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Name : HPV225_0154 (HPV225_0154) Accession : YP_005763100.1 Strain : Helicobacter pylori v225d Genome accession: NC_017355 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate transport Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 139912 - 141561 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCAATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTGGCGCTATCGCCTATTGCGCTTTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAAGGGTATAGCGCTGGGTTTTTAAGCTTAGTGCTTTCAATCATTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCTGCTCAAATGGTGAGCGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTGTGGCCGATCGCT TGGATTGTGATTGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCGGCT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCAGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGCCTA ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGCGCGGTGGGTATTCCTATTACCGCAATGGCTAGTGTGGTGGGTATCTCTGA ATTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAAAGGGATTAGAGAGACTTTTCCTGCAGTGGCCGTTACCGGGTTTAGTTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCGCAACTCCCGGATATTATTTCAGCCTTAGTGTCATTGATCGCTACCACTTTGTTTTTAAAATT CTGGCAGCCCAAACGCATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCCGCAATCAGCACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTATTACGATTATCATATGGACGCAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTCAATTCTATCAGTCAAAAGATTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTCGTGTTTAAATTCCCCTTGATTCTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCTACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACCATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGTGGCATGAGCGCCACGCTCGCTTT AGCGTTAGCGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCGGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCGGCGGTGGGGCT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACAGTAAAATACTCTATCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTGTCTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCGGTTACTCCTACTTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGNIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSIIIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGISELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFKGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPAISTEKHHICKVVVAWMPFVLLTITIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKIFKTVPIVTEATNFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALADTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-133 | 55 |
