Gene Information

Name : SLUG_02170 (SLUG_02170)
Accession : YP_005759342.1
Strain : Staphylococcus lugdunensis N920143
Genome accession: NC_017353
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : putative PTS system, IIBC component
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 230747 - 232282 bp
Length : 1536 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGAACAAAGTTTTTGAGAAAGCACAACAATTTGGGAAATCGTTTATGTTGCCTATTGCTATTTTACCTGCTGTTGGATT
ATTACTTGGCATAGGAGGTGCACTTAGTAATCCAAGCACAGTCAAAGCTTATCCAGTATTAGATGTAGCCATACTACAGA
ATATTTTTACATTAATGTCTAGTGCAGGAAACATTGTCTTTCAAAATTTACCAGTTATTTTTGCGATTGGTGTTGCTATA
GGCCTAGCACGTAGTGATAAAGGGACGGCTGGACTAGCTGCATTGATTGGCTTTTTAATCATGAATGCCACCATGAATGG
GATGCTAGTCATAACTGATGGTTTAGCTAAGACAACGGAGCTTGCAAAGCATGGACAAAGTATGGTGTTAGGGATTCAAA
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TATCTTGTTTTATATTTGGCCTACAGTGCAAAGTGGGATTTTTAATGCGGGCGGTTTAGTTGAAAAAACAGGCGTTATTG
GTACATTCTTCTTTGGTTTTATTTTAAGATTACTTGGTCCATTTGGGTTGCATCATATTTTTTATTTACCATTCTGGCAA
ACAGGTCTTGGAGGTTCATTAGAAGTTGGAGGCCATATGGTACGTGGTACGCAGAATATCTTTTTAGCACAGCTAGGAGA
TCCACATGTCACACATTATTTCTCAGGTATTTCACGCTATATGTCTGGCCGTTTTATTACGATGATGTTTGGGTTATGTG
GCGCGGCATTGGCCATTTATCATACGGCTAAACCACAACATAAAAAGGTTGTTGGTGGATTAATGTTGTCTGCAGCATTA
ACATCATTTTTGACAGGGATTACCGAGCCGTTAGAATTTAGTTTCTTATTTGTTGCGCCAGTATTGTATTTAATTCATGC
ATTTTTAGATGGCTTGGCCTTTATGATGGCAGATATTTTTAATATCACGGTAGGACAAACATTTAGTGGTGGGTTTATCG
ATTATATTTTATTTGGTGTTTTACAAGGTAATGATAAGACAAATTATCTGTGGGTCATTCCTATTGGTATTGTGTGGTTT
GTCTTATATTATGTGATTTTCAGAACATTGATTACTGTTTTTAACTTTAAGACACCTGGTCGAGAAGATAAAGAAGCACA
ACACACAGTAGCTTCAACAGAGCGCGCTGAAACAATTGTCCAAGGGTTAGGCGGTAAAGAAAATATTGAGGTCGTAGATT
GCTGTGCAACGCGGTTGCGTGTAACACTTAAAGATGGTGACTTACTTGATAAATCCACACTGTTAAAGACCGATGCCAAA
GGTGTAATTGTTAGAGGTAACGGCGCTCAGATTGTATACGGTCCTCACGTTACGACAATTAAAAATGAAGTTGAAGAATT
ATTAGAACAATCATAG

Protein sequence :
MNKVFEKAQQFGKSFMLPIAILPAVGLLLGIGGALSNPSTVKAYPVLDVAILQNIFTLMSSAGNIVFQNLPVIFAIGVAI
GLARSDKGTAGLAALIGFLIMNATMNGMLVITDGLAKTTELAKHGQSMVLGIQTIETGVFGGIVTGILTAYLHNKYNKIT
LPAYLGFFSGSRFVPIVTAISAIFLGVILFYIWPTVQSGIFNAGGLVEKTGVIGTFFFGFILRLLGPFGLHHIFYLPFWQ
TGLGGSLEVGGHMVRGTQNIFLAQLGDPHVTHYFSGISRYMSGRFITMMFGLCGAALAIYHTAKPQHKKVVGGLMLSAAL
TSFLTGITEPLEFSFLFVAPVLYLIHAFLDGLAFMMADIFNITVGQTFSGGFIDYILFGVLQGNDKTNYLWVIPIGIVWF
VLYYVIFRTLITVFNFKTPGREDKEAQHTVASTERAETIVQGLGGKENIEVVDCCATRLRVTLKDGDLLDKSTLLKTDAK
GVIVRGNGAQIVYGPHVTTIKNEVEELLEQS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
ef0067 AAM75272.1 EF0067 Not tested Not named Protein 1e-88 49
APECO1_2642 YP_859416.1 PTS system, glucose-specific IIBC component Not tested Not named Protein 1e-74 41