Name : SLUG_06530 (SLUG_06530) Accession : YP_005759776.1 Strain : Staphylococcus lugdunensis N920143 Genome accession: NC_017353 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative type I restriction enzyme Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 713704 - 716490 bp Length : 2787 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGTTATCAAGGAGAATTAGCATTAGAAAATGATGTTATCAAGCAGTTGGAGTCTCAAGGCTATGAAAGAATTATATT AAGAAATCATGAGCAGCTTGTAGAGAATTTCCGCCAAATCTTAAATGAACGTAATAAAGAAAACTTAAAAAATAGACCAC TTTCTGATACCGAGTTTGCACGCTTAATGACAGATATTAGCGATAAAAGTGTCTTTGATAGTGCGATGCAGTTACGTGAC AGTTACACATTAGAACGCGATGATGAATCTAAAGTTTATCTATACTTCTTAGATACAGAACACTGGTGTCAGAATAAATT CCAAGTAACGAACCAAGTGACTGTGGACGATAAATATAAAGCACGTTATGACGTAACGCTATTAATCAATGGGTTGCCTT TAGTTCAAATTGAATTGAAACGTAGTGGTATCGCAATTAGTCAAGCATTTAATCAAATTGAACGTTATCGCAAACATAAT TATCGTGGCTTGTTCCGCTTCATACAGCTCTTTGTAGTAAGTAATAAAAAAGAAACACGTTATTATGCCAATAGTGATAA AGAGATATTCAAGAGTTTAATGTTCTATTGGAGTGACAAAGATAACCGCCGTATTAATAATTTGAAAGAATTTATTCAAG AATTTCTTGATCGTTGTCGCATTGCTAAGATGATCAGTCGCTATATGATAACGAATGAAACAGATAAATTGCTTATGGCA TTGCGTCCTTATCAAGTCTATGCAGTTGAATCATTACTTAATCGTGCCACTGAAACCAATAATAATGGTTATATTTGGCA TACAACTGGTAGTGGTAAAACACTGACTTCCTTTAAAACAAGCCAAATACTGTCCAAAGATCCAAGTATTAAAAAAGTTA TTTTCCTAGTCGACCGTAAAGATTTGGATAGTCAAACACTTGCAGAATTTAATAAATTTCAAATGGATTCTGTTGATTTA ACAGATAATACACATAAATTGCTGAAACAACTCGATGACCCATTCCAAAAGCTTATTGTTACAACTATTCAAAAGATGGC GAATGCTGTTAAATCGGGTGCTAACATTATGGATAAATATCAGCAAGATAAAGTCATCTTTATCATTGACGAATGCCATC GTACCCAATTTGGAGAAATGCATCGCTTAATTAGACAACACTTTAAGCAAGCGCAATATTTTGGATTTACTGGTACGCCC CGCTTTGAAGAAAATGCCAGTCTAGATGGTCGAGCTACGGCAGACATTTTCGAAAAATGTTTACATACGTATTTAATTAA GGATGCTATTCGTGATGGTAACGTGTTAGGTTTCTCTGTAGAATATATCAGTACATTTGCCAATGCAATCCATGACATGG ATGAATCTTACGTATCTAGCATTGATGAAAATGAACTCTGGATGGCTGATGACCGACTAAACATGATTGCTAAGCATTTG GTGGCCAATCATCATAAAAAGACGCGTAATCAAATGTACACGTCTATCTTGACAGTTCAAAGTATTCCGATGGCTATTAA ATATTATAAAATTTTCAAGCAACTTAAAGACGCAGGTCAACATCATCTAAATGTCTCAACCATCTTTACTTATGCTGCAA ATGAAGATACACAAGAACAAATCGATAAAGTACATACTAAAGAAGAACTTGAACAAGTGATGTGTGATTATAATCAAATG TTTGATAAAAACTTTAGTCTAGACACGTTTGACGGTTTCTTTAATGATATTTCAAAACGTGTGAAACAAGGTAATCCGGC