Gene Information

Name : cspC (SAT0131_02088)
Accession : YP_005753212.1
Strain : Staphylococcus aureus T0131
Genome accession: NC_017347
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : Phi PVL hypothetical protein
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 2076339 - 2080868 bp
Length : 4530 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGGAGAAAGAATAAAAGGTTTATCTATAGGTTTGGATTTGGATGCAGCAAATTTAAATAGATCATTTGCAGAAATCAA
ACGAAACTTTAAAACTTTAAATTCTGACTTAAAGTTAACCGGCAACAACTTCAAATATACCGAAAAATCAACTGATAGTT
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TTAGTTTAGGTACTATGTGGAAAGATATTAAGTCCGGTGCATCATCAGCATTTAACTGGACAAAAGATCAAATAGGTAAA
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AGATTAAGAAAAGTGCTACTGATTGGATAAAAGAAAATTTAGAAGCTATGGGCGGTGGCGATTTAGTCGGCGGAATATTA
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GTGGCGGTGATGCTACTTCTGGAAGTGGTGCAACTTATGCCAGCCGAGTAATCCGACAAGCGCAAAGTATTTTAGGAGGA
CGTTATAAAGGTAAGTGGATTCATGACCAGATGATGCGAGTTGCAAAGCGTGAAAGCAACTATCAATCAAATGCAGTGAA
TAATTGGGATATTAATGCTCAAAGAGGAGACCCGTCTAGAGGATTATTCCAAATTATCGGCTCAACTTTTAGAGCTAACG
CTAAACGAGGGTACACTAATTATAATAATCCAGTACATCAAGGTATCTCAGCAATGCAGTACATTGTTAGACGATATGGT
TGGGGTGGTTTTAAACGTGCTGGTGATTACGCATATGCTACAGGTGGAAAAGTTTTTGATGGTTGGTATAACTTAGGTGA
AGACGGTCATCCAGAATGGATTATTCCAACAGATCCAGCTCGTAGAAATGATGCAATGAAGATTTTGCATTATGCAGCAG
CAGAAGTAAGAGGGAAAAAAGCGAGTAAAAATAAGCGTCCTAGCCAATTATCAGACTTAAACGGGTTTGATGATCCTAGC
TTATTATTGAAAATGATTGAACAACAGCAACAACAAATAGCTTTATTACTGAAAATAGCACAATCTAACGATGTGATTGC
AGATAAAGATTATCAGCCGATTATTGACGAATACGCTTTTGATAAAAAGGTGAACGCGTCTATAGAAAAGCGAGAAAGGC
AAGAATCAACAAAAGTAAAGTTTAGAAAAGGAGGAATTGCTATTCAATGA

Protein sequence :
MGERIKGLSIGLDLDAANLNRSFAEIKRNFKTLNSDLKLTGNNFKYTEKSTDSYQQRIKELDGTIIGYKKNVDDLAKQYD
KVSQEQGENSAEAQKLRQEYNKQANELNYLERELQKTSAEFEEFKKAQVEAQRMAESGWGKTSKIFESMGPKLTKMGDGL
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GFEMKESIALFSQWEKSGVNTEIAFSGLKKAISNWGKAGKNPREEFKKTLAEIEKTPDIASATSLAIEAFGAKAGPDLAD
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TNMKNWLSNTWSSIRTNTIGKAQSLFSGVKSKFTNLWNATKEIFSNLRNWMSNIWNSIKDNTVGIASRLWSKVRGIFTNM
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SGTMVKPGDVVGLTGNTGFSTGPHLHFEMRRNGRHFDPEPYLRNAKKKGRLSIGGGDATSGSGATYASRVIRQAQSILGG
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WGGFKRAGDYAYATGGKVFDGWYNLGEDGHPEWIIPTDPARRNDAMKILHYAAAEVRGKKASKNKRPSQLSDLNGFDDPS
LLLKMIEQQQQQIALLLKIAQSNDVIADKDYQPIIDEYAFDKKVNASIEKRERQESTKVKFRKGGIAIQ

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAV1955 NP_372479.1 phi PVL ORF 15 and 16-like protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 100
SAKOR_01932 YP_008492120.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 99
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 98
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 98
SA1766 NP_375064.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 96
MW1895 NP_646712.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 52