Gene Information

Name : ECTR2_1827 (ECTR2_1827)
Accession : YP_005750520.1
Strain : Staphylococcus aureus ECT-R 2
Genome accession: NC_017343
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : phage tail tape measure protein, TP901 family, core region
Function : -
COG functional category : -
COG ID : -
EC number : -
Position : 1963912 - 1968441 bp
Length : 4530 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGGAGAAAGAATAAAAGGTTTATCTATAGGTTTGGATTTAGATGCAGCAAATTTAAATAGATCATTTGCAGAAATCAA
ACGAAACTTTAAAACTTTAAATTCTGACTTAAAGTTAACCGGTAACAACTTCAAATATACCGAAAAATCAACTCATAGTT
ACAAACAAAGGATTAAAGAACTTGATGGAACTATCACAGGTTATAAGAAAAACGTTGATGATTTAGCCAAGCAATATGGC
AAGGTATCTCAAGAACAGGGCGAAAACAGCGCGGAAGCTCAAAAATTACGACAAGAATATAACAAACAAGCAAATGAGCT
GAATTTTTTAGAAAAAGAACTAGAAAAAACAACAACTGAGTTTGAAGAGTTCAAAAAAGCTCAAGTTGAAGCTCAAAGAA
TGGCAGAAAGTGGCTGGGGAAAAACCAGTAAAGTTTTTGAAAGTATGGGACCTAAATTAACAAAAATGGGTGATGGTTTA
AAATCCATTGGTAAAGGTTTGATGATTGGTGTAACTGCACCTGTTTTAGGTATTGCAGCAGCATCAGGAAAAGCTTTTGC
AGAAGTTGATAAAGGTTTAGATACAGTTACCCAAGCAACAGGAGCAACCGGCGGAGAGCTTAAGAAGTTGCAGAATTCAT
TTAAAGATGTTTATGGCAACTTTCCAGAAGACGCTGAGACTGTAGGCGGTGTTTTAGGGGAAGTTAACACAAGGTTAGGT
TTCACTGGCAAAGAACTTGAGAGTGCCACAGAGTCATTCTTGAAATTTAGTCACATAACAGGTTCTGACGGCGTACAAGC
CGTTCAATTAATTACGCGTGCAATGGGTGATGCAGGTATTGAAGCTGATGAGTATCAAAGTGTACTTGATATGGTAGCGA
AAGCAGCACAGGCTAGCGGTATAAGTGTTGATACATTAGCTGATAGCATTACTAAATACGGTGCTCCAATGAGGGCTATG
GGCTTTGAGATGAAAGAATCAATCGCTTTATTCTCTCAATGGGAGAAATCAGGTGTTAATACTGAAATAGCCTTCAGTGG
TTTGAAAAAAGCTATATCCAATTGGGGTAAAGCGGGTAAAGACCCAAGAGAAGAATTTAAGAAGACATTAGCAGAAATTG
AAAGGACACCGGATATAGCTAGCGCAACAAGTTTAGCGATTGAAGCATTTGGTGCAAAAGCAGGTCCTGATTTAGCAGAT
GCTATTAAAGGCGGTCGCTTTAGTTACCAAGAGTTCTTAAAAACTATCGAAGATTCGCAAGGAACGGTCAATCAGACATT
TAAAGATTCTGAAAGTGGCTCCGAAAGATTTAAAGTAGCAATGAATAAACTTAAATTAGTAGGTGCTGATGTATGGGCTT
CTATTGAAAGTGCGTTTGCTCCAGTCATGGAAGAATTAATCAAAAAGCTATCTGTAGCAGTTGATTGGTTTTCAAGTTTA
AGTGATGGATCTAAAAGGTCGATTGTTATATTCGGTGGTATTGCTGCTGCAATTGGTCCTGTAGTTTTTGGATTAGGTGC
ATTCATAAGCACAGTTGGCAACGCAGTAACTGTATTAGCTCCATTATTAGCTAGTATTGCAAAGGCTGGTGGATTGATTA
GTTTTTTATCGACTAAAGTACCTATATTAGGAACTGTCTTCACAGCTTTAACTGGTCCAATTGGCATTGTATTAGGTGTA
TTGGCTGGTTTAGCAGTCGCATTTACAATTGCTTATAAGAAATCTGAAACATTTAGAAATTTTGTTAATGGTGCAATTGA
AAGTGTTAAACAAACATTTAGTAATTTTATTCAATTTATTCAACCTTTCATTGATTCTGTTAAAAACATCTTTAAACAAG
CGATATCAGCAATAGTTGATTTTGCTAAAGATATTTGGAGTCAAATCAATGGATTCTTTAATGAAAATGGAATTTCCATT
