|
Name : lctP2 (HMPREF0772_10823) Accession : YP_005746905.1 Strain : Staphylococcus aureus TCH60 Genome accession: NC_017342 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : - Position : 900642 - 902240 bp Length : 1599 bp Strand : + Note : COG: COG1620 DNA sequence : ATGTTAGTAAATACGTTTAACCCATTTGATAATTTATTATTATCGTCTTTAATTGCAGCAATACCGATTGTACTGTTTTT ACTTTGTTTAACTGTTTTTAAAATGAAAGGTATTTATGCAGCCATTACAACACTTGTTGTAACATTACTAATTGCAATAC CATTTTTCAAATTGCCAGTTGGTATCGCTTCTGGTGCAGTAGTCGAAGGTTTCTTCCAAGGCATCATTCCGATTGGCTAT ATCGTTATGATGGCGGTATTGTTATATAAAATTACTGTTGAATCTGGACAATTTTTAACAATTCAAGATAGTATTACAAA TATTTCACAAGACCAACGTATTCAAGTTTTACTTATTGGATTTGCATTCAACGCATTTTTAGAAGGTGCAGCAGGATTTG GTGTACCAATTGCAATTTGTGCACTTTTATTAACACAATTAGGATTTAATCCATTAAAAGCTGCGATGTTATGTTTAGTC GCAAATGCAGCGTCTGGTGCTTTTGGTGCGATTGGTATCCCTGTAGGTGTTGTAGAAACGTTGAAATTACCTGGAGATGT TTCAGTATTAGGTGTTTCTCAATCAGCAACTTTAACATTGGCAATCATAAATTTCATTATTCCATTCTTACTTATCTTTA TTATTGATGGTTTTAGAGGTGTTAAAGAAACATTACCAGCAATTTTAGTAGTTTCAATCACTTATACACTTACGCAAGGA TTATTAACTGTTTTCAGCGGACCTGAATTAGCAGATATTATTCCGCCGTTATTAACAATGTTAGCATTAGCAGTATTTTC TAAAAAATTCCAACCAAAACACATTTATCGTGTTAATAAAGATGAAGAAATTGAACCTGCAAAAGCACATTCTGCAAAAG CAGTATTACATGCATGGAGTCCATTCATTGTATTAACAGTCATTGTAATGATTTGGAGTGCGCCATTCTTTAAAAACTTA TTCTTACCAAATGGTGCTTTATCATCATTAGTATTTAAATTCAACTTACCTGGAACAGTCAGCGAAGTTACGCATAAACC ATTAGTATTGACTTTAAATATTATTGGACAAACAGGTACAGCTATTTTATTAACTATTATTATTACAATTTTAATGTCTA AAAAGGTTAACTTTAAAGATGCAGGTAGATTATTCGGTGTTACATTTAAAGAATTATGGTTACCAGTTCTTACAATTTGT TTCATCTTAGCAATTTCTAAAATCACAACTTATGGTGGTTTAAGTGCGGCAATGGGTCAAGGTATTGCTAAAGCAGGTAA TGTCTTCCCAGTTCTATCACCAATCTTAGGTTGGATAGGTGTGTTTATGACAGGATCAGTTGTAAATAACAACTCATTAT TTGCACCAATTCAAGCTTCTGTTGCACAACAAATTGGAACAAGTGGTTCACTTCTTGTATCTGCTAATACAGTTGGTGGT GTAGCGGCAAAATTGATTTCACCACAATCTATTGCAATTGCAACTGCAGCAGTAAAACAAGTTGGTAAGGAATCAGAATT ATTAAAAATGACATTGAAATACAGTGTATGTTTACTAATATTCATCTGTATTTGGACTTTCATCTTGTCATTATTATAA Protein sequence : MLVNTFNPFDNLLLSSLIAAIPIVLFLLCLTVFKMKGIYAAITTLVVTLLIAIPFFKLPVGIASGAVVEGFFQGIIPIGY IVMMAVLLYKITVESGQFLTIQDSITNISQDQRIQVLLIGFAFNAFLEGAAGFGVPIAICALLLTQLGFNPLKAAMLCLV ANAASGAFGAIGIPVGVVETLKLPGDVSVLGVSQSATLTLAIINFIIPFLLIFIIDGFRGVKETLPAILVVSITYTLTQG LLTVFSGPELADIIPPLLTMLALAVFSKKFQPKHIYRVNKDEEIEPAKAHSAKAVLHAWSPFIVLTVIVMIWSAPFFKNL FLPNGALSSLVFKFNLPGTVSEVTHKPLVLTLNIIGQTGTAILLTIIITILMSKKVNFKDAGRLFGVTFKELWLPVLTIC FILAISKITTYGGLSAAMGQGIAKAGNVFPVLSPILGWIGVFMTGSVVNNNSLFAPIQASVAQQIGTSGSLLVSANTVGG VAAKLISPQSIAIATAAVKQVGKESELLKMTLKYSVCLLIFICIWTFILSLL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 3e-75 | 42 |
