Name : glcA (SLUG_01600) Accession : YP_005759286.1 Strain : Staphylococcus lugdunensis N920143 Genome accession: NC_017353 Putative virulence/resistance : Unknown Product : PTS system glucose-specific transporter subunit IIABC Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 2.7.1.69 Position : 171883 - 173922 bp Length : 2040 bp Strand : + Note : - DNA sequence : GTGAGAAAGAAATTATTCGGTCAATTGCAACGTATAGGTAAAGCATTAATGTTACCAGTTGCTATTTTACCAGCTGCTGG GTTGTTACTCGCACTTGGTACTGCGATGCAGGGTGAATCATTACAGCATTATCTACCATTTATTAAAAATGGTGTGATTC AAAATATTGCCCTAATGATGACAGGGGCAGGTGGGATTATCTTTGATAACTTGCCAATGATTTTTGCTTTAGGTGTAGCT ATCGGTTTAGCCGGTGGTGATGGTGTAGCTGCGATTGCGGCATTTGTTGGTTACATCGTCATGAATAAAACGATGGGTGC TATCTTAAATGTTACCCCAAATGAAGTAAAAGATGCTGCCAGTGGTTATGCCAGTGTATTAGGTATTCCTACGTTGCAAA CAGGTGTCTTTGGTGGGATTATTATAGGTGGCTTAGCCGCGTGGTGTTATAACAAATTTTACAATATTTCGTTACCATCG TACTTAGGTTTCTTTGCGGGTAAACGTTTCGTGCCAATTATGATGGCAACGACGTCATTTGTTTTAGCGTTTCCAATGGC ATATGTATGGCCAATGATTCAATCTGGATTGAATGCATTTAGTGAAGGATTATTGGACTCTAATACAGGTTTGGCCGTAT TCTTATTTGGCTTTATTAAGCGATTATTAATACCATTTGGCCTACATCACATTTTCCATGCGCCATTTTGGTTTGAATTT GGTTCTTGGAAAAATGCGGCAGGTCATATAGTACGAGGAGATCAACTAATCTTTATTGATCAAATTCGTGAAGGTGCACA TCTGACTGCTGGTAAATTTATGCAAGGTGAATTCCCAGTGATGATGTTTGGTTTGCCGGCAGCAGCGCTAGCGATTTATC ATACAGCAAAACCTGAAAATAAAAAGGTTGTTGCAGGTTTGATGGGTTCAGCAGCTTTAACATCATTTTTAACAGGTATC ACAGAACCACTAGAATTCTCATTCTTATTTGTGGCACCGTTGCTCTTTGTTATCCATGCACTGTTAGATGGACTATCATT CTTAATTCTATATTTACTTCATTTGCATTTAGGTTATACATTCTCAGGTGGTTTTATTGATTACGTACTCTTAGGGGTAT TACCTAATAAAACAGCTTGGTGGCTAGTCATTCCAGTTGGTTTAGTCTATGCAGTTATCTATTATGTTATATTTAGATTC CTCATTAAGAAGTTAAACTTTAAGACACCAGGTCGCGAAGACAAAATGGCTTCAGCTAAACAAACAGCAGCAAGCGAGTT GCCATATGCAGTATTAGAAGCAATGGGTGGTAAGACGAATATTAAACATTTAGATGCATGTATTACCCGATTACGTGTTG AAGTGAATGACAAAGCGAAAGTGGATGTTGCAGGATTAAAAGATTTAGGGGCTTCAGGTGTGTTAGAAGTTGGTAATAAT ATGCAAGCTATTTTTGGTCCTAAATCAGATCAAATCAAACATGAAATGCAACAAATCATGAATGGTGAAGTTGTCGAACA TCCTATGTCAGCTGAAGATGACTCTGACGAAGCGGTAGTTGTAACAGAAACAAAAGCACAAGCGGAGACACATAGTGAAA GTGTCGTTGCGCCATTAGAAGGAAAAGTAGTCGATTTAGCTGATGTTCCGGATCAGGTCTTTAGTGAGAAAATGATGGGA GACGGCATAGCGATTAATCCAGTTAGTGGTGAAGTTCGAGCACCGTTCAATGGTAAGGTTCAAATGATTTTCCCTACGAA GCATGCCATCGGTTTAGTATCTGATCAAGGATTAGAGTTATTAATTCACATTGGTTTAGATACAGTTCAATTAGAAGGAC AAGGTTTCACAATGCATGTCGAAGAGGGGCAAACAATTGAACAAGGTCAACAATTAGTAACCTTTGATTTAGACTATCTT GGTGAAAATGCGAAAAGTTTAATTACACCAATTATTGTGACGAAAGGTGACATTACAGATATAGCTGTAAAAGCTGGTAA CAGTATCCATTTCGGCGACCACCTTTTTAACATTAAATAA Protein sequence : MRKKLFGQLQRIGKALMLPVAILPAAGLLLALGTAMQGESLQHYLPFIKNGVIQNIALMMTGAGGIIFDNLPMIFALGVA IGLAGGDGVAAIAAFVGYIVMNKTMGAILNVTPNEVKDAASGYASVLGIPTLQTGVFGGIIIGGLAAWCYNKFYNISLPS YLGFFAGKRFVPIMMATTSFVLAFPMAYVWPMIQSGLNAFSEGLLDSNTGLAVFLFGFIKRLLIPFGLHHIFHAPFWFEF GSWKNAAGHIVRGDQLIFIDQIREGAHLTAGKFMQGEFPVMMFGLPAAALAIYHTAKPENKKVVAGLMGSAALTSFLTGI TEPLEFSFLFVAPLLFVIHALLDGLSFLILYLLHLHLGYTFSGGFIDYVLLGVLPNKTAWWLVIPVGLVYAVIYYVIFRF LIKKLNFKTPGREDKMASAKQTAASELPYAVLEAMGGKTNIKHLDACITRLRVEVNDKAKVDVAGLKDLGASGVLEVGNN MQAIFGPKSDQIKHEMQQIMNGEVVEHPMSAEDDSDEAVVVTETKAQAETHSESVVAPLEGKVVDLADVPDQVFSEKMMG DGIAINPVSGEVRAPFNGKVQMIFPTKHAIGLVSDQGLELLIHIGLDTVQLEGQGFTMHVEEGQTIEQGQQLVTFDLDYL GENAKSLITPIIVTKGDITDIAVKAGNSIHFGDHLFNIK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
ef0067 | AAM75272.1 | EF0067 | Not tested | Not named | Protein | 3e-70 | 41 |