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Name : HPV225_0155 (HPV225_0155) Accession : YP_005763101.1 Strain : Helicobacter pylori v225d Genome accession: NC_017355 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate transport Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 141610 - 143265 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGTTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTACCGATTTTGCT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATGCGGCGGCCTTTTTGAGCGTGGCTCTGTCAGCCATTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTCAGCATGGTAGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTTCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCATGGATTATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCGGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAGCCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGC CTAATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCCTTTGGCGCGGTGGGTATCCCTATAAGTGCCATGGCGAGCGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTAATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATAGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGCGTGCAATTTTTA AGCTCTAATTACTTGGGGCCAGAATTGCCTGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTTGTTGCAACAGCGCTCTTTTTGAA ATTTTGGCAGCCTAAAGTGATTTTTAGAAGCGACAACAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTGACCATCATATCTGTAAGA TCTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGTTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGTCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGCGCGAATTTTCCGGTGGTATTTAAATTTTCTTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTAGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTCTTTGGCGAAACTCTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATTGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC TCTAGCCTTAGCGCTCACCCATACAGGCTTAGCTTTTACTTTTTTCTCGCCCTTGATTGGGTGGGTAGGCGTGTTTTTAA CTGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAGCTCACCGCCCAACGATTGCATCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTGGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC AGTGGGATTGGCCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTTAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TTGTGATTAGTGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVALSAIIAVLVYKMPVSMVGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGVQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDNKAASFTKSDHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLVFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSANFPVVFKFSLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLAGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-104 | 52 |
