Gene Information

Name : polA (SLUG_12360)
Accession : YP_005760354.1
Strain : Staphylococcus lugdunensis N920143
Genome accession: NC_017353
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : DNA polymerase I
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : 2.7.7.7
Position : 1307148 - 1309781 bp
Length : 2634 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
GTGGATAAATTAGTTTTAATTGATGGAAATAGTTTGAGTTTCAGGGCATTTTACGCTTTGCCTTTGCTGTCGAATAAGGC
TGGTATTCATACAAATGCAATATATGGCTTTGCTATGTTACTAGAGAAAATATTGAAAGAAGAGCAACCTAATCATTTTT
TAGTAGCATTTGATGCAGGTAAGACGACTTTCAGACACGAAAAATATAGTGAATATAAAGGTGGGAGACAAAGTACGCCT
CCAGAATTAAGTGAACAATTCCCATATATTCGACAGTTATTAGATGCATATCATATTAAGTATTATGAATTAGAAAATTA
TGAGGCTGATGATATTATTGGTACGTTGAGCAAACAAGCTGAAGCGTCAGGGTTAGAAACGATTATTATTACAGGAGATC
GTGATTTAACACAATTAGCAACGGACCATGTAACAATTTATTACACGAAAAAAGGGGTTACTGATGTAGATCATTACACA
CCAGAATTCATTGCTGAAAAATATAATGGATTGTTACCAAAACAAATTATTGATATGAAAGGTCTTATGGGAGATACTTC
TGATAATATACCTGGAGTAGCTGGTGTTGGAGAAAAAACGGCAATTAAGTTACTTAACCAGTTTCATTCTGTTGAAGGTG
TGTATAATCATCTTGATGAAGTTTCTGGAAAAAAACTTAAGGAAAACCTTGAGAATAGTAAAGCCGATGCGTTTATGAGT
AAAGATTTAGCTACAATTAATTGTGACAGCCCTATAAAAGTGAATCTTAAAGATACAATTATGGGCGATTTAAATGATAA
TAAAGATAAAATTGAGCTTTTCCAAAAATTAGAATTTAAACAATTACTTAATGATATAGACAGTAGTGCTAGTGAAAATA
ACAGTGAAACTGAACACAATTTTGAAGTGATCCATCATTTTGATAATATAAATTTTAAAAAGCTAGATAATGCAATCATA
CATTTTGAAATTGATGGTAGTAATTATTTAAAGGATAAAATTTTAAAGTTTGGATTATATGCACAAAATCAATATATCGT
TATTTCGGCTGAGGATATCCATCAATATACTGAACTCATTGAGTGGTTAGAAAATGATCATAATAATAAAATTGTTTTTG
ATGCTAAAAAGACTTATGTTGCTGCACATCGTTTAGAAATTAATCTGCAGCATATTGATTTTGATGTTATGTTAGCAAGT
TATATTATTGATCCATCTCGTACTATAGAAGATGTTCAATCCGTAGTAAGTTATTATAATCAAAATTTTGTCAAAAGTGA
TATTGCTGTATATGGTAAAGGGAAAAAACGACAAGTTCCACTAGATGATGTGTTGGAAGTGCATATCGCTGCCATTATGC
AAGCTATTTATAATTGTAAACCATTAATGTCAGACATTCTGTCAGACCATAATCAAATGGACTTGTTGAATAATTTAGAG
TTGCCATTAGCGAGAATACTTGCTGACATGGAAGAAACAGGTATTTATACAGACGTAAATGATCTTAAGGAAATGCAAAA
CGAGCTTCAAGAAAAATTGGATAATCTTGTTTCAGAAATATATGAAGCAGCAGGTGAATCATTTAATATTAATTCACCTA
AACAATTGGGCATTGTTTTATTTGAAACATTAAAATTACCTATTATTAAAAAAACAAAGACGGGTTATTCTACTGCGGTT
GATGTACTTGAACAGTTACAAGGTAAACATCCTATTATTGATTACATTCTTGAGTATCGACAGTTGTCAAAATTACAATC
AACATATGTAGAAGGCTTGCAAAAAGTCATAAGTGACGATCAACGTATCCATACGCGTTTTAATCAGACATTAGCGCAAA
CTGGACGTCTTTCATCAATTGATCCGAATTTACAAAATATACCGATTCGTCTTGAGGAAGGTCGTAAAATTCGTAAAGCC
TTTAAACCAACGTCAGATGATTATGTTATTTTATCTGCGGATTATTCTCAAATTGAACTTCGTGTATTAGCACATATGAC
TCAAGATGAAAGTTTAAAAGAAGCTTTTATACATGGAGACGACATTCATGCTGCTACTGCTATGAAAGTGTTTGGAGTTG
AAAAAGATCAAGTTAATGATTTAATGCGTAGACAAGCAAAAGCGGTTAATTTTGGCATTGTTTATGGTATAAGTGATTAT
GGTCTTAGCCAAAATTTAGGTATTACACGTAAAAAAGCAAAAGCTTTTATTGATGATTATTTGGCTAGTTTTCCAGGTGT
TAAACAATATATGACCGATATTGTTAAAGATGCAAAAGCCAATGGTTATGTTGAAACGTTATTACATCGACGCCGTTATA
TTCCAGATATTACGAGCCGCAACTTTAATTTAAGAAGTTTTGCTGAAAGAACAGCCATGAATACGCCTATTCAAGGTAGT
GCTGCAGATATTATTAAATTGGCAATGGTACAATTTGATAAAAATGTAAGAGAAACAAACTATCATGCCAAATTATTACT
TCAAGTGCATGATGAATTAATATTTGAAGTTCCAAAGTCTGAGGTACAAGATTTTAGTGAATTTGTTGAAGAAATTATGG
ATAATGCATTAACACTTGCTGTCCCATTGCTTGTAGATTCTAGCTATGGAGCTACATGGTATGATGCTAAATAG

Protein sequence :
MDKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAIYGFAMLLEKILKEEQPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQSTP
PELSEQFPYIRQLLDAYHIKYYELENYEADDIIGTLSKQAEASGLETIIITGDRDLTQLATDHVTIYYTKKGVTDVDHYT
PEFIAEKYNGLLPKQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFHSVEGVYNHLDEVSGKKLKENLENSKADAFMS
KDLATINCDSPIKVNLKDTIMGDLNDNKDKIELFQKLEFKQLLNDIDSSASENNSETEHNFEVIHHFDNINFKKLDNAII
HFEIDGSNYLKDKILKFGLYAQNQYIVISAEDIHQYTELIEWLENDHNNKIVFDAKKTYVAAHRLEINLQHIDFDVMLAS
YIIDPSRTIEDVQSVVSYYNQNFVKSDIAVYGKGKKRQVPLDDVLEVHIAAIMQAIYNCKPLMSDILSDHNQMDLLNNLE
LPLARILADMEETGIYTDVNDLKEMQNELQEKLDNLVSEIYEAAGESFNINSPKQLGIVLFETLKLPIIKKTKTGYSTAV
DVLEQLQGKHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSIDPNLQNIPIRLEEGRKIRKA
FKPTSDDYVILSADYSQIELRVLAHMTQDESLKEAFIHGDDIHAATAMKVFGVEKDQVNDLMRRQAKAVNFGIVYGISDY
GLSQNLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMTDIVKDAKANGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRSFAERTAMNTPIQGS
AADIIKLAMVQFDKNVRETNYHAKLLLQVHDELIFEVPKSEVQDFSEFVEEIMDNALTLAVPLLVDSSYGATWYDAK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
polA YP_281523.1 DNA polymerase I Not tested Not named Protein 0.0 49