Name : SLUG_03970 (SLUG_03970) Accession : YP_005759521.1 Strain : Staphylococcus lugdunensis N920143 Genome accession: NC_017353 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 440155 - 441756 bp Length : 1602 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAGTTGAAAGTTTCAATCCGTTTAATAATATGCTGATTTCAGCAATTGTAGCGGCAGTGCCTATTATTTTATTCCT GCTGTGTTTAACAGTATTTAAAATGAAAGGCGTTTATGCGGCATTGACAACACTGATTGTCACTGCATTGGTAGCAATGA TATGCTTCAAATTACCTGCACGTATTGCAGGAGGCGCAACATTTGAAGGATTTTATCAAGGTATTATACCAATTGGCTTT ATTGTTATTATGGCGGTATGGCTTTATAAAATTGCAACTGAAAGTGGACAATTTAATATTGTCCAAGATAGTATTGCAAG TATTTCACAAGACCAACGTATTCAATTACTGCTTATTGGTTACTTATTTAATGGGTTTTTAGAAGGTGCAGCTGGATTCG GTGTACCGATTGCCATTTGTGCCGTATTGTTAATGCAACTAGGTTTCAAAGCATTGCCAGCAGCTATGTATTGTCTAGTT GCTAATGCAGCAGCTGGTGCTTATGGTGCTGTTGGTATTCCTATTGCGATTACAGATACACTAAATTTAGCAGGTGGTGT TAAAGCATCACAAGTTGCATTAATTGGTAATTTAACATTAGGTTTGATTAGTTTCTTTGTACCGTTTTTATTAATGTTTA TTATTGATGGTCTCAAAGGTGTTAAAGAAACGTTTCCAGCTACATTAATAGCCGCATCTGTATTTACCGGTTTACAAGTA TTGATTGCAGCATTTGCTGGCCCTGAGTTAGCTGATATCATCCCAGGCTTAGGTGCTATGGTTGCACTTGCATTATTCTC ACGTAAATTTCAACCTAAAAATATCTTTAGACTTGAAGATAATGAAGCGGTCGGCAAGGTTGAGAAACATTCAATTAAGC AAATTGTCTATGGATGGAGTCCTTTCATTATATTGACCGTTATTGTTATGGTATGGAGCTTACCAGCATTTAAAGCACTA TTTGAAAAAGGTGGTGCACTAAGTGCCCTTGTTGTTAACTTCAATGCTCCAGGTACGATGAATAATGTGACACATCATCC CAATGTTTTGACGTTTAACTTTATTGCACAAACTGGTACTGCAATATTAGTTACGGCTATCATTACCATCTTAATTGCTA AGCACATGTCGTTTAAAACTGCAGGCAAACTTTTAGGAGTGACAGTTAAAGAATTGTGGGTTTCTGTATTAACAATTTGC TTTATCTTGGCTGTCTCTAAAATTACGACATATGGCGGTTTGAGTAACGCTATGGGTCAAGGTATTGCTAAAACAGGTGC AATATTCCCATTGCTATCTCCAGTCCTAGGGTGGATTGGTGTGTTTATGACTGGTTCAGTGGTGAATAACAACTCATTAT TTGCACCTATTCAAGCTTCTGTAGCAACACAAATAGGTACAAAAGGCTCGCTCTTAGTTGCGGCTAACGTCGCTGGTGGA GTTACAGCTAAAATAGTATCTCCTCAATCAATTGCTATAGCCACAGCGGCTGTTAATAAAGTCGGTAAAGAGTCTGAATT GATGAAAATGGCTATGCGTTTTAGTATAGGTTTACTTATCTTTGCTTGTATTTGGACATTTATGTTGAGCCTATTTGTTT AA Protein sequence : MLVESFNPFNNMLISAIVAAVPIILFLLCLTVFKMKGVYAALTTLIVTALVAMICFKLPARIAGGATFEGFYQGIIPIGF IVIMAVWLYKIATESGQFNIVQDSIASISQDQRIQLLLIGYLFNGFLEGAAGFGVPIAICAVLLMQLGFKALPAAMYCLV ANAAAGAYGAVGIPIAITDTLNLAGGVKASQVALIGNLTLGLISFFVPFLLMFIIDGLKGVKETFPATLIAASVFTGLQV LIAAFAGPELADIIPGLGAMVALALFSRKFQPKNIFRLEDNEAVGKVEKHSIKQIVYGWSPFIILTVIVMVWSLPAFKAL FEKGGALSALVVNFNAPGTMNNVTHHPNVLTFNFIAQTGTAILVTAIITILIAKHMSFKTAGKLLGVTVKELWVSVLTIC FILAVSKITTYGGLSNAMGQGIAKTGAIFPLLSPVLGWIGVFMTGSVVNNNSLFAPIQASVATQIGTKGSLLVAANVAGG VTAKIVSPQSIAIATAAVNKVGKESELMKMAMRFSIGLLIFACIWTFMLSLFV |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-77 | 41 |