTGGAAGTGGTAAAACCGCAGCTGTGGCTGTTCCTAATCTTTTAAATGTGCCTAG CTCTTGTGTGGTGTTAGATATTAAAGGGGAGTTATTTGATTTGACAGCTGGTTACAGACAACAAGTTCTAAAAAATAAAA TTTTTGTATTTGATCCCTTAGGAAATGATAACACGCTTAAATTCAATCCGTTTGACAAACGCATTGTAGAAAAATTAGAT TTTAACCTAAAGCGAAGGCTTGTAGATGAAGTGGGTAATACTATTTTTGTTGAAGATGGGGCAAATAAAGACCCTCATTG GACACAGCAAGCTAAAAACTTATTTGTCTTTTACGCTCTTTATGATTTGTGCGTGCATAACACCAGCACCTTTTTTGAAA TTGCAAGCGCTCCTATAAAAAATTATGTCCCCTTAATCAATCCACAAAGCCGATTTTATACTGAATTATATGAATGTCAA AGTAGCGATAATGGTTTTGTTAAAGAGAATGGTCGTTATATGGCTAAAGTAGAAAATGGCGTTAAAAAAATGAAACCTAA TGTCAATGTGGAATTGCTATGGTATAAACAAGTAGCCGAACAAGTCTATACTGAAAATCCTAAAAATTATGATGGCTCTG TGAATCATTTAGAAAAAGACGATCAAGGCAATATTATAATGAAAGAGGGTATGTTAGATCCTATTATTAGAAACGAAGCG AACAAATGGGCTAAAGCAAATGACAAAGAGTTTGCGAGCATTAAATCAGTTTATAGCCGTTTTATGCAAGTCTTTACAAG CTATCAAGTTAAAAGCGCTACAGATAGCATGAGTTTTGAATACGAGGATTTAAGGACTGATAATATTTCACTCTACATTA AAATCGCTCAAACAGATATTGACACGCTCGCACCGCTTATCCGTATCCTTTTGGAAAGTATTGCTAAAAATCTTTTATTG AAAGAGAGTAAGAAATTTGAAGAAAGGGTTTATCTCTTTTTAGATGAATTTGTGCGTTTTGGTAAATTGCCTTTTTTGTT AGAAATGCCCGCATTAAGTAAGAGCTATGGTGTGGTTTTAATTTTTATTACACAATCCAACGCTCTTATTGAAAAATATT ACGGCAAAGAAGACGCAAGAATTGTTAATAGCACCGTGGCTTACAAAGTAATTTTCAAAATGGATGATTTAGAATACGCT AAGCAAGTGAGCGAAGAAATCGGCAAGATGACTAGAAAAACACGAAGCCATTCTACAGAAAAAGGACAGCTCATTATGGG AGGGACTTCTAGTATAAGTAAAGAAGCGTGGGATTTATTGAGCGCGCAAGACATCATGAATATTGATAAAGATGAAGTGA TCATTTTAGTGAGCGGTCATAAAGCTAAACCCTTAAAATTAAAAGCGAATTATTATTTCAAAAACAAAGAATTATTCTCT CGTATTAATTGGGAAGTCAAGCCCAATGAAGAAGTGTTTGATGCGTTAAAAAAGGTTGTATGA Protein sequence : MREKSKTLKDRFKDKTSNLFHKLNSIQKDYYTKMLPKACKDVFTLGSSKSYPMTLNFNKGFCVGLYKGLNSLKPTYYDAP LSTLIIAPPGSGKTAAVAVPNLLNVPSSCVVLDIKGELFDLTAGYRQQVLKNKIFVFDPLGNDNTLKFNPFDKRIVEKLD FNLKRRLVDEVGNTIFVEDGANKDPHWTQQAKNLFVFYALYDLCVHNTSTFFEIASAPIKNYVPLINPQSRFYTELYECQ SSDNGFVKENGRYMAKVENGVKKMKPNVNVELLWYKQVAEQVYTENPKNYDGSVNHLEKDDQGNIIMKEGMLDPIIRNEA NKWAKANDKEFASIKSVYSRFMQVFTSYQVKSATDSMSFEYEDLRTDNISLYIKIAQTDIDTLAPLIRILLESIAKNLLL KESKKFEERVYLFLDEFVRFGKLPFLLEMPALSKSYGVVLIFITQSNALIEKYYGKEDARIVNSTVAYKVIFKMDDLEYA KQVSEEIGKMTRKTRSHSTEKGQLIMGGTSSISKEAWDLLSAQDIMNIDKDEVIILVSGHKAKPLKLKANYYFKNKELFS RINWEVKPNEEVFDALKKVV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| virD4-1 | YP_002301090.1 | VirD4 coupling protein | Virulence | cag PAI | Protein | 0.0 | 97 |
