Name : SLUG_02170 (SLUG_02170) Accession : YP_005759342.1 Strain : Staphylococcus lugdunensis N920143 Genome accession: NC_017353 Putative virulence/resistance : Unknown Product : putative PTS system, IIBC component Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 230747 - 232282 bp Length : 1536 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAACAAAGTTTTTGAGAAAGCACAACAATTTGGGAAATCGTTTATGTTGCCTATTGCTATTTTACCTGCTGTTGGATT ATTACTTGGCATAGGAGGTGCACTTAGTAATCCAAGCACAGTCAAAGCTTATCCAGTATTAGATGTAGCCATACTACAGA ATATTTTTACATTAATGTCTAGTGCAGGAAACATTGTCTTTCAAAATTTACCAGTTATTTTTGCGATTGGTGTTGCTATA GGCCTAGCACGTAGTGATAAAGGGACGGCTGGACTAGCTGCATTGATTGGCTTTTTAATCATGAATGCCACCATGAATGG GATGCTAGTCATAACTGATGGTTTAGCTAAGACAACGGAGCTTGCAAAGCATGGACAAAGTATGGTGTTAGGGATTCAAA CGATAGAAACAGGTGTTTTTGGTGGGATTGTTACAGGTATTTTGACGGCTTATTTGCATAATAAATATAATAAAATTACG TTACCTGCTTATCTTGGTTTCTTTAGTGGTTCTCGTTTTGTACCTATTGTCACAGCGATAAGTGCTATTTTTCTTGGCGT TATCTTGTTTTATATTTGGCCTACAGTGCAAAGTGGGATTTTTAATGCGGGCGGTTTAGTTGAAAAAACAGGCGTTATTG GTACATTCTTCTTTGGTTTTATTTTAAGATTACTTGGTCCATTTGGGTTGCATCATATTTTTTATTTACCATTCTGGCAA ACAGGTCTTGGAGGTTCATTAGAAGTTGGAGGCCATATGGTACGTGGTACGCAGAATATCTTTTTAGCACAGCTAGGAGA TCCACATGTCACACATTATTTCTCAGGTATTTCACGCTATATGTCTGGCCGTTTTATTACGATGATGTTTGGGTTATGTG GCGCGGCATTGGCCATTTATCATACGGCTAAACCACAACATAAAAAGGTTGTTGGTGGATTAATGTTGTCTGCAGCATTA ACATCATTTTTGACAGGGATTACCGAGCCGTTAGAATTTAGTTTCTTATTTGTTGCGCCAGTATTGTATTTAATTCATGC ATTTTTAGATGGCTTGGCCTTTATGATGGCAGATATTTTTAATATCACGGTAGGACAAACATTTAGTGGTGGGTTTATCG ATTATATTTTATTTGGTGTTTTACAAGGTAATGATAAGACAAATTATCTGTGGGTCATTCCTATTGGTATTGTGTGGTTT GTCTTATATTATGTGATTTTCAGAACATTGATTACTGTTTTTAACTTTAAGACACCTGGTCGAGAAGATAAAGAAGCACA ACACACAGTAGCTTCAACAGAGCGCGCTGAAACAATTGTCCAAGGGTTAGGCGGTAAAGAAAATATTGAGGTCGTAGATT GCTGTGCAACGCGGTTGCGTGTAACACTTAAAGATGGTGACTTACTTGATAAATCCACACTGTTAAAGACCGATGCCAAA GGTGTAATTGTTAGAGGTAACGGCGCTCAGATTGTATACGGTCCTCACGTTACGACAATTAAAAATGAAGTTGAAGAATT ATTAGAACAATCATAG Protein sequence : MNKVFEKAQQFGKSFMLPIAILPAVGLLLGIGGALSNPSTVKAYPVLDVAILQNIFTLMSSAGNIVFQNLPVIFAIGVAI GLARSDKGTAGLAALIGFLIMNATMNGMLVITDGLAKTTELAKHGQSMVLGIQTIETGVFGGIVTGILTAYLHNKYNKIT LPAYLGFFSGSRFVPIVTAISAIFLGVILFYIWPTVQSGIFNAGGLVEKTGVIGTFFFGFILRLLGPFGLHHIFYLPFWQ TGLGGSLEVGGHMVRGTQNIFLAQLGDPHVTHYFSGISRYMSGRFITMMFGLCGAALAIYHTAKPQHKKVVGGLMLSAAL TSFLTGITEPLEFSFLFVAPVLYLIHAFLDGLAFMMADIFNITVGQTFSGGFIDYILFGVLQGNDKTNYLWVIPIGIVWF VLYYVIFRTLITVFNFKTPGREDKEAQHTVASTERAETIVQGLGGKENIEVVDCCATRLRVTLKDGDLLDKSTLLKTDAK GVIVRGNGAQIVYGPHVTTIKNEVEELLEQS |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ef0067 | AAM75272.1 | EF0067 | Not tested | Not named | Protein | 1e-88 | 49 |
APECO1_2642 | YP_859416.1 | PTS system, glucose-specific IIBC component | Not tested | Not named | Protein | 1e-74 | 41 |