GTTCAAGCACTTCAAAATATATGCAACTTTATTAAAGCGATATTTGAATTTATTTTAAATTTTGTAATTAAACCAATTAT
GTTCGCAATCTGGCAAGTGATGCAATTTATTTGGCCGGCGGTTAAAGCCTTGATTGTCAGCACTTGGGAAAATATCAAAG
GTGTAATACAAGGGGCTATTAATATTATTTTGGGTATTATCAAAGTGTTCTCTAGTCTTTTCACAGGAAACTGGCGAGGC
GTTTGGGACGGCATTGTAATGATACTGAAAGGTACTGTGCAGTTAATTTGGAATTTAATTCAATTATGGTTTGTAGGCAA
AATACTTGGCGTTGTTAGGTACTTTGGCGGATTGCTAAAAGGTTTAATAACTATTATATGGGTTGCTATAATAGGCGTTT
TCAAGAAATCATTATCGGCAATTTGGAATGCAACAAAAAGTATTTTTGGTTTCTTATTCAATAGTGTTAAATCTATTTTC
ACTAATATGAAAAACTGGTTATCTAGTACGTGGAATAATATCAAAAGCAATACCGTCGGCAAGGCTCATTCGTTATTTAC
GGGTGTAAGGTCTAAATTCACAAGTTTATGGAATGCGACGAAAGATATATTTATTAAATTAAGAAATTGGATGTCAAACA
TCTGGAACTCTATTAAAGATAACACTGTAGGTATAGCTGGTCGCTTATGGGATAGAGTGCGTAACATCTTTGGAAGCATG
CGTGACGGTTTAAAATCTATCATTGGTAAAATTAAAGATCATATCGGTGGTATGGTAGACGCTGTTAAAAGAGGTCTTAA
TAAATTAATTGAAGGTTTAAACTGGGTCGGTGGTAAGTTGGGTATGGACAAAATACCGAAGTTACACACTGGTACTGAAC
ATACGCATACTACTACAAGATTAGTTAAGAACGGTAAGATTGCGCGGGATACGTTCGCTACGGTTGGGGATAAAGGACGT
GGAAATGGTCCGAATGGTTTCAGAAATGAAATGATTGAATTCCCTAATGGCAAACGGGTACTTACGCCTAATACAGATAC
GACAGCGTACTTACCTAAAGGTTCAAAAGTATATAACGGCGCACAAACTTATTCAATGTTAAATGGAACGCTTCCAAGAT
TTAGCATAGGTACTATGTGGAAAGATATTAAATCCGGTGCATCATCGGCATTTAACTGGACAAAAGATCAAATAGGTAAA
GGTACCAAATGGCTTGGCGATAAAGTTGGCGATGTTTTAGATTTTATTGAAAATCCAGGCAAACTTTTAAATTATATACT
TGAAGCTTTTGGAATTGATTTCAATTCTTTAACTAAAGGTATGGGAATTGCAGGCGACATAACAAAAGCTGCATGGTCTA
AGATTAAGAAAAGTGCTACTGATTGGATAAAAGAAAATTTAGAAGCTATGGGCGGTGGCGATTTAGTCGGCGGAATATTA
GACCCTGACAAAATTAATTATCATTATGGACGTACCGCAGCTTATACCGCTGCAACTGGAAGACCATTTCATGAAGGTGT
CGATTTTCCATTTGTATATCAAGAAGTTAGAACGCCGATGGGTGGCAGACTTACAAGAATGCCATTTATGTCTGGTGGTT
ATGGTAATTATGTAAAAATTACTAGTGGCGTTATCGATATGCTATTTGCGCATTTGAAAAACTTTAGCAAATCACCACCT
AGTGGCACGATGGTAAAGCCCGGTGATGTTGTTGGTTTAACTGGTAATACCGGATTTAGTACAGGACCACATTTACATTT
TGAAATGAGGAGAAATGGACGACATTTTGACCCTGAACCATATTTAAGGAATGCTAAGAAAAAAGGAAGATTATCAATAG
GTGGTGGCGGTGCTACTTCTGGAAGTGGCGCAACTTATGCCAGTCGAGTAATCCGACAAGCGCAAAGTATTTTAGGTGGT
CGTTATAAAGGTGAGTGGATTCATGACCAAATGATGCGCGTTGCAAAACGTGAAAGTAACTACCAGTCAAATGCAGTGAA
TAACTGGGATATAAATGCTCAAAGAGGAGACCCATCAAGAGGATTATTCCAAATCATCGGCTCAACTTTTAGAGCAAACG
CTAAACGTGGATATACTAACTTTAATAATCCGGTTCATCAAGGTATTTCAGCAATGCAGTACATTGTTAGACGCTACGGT
TGGGATGGATTTAAGCGTGCGGGTGATTACGCATATGCTACAGGCGGAAAAGTTTTTGATGGTTGGTATAACTTAGGTGA
AGACGGTCATCCAGAATGGGTTATTCCAACAGATCCAGCTCGTAGAAATGATGCAATGAAGATGTTACATTATGCAGCTG
