Gene Information

Name : SLUG_02850 (SLUG_02850)
Accession : YP_005759410.1
Strain : Staphylococcus lugdunensis N920143
Genome accession: NC_017353
Putative virulence/resistance : Virulence
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 303823 - 305184 bp
Length : 1362 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGCATGCCATATTAGATTTTATTGTTGATATTTTAAGTCAACCTGCGATTCTAGTTGCATTGATTGCGTTAATTGGTTT
GTTAGTACAGAAAAAATCAGCCACAGCGATTACAACAGGTACCATTAAAACAATGTTAGGCTTTCTTATTTTAAGTGCCG
GTGCAGGCGTTGTGTCTAATTCATTAGAACCTTTTGGAAAAATATTCCAACATGCATTTGGTGTTCAAGGTGTCGTGCCA
AACAATGAAGCAATTATTTCATTAGCATTAAAGGACTATGGGACAACAGCTGCGTTAATCATGGTATTTGGTATGTTAAT
TAATATTGTGATTGCACGCATATCAAATTTAAAATATATTTTCTTAACAGGACATCATACCTTTTATATGGCTGCCTTTT
TAGCCATTTTATTGACAGTCGGTCATATTAAAGGTTATTTAACTGTAACAATTGGTGCTGTGTTACTAGGCTTATTAATG
TCCATATTACCAACGTTAGCACAACCTACTATGCGTAAAATAACTGGAAATGATCAAGTTGCATTAGGTCATTTTGGAAC
AATCAGTTACTGGGCAGCGGGTGAGGTTGGTAAACTCTTTAAAGGGAAATCTAAATCTACGGAAGAAATTAAATTTCCTA
AAGGATTAAGTTTTTTACGAGAAAGTACAATTAGTATTTCTATTACCATGGCACTGCTATACTTGATTGCTTGTCTATTT
GCCGGTGTAGGTTATGTGCATGATCATATTAGCCAAGGACAAAACTTTATAGTCTTTTCAGTTATTCAAGGTGTGACCTT
TGCGGCAGGTGTTTTTATTATCTTAACAGGGGTACGTTTAATTTTAGCTGAAATTGTTCCGGCGTTTAAGGGTATTTCGG
AAAAACTAGTACCGAGCTCTAAACCAGCATTGGATTGTCCAATTGTCTTTCCATATGCACAAAATGCTGTGCTAATAGGA
TTCTTTGTTAGTTTTATTACCGGGGTAATTGGCATGTTCATTCTATTTTTCACGGGAGGCATTGTCATATTACCAGGTGT
TGTTGCACACTTTTTCCTAGGTGCAACATCTGCTGTCTTTGGTAATGCTCGAGGCGGTATTAAAGGTGCTGTTGCTGGTG
CGGCCTTGAATGGTATATTAATTACGTTCTTGCCATTATTATTTATCCCTTTCTTGGGAGACTTAGGTTTAGCGACAACA
ACATTTTCAGATACAGACTTCTTAGCTGTAGGTATTATCTTTGGTAATATCGTTAAGTATGCAGGTATTATAGGTTCTGT
CATCTTTATAGTCATTTTGGCAGCAGGCGCTATCTTCTTAAAAGGAAAAGCAGATAAGAAATATGAACAACAGCAATCAT
AA

Protein sequence :
MHAILDFIVDILSQPAILVALIALIGLLVQKKSATAITTGTIKTMLGFLILSAGAGVVSNSLEPFGKIFQHAFGVQGVVP
NNEAIISLALKDYGTTAALIMVFGMLINIVIARISNLKYIFLTGHHTFYMAAFLAILLTVGHIKGYLTVTIGAVLLGLLM
SILPTLAQPTMRKITGNDQVALGHFGTISYWAAGEVGKLFKGKSKSTEEIKFPKGLSFLRESTISISITMALLYLIACLF
AGVGYVHDHISQGQNFIVFSVIQGVTFAAGVFIILTGVRLILAEIVPAFKGISEKLVPSSKPALDCPIVFPYAQNAVLIG
FFVSFITGVIGMFILFFTGGIVILPGVVAHFFLGATSAVFGNARGGIKGAVAGAALNGILITFLPLLFIPFLGDLGLATT
TFSDTDFLAVGIIFGNIVKYAGIIGSVIFIVILAAGAIFLKGKADKKYEQQQS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed CAC39291.1 hypothetical protein Not tested LPA Protein 3e-96 57
vpeC ADD91725.1 putative PTS system-specific IIC component VpeC Virulence PAI-I AL862 Protein 3e-96 57
ORF8 AAK27335.1 unknown Not tested PAI-I AL862 Protein 3e-96 56