TGAACGCCTAGACATATTAATTGTCGTTGATATGTTCTTAACTGGTTTCGATAGTAAAAAGTTAAACACGCTATACGTTG ATCGTAATTTAAAATATCACGGCTTAATTCAAGCCTATTCACGTACAAACCGTGTTGAAAAGGAGACCAAACCCTACGGC AACATTGTATGTTATCGCAATCTTAAAGATAATACGGATAAAGCCATAGAACTCTTTTCTCAAACTAATGATACAGATAC AGTATTAAGCCCGTCATTCGATGTCTTATTATCTGATTTCAAGCATGTACTTACCCAATTACTTAACGTAGTTCCTACGC CTGATGATGTAGATAACCTAGAGCGAGAAGACGATCAACTCGACTTTGTACTCGCATATCGTGCCGTAGCGAGCTTGCTG CAAAGGTTAAAGACCTTTGATGAATTTGAATTTACTTCTGACCTTCTTGGCATTAGTCAACAGACATTTGAAGATTACCA AGGTAAATATTATGCCATTTATGACAAAGTCAAAGGTCAACGTCAAAGTGAAAAAACATCCGTGTTAGATGATATTGATT TCAAAATTGAAATTTTAAGAAATGATATGATTAATGTTCAATACATTCTTGATTTACTAAACAATATTGATTTAACGGAT AAAGCTCAAACCGAACGCGTGCGTAAACAAATCAAACAGTTATTAAGCAAGGCAGATGATGACAAATTACGTCTAAAAGC AGAACTGATTCGTGAATTCTTGGATAAAGTTATCCCTCACCTAGATAAAGATGCCGTGATTGAAGATGCTTACTTTAACT TTGAAGAAGAAGTAAAAGAACAGGAAATTCAAGAATTTGCTAATGACAAAGCATACCCTATCGACTTACTTAAAGAAGTC ATTAATGAGTATGAATTTAGCGGGCAACTTGATAATAACTTTGTCGAACAAGGTATTACAGGTGGTTTACTCGTCCGCAC ACAGAAAATTGAAAACGTTAAATCATTCGTTCAAGAAACAGCAGAAAAATATGGTGCAGCAAATTAA Protein sequence : MSYQGELALENDVIKQLESQGYERIILRNHEQLVENFRQILNERNKENLKNRPLSDTEFARLMTDISDKSVFDSAMQLRD SYTLERDDESKVYLYFLDTEHWCQNKFQVTNQVTVDDKYKARYDVTLLINGLPLVQIELKRSGIAISQAFNQIERYRKHN YRGLFRFIQLFVVSNKKETRYYANSDKEIFKSLMFYWSDKDNRRINNLKEFIQEFLDRCRIAKMISRYMITNETDKLLMA LRPYQVYAVESLLNRATETNNNGYIWHTTGSGKTLTSFKTSQILSKDPSIKKVIFLVDRKDLDSQTLAEFNKFQMDSVDL TDNTHKLLKQLDDPFQKLIVTTIQKMANAVKSGANIMDKYQQDKVIFIIDECHRTQFGEMHRLIRQHFKQAQYFGFTGTP RFEENASLDGRATADIFEKCLHTYLIKDAIRDGNVLGFSVEYISTFANAIHDMDESYVSSIDENELWMADDRLNMIAKHL VANHHKKTRNQMYTSILTVQSIPMAIKYYKIFKQLKDAGQHHLNVSTIFTYAANEDTQEQIDKVHTKEELEQVMCDYNQM FDKNFSLDTFDGFFNDISKRVKQGNPAERLDILIVVDMFLTGFDSKKLNTLYVDRNLKYHGLIQAYSRTNRVEKETKPYG NIVCYRNLKDNTDKAIELFSQTNDTDTVLSPSFDVLLSDFKHVLTQLLNVVPTPDDVDNLEREDDQLDFVLAYRAVASLL QRLKTFDEFEFTSDLLGISQQTFEDYQGKYYAIYDKVKGQRQSEKTSVLDDIDFKIEILRNDMINVQYILDLLNNIDLTD KAQTERVRKQIKQLLSKADDDKLRLKAELIREFLDKVIPHLDKDAVIEDAYFNFEEEVKEQEIQEFANDKAYPIDLLKEV INEYEFSGQLDNNFVEQGITGGLLVRTQKIENVKSFVQETAEKYGAAN |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SSP0054 | YP_300144.1 | type I site-specific restriction-modification system restriction subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 0.0 | 60 |