CGGAAGTTAGAGGGAAAAACGCAAGTAAGAATAAACGACCTAGTCAATTATCTAGTGTAAATGGGTTTGATGACCCAAGC
TTATTATTGAAAATGATTGAACAACAGCAACAACAAATAGCTTTATTACTGAAGATAGCGCAATCTAACGATGTGATTGC
AGATAAAGATTATCAGCCGATTATTGACGAATACGCTTTTGATAAAAAGGTGAACGCGTCTATAGAAAAGCGAGAAAGGC
AAGAATCAACAAAAGTAAAGTTTAGAAAAGGAGGAATTGCTATTCAATGA

Protein sequence :
MGERIKGLSIGLDLDAANLNRSFAEIKRNFKTLNSDLKLTGNNFKYTEKSTHSYKQRIKELDGTITGYKKNVDDLAKQYG
KVSQEQGENSAEAQKLRQEYNKQANELNFLEKELEKTTTEFEEFKKAQVEAQRMAESGWGKTSKVFESMGPKLTKMGDGL
KSIGKGLMIGVTAPVLGIAAASGKAFAEVDKGLDTVTQATGATGGELKKLQNSFKDVYGNFPEDAETVGGVLGEVNTRLG
FTGKELESATESFLKFSHITGSDGVQAVQLITRAMGDAGIEADEYQSVLDMVAKAAQASGISVDTLADSITKYGAPMRAM
GFEMKESIALFSQWEKSGVNTEIAFSGLKKAISNWGKAGKDPREEFKKTLAEIERTPDIASATSLAIEAFGAKAGPDLAD
AIKGGRFSYQEFLKTIEDSQGTVNQTFKDSESGSERFKVAMNKLKLVGADVWASIESAFAPVMEELIKKLSVAVDWFSSL
SDGSKRSIVIFGGIAAAIGPVVFGLGAFISTVGNAVTVLAPLLASIAKAGGLISFLSTKVPILGTVFTALTGPIGIVLGV
LAGLAVAFTIAYKKSETFRNFVNGAIESVKQTFSNFIQFIQPFIDSVKNIFKQAISAIVDFAKDIWSQINGFFNENGISI
VQALQNICNFIKAIFEFILNFVIKPIMFAIWQVMQFIWPAVKALIVSTWENIKGVIQGAINIILGIIKVFSSLFTGNWRG
VWDGIVMILKGTVQLIWNLIQLWFVGKILGVVRYFGGLLKGLITIIWVAIIGVFKKSLSAIWNATKSIFGFLFNSVKSIF
TNMKNWLSSTWNNIKSNTVGKAHSLFTGVRSKFTSLWNATKDIFIKLRNWMSNIWNSIKDNTVGIAGRLWDRVRNIFGSM
RDGLKSIIGKIKDHIGGMVDAVKRGLNKLIEGLNWVGGKLGMDKIPKLHTGTEHTHTTTRLVKNGKIARDTFATVGDKGR
GNGPNGFRNEMIEFPNGKRVLTPNTDTTAYLPKGSKVYNGAQTYSMLNGTLPRFSIGTMWKDIKSGASSAFNWTKDQIGK
GTKWLGDKVGDVLDFIENPGKLLNYILEAFGIDFNSLTKGMGIAGDITKAAWSKIKKSATDWIKENLEAMGGGDLVGGIL
DPDKINYHYGRTAAYTAATGRPFHEGVDFPFVYQEVRTPMGGRLTRMPFMSGGYGNYVKITSGVIDMLFAHLKNFSKSPP
SGTMVKPGDVVGLTGNTGFSTGPHLHFEMRRNGRHFDPEPYLRNAKKKGRLSIGGGGATSGSGATYASRVIRQAQSILGG
RYKGEWIHDQMMRVAKRESNYQSNAVNNWDINAQRGDPSRGLFQIIGSTFRANAKRGYTNFNNPVHQGISAMQYIVRRYG
WDGFKRAGDYAYATGGKVFDGWYNLGEDGHPEWVIPTDPARRNDAMKMLHYAAAEVRGKNASKNKRPSQLSSVNGFDDPS
LLLKMIEQQQQQIALLLKIAQSNDVIADKDYQPIIDEYAFDKKVNASIEKRERQESTKVKFRKGGIAIQ

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SA1766 NP_375064.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 99
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 96
SAV1955 NP_372479.1 phi PVL ORF 15 and 16-like protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 96
SAKOR_01932 YP_008492120.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 96
SAUSA300_1930 YP_494581.1 phi77 ORF001-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 96
MW1895 NP_646712.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa3 Protein 0.0 53