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Name : treC (HMPREF0772_10047) Accession : YP_005746129.1 Strain : Staphylococcus aureus TCH60 Genome accession: NC_017342 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha,alpha-phosphotrehalase Function : - COG functional category : - COG ID : - EC number : 3.2.1.93 Position : 54877 - 56517 bp Length : 1641 bp Strand : - Note : COG: COG0366 DNA sequence : GTGTTGAAAGAAATAGATTGGAGAAAGTCAGTAGTATATCAAATATATCCTAAGTCATTTAATGATACGACAGGAAATGG TATAGGTGATATCAACGGTATTATAGAAAAATTAGATTATATCAAATTGTTAGGTGTTGATTATATTTGGTTAACACCAG TGTATGAATCGCCAATGAATGATAATGGTTATGATATAAGCAATTATTTAGAAATAAATGAGGACTTCGGTACGATGGAT GATTTTGAAAGGTTAATTAATGTTGCGCATGAAAAAGGTATTAAAGTGATGTTAGATATTGTAATCAATCATACATCGAC GGAGCATGAATGGTTTAAAGCGGCTCGTAAATCTAAAGACAATCCATATAGAGATTATTACTTTTTTAAAGCATCTGAAG ATGGGCCTCCAACAAATTGGCATTCCAAATTCGGAGGTAATGCATGGAAGTATGATTCTGAGACAGATGAATATTATTTA CATTTATTTGATGTCAGTCAAGCTGATTTAAATTGGGATAATCCGGAAGTACGTCAATCGTTATATCGCATTGTCAATCA TTGGATAGACTTCGGCGTTGATGGTTTTCGATTTGATGTCATTAACTTAATTTCTAAAGGTGAATTTAAGGACTCTGACA AAATAGGTAAAGAATTTTATACGGATGGTCCTAGAGTGCATGAGTTTCTGCATGAATTAAATCGTCAAACGTTTGGTAAC ACTGACATGATGACTGTAGGAGAAATGTCTTCGACGACGATTGAAAATTGTATTAAGTATACACAGCCAGAACGCCAAGA ATTGAATAGTGTTTTTAATTTTCATCATCTAAAGGTTGATTATGTTGATGGTGAAAAGTGGACAAATGCGAAGCTTGATT TTCATAAGTTAAAGGAAATTCTGATGCAATGGCAACGAGGTATTTATGACGGTGGCGGATGGAACGCGATTTTCTGGTGT AATCATGATCAGCCACGGGTAGTGTCTAGATTTGGTGATGATACGTCGGAAGAGATGAGGATACAAAGTGCTAAAATGTT AGCTATCGCACTGCATATGTTGCAAGGGACGCCATATATTTACCAAGGTGAAGAAATTGGTATGACGGACCCACATTTTA CATCAATAGCACAATATCGTGATGTTGAATCGATTAATGCCTACCATCAGTTGTTAAGTGAAGGGCATGCTGAAGCGGAT GTGTTAGCGATTTTAGGACAGAAGTCACGAGATAATTCGAGAACGCCTATGCAATGGAGTGATGATGTTAATGCTGGATT TACAGCTGGTAAGCCTTGGATTGATATTTCGGAAAATTATCATCAGGTCAACGTTAGACAAGCACTTCAGAATAAAGATT CTATTTTCTATACGTATCAAAAATTAATACAATTAAGACATACGCATGATATTATTACGTATGGAGACATTGTGCCACGT TTTATGGATCATGATCATTTATTTGTTTATGAACGTCATTATAAGAATCAACAATGGCTAGTAATTGCGAATTTCTCAGC ATCGGCTGTTGATTTGCCAGAAGGATTGGCGTGCGAAGGTCGTGTTGTGATTCAAACTGGTACAGTGGