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Name : HPKB_0148 (HPKB_0148) Accession : YP_005761685.1 Strain : Helicobacter pylori 52 Genome accession: NC_017354 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease (lctP) Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 153288 - 154937 bp Length : 1650 bp Strand : + Note : Consensus COG by CONSORF: COG1620 DNA sequence : ATGGAATTTTATCAAGTCTATGACCCATTAGGCCATATTTGGCTGAGCGCTTTAGTCGCACTTTCGCCTATCGCTCTCTT TTTTATTTCTCTTATTGTCTTTAAACTTAAGGGGTATAGTGCTGGGTTTTTAAGCTTAGTGCTTTCAATCATTATTGCGT TATTTGTGTATAAAATGCCCGCTCAAATGGTGAGTGCGAGTTTTTTCTATGGCTTTCTTTATGGCTTGTGGCCAATCGCT TGGATTGTGATCGCTGCGATTTTTCTTTACAACCTTTCAGTGAAATCCGGGTATTTTGAGATTTTAAAAGAAAGCATTTT AACCCTAACGCCGGATCACCGCATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCGGCT TTGGAGGCCCGGTAGCGATCACAGCAGCGATTTTAGTCGGCCTTGGGCTAAACCCCTTATACGCTGCCGGATTGTGCCTG ATCGCTAACACCGCTCCTGTAGCTTTTGGTGCGGTGGGTATTCCTATTACGGCGATGGCTAGCGTGGTGGGTATCCCTGA GTTAGAGATTTCTCAAATGGTGGGCAGGGTGTTACCCATTTTTTCCATTGGTATTCCTTTTTTCATCGTGTTTTTAATGG ATGGTTTTAGAGGGATTAGAGAGACTTTTCCTGCGGTGGCTGTTACCGGGTTTAGTTTCGCTATCGCGCAATTTTTAAGC TCTAATTATCTAGGGCCACAACTCCCGGATATCATTTCAGCTTTAGTGTCATTGATCGCTACCACTTTATTTTTAAAATT CTGGCAACCCAAGCGCATTTTCACCAGCAATGGCAAAGAGCCCACGATAAGCACAGAAAAACACCATATTTGTAAGGTGG TTGTGGCGTGGATGCCTTTTGTGTTGCTCACTCTTACGATTATCATATGGACACAACCCTGGTTTAAAGCGCTCTTTAAA GAAGGCGGGGCTTTGGCGTTTTCTAGCTTTGCGTTTGAATTTAATTCTATCAGTCAAAAGGTTTTTAAAACCGTTCCCAT TGTTACTGAAGCGACCAATTTTCCTGTCGTGTTCAAATTCCCTTTGATTTTAACGACAGGCACTTCCATTTTTTTAGCCG CTCTTTTAAGCGTGTTTTTGTTGCGCGTGAAAATCAGCGATGCGATAGGGGTGTTTGGGGCCACTTTAAAAGAAATGCGT TTGCCGATTTTAACTATTGGCGTGGTTTTAGCGTTTGCGTATGTGGCTAATTATAGCGGCATGAGCGCTACGCTCGCTTT AGCGTTAGGGGATACTGGGCATGTTTTCACTTTCTTTTCGCCTGTTGTAGGCTGGCTTGGGGTGTTTTTAACCGGAAGCG ATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTGCAAATGCTCATCGCTACACAGCTTGGCTTGCCTGAAGTGCTTTTCTTA GCAGCAAACACTTCAGGGGGTGTTGTGGGTAAAATGATAAGCCCTCAAAGTATCGCTATCGCTTGCGCAGCGGTGGGGTT AGTGGGGAAAGAGAGCGAATTGTTCAGATTTACAGTAAAATATTCTATCGCTTTGGCGATCATTATGGGGATTGTTTTCA CTCTTATTGCTTATGTCTTCCCCTTTATTATCCCGGTTACTCCTACCTAA Protein sequence : MEFYQVYDPLGHIWLSALVALSPIALFFISLIVFKLKGYSAGFLSLVLSIIIALFVYKMPAQMVSASFFYGFLYGLWPIA WIVIAAIFLYNLSVKSGYFEILKESILTLTPDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAAILVGLGLNPLYAAGLCL IANTAPVAFGAVGIPITAMASVVGIPELEISQMVGRVLPIFSIGIPFFIVFLMDGFRGIRETFPAVAVTGFSFAIAQFLS SNYLGPQLPDIISALVSLIATTLFLKFWQPKRIFTSNGKEPTISTEKHHICKVVVAWMPFVLLTLTIIIWTQPWFKALFK EGGALAFSSFAFEFNSISQKVFKTVPIVTEATNFPVVFKFPLILTTGTSIFLAALLSVFLLRVKISDAIGVFGATLKEMR LPILTIGVVLAFAYVANYSGMSATLALALGDTGHVFTFFSPVVGWLGVFLTGSDTSSNLLFGSLQMLIATQLGLPEVLFL AANTSGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESELFRFTVKYSIALAIIMGIVFTLIAYVFPFIIPVTPT |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-132 | 55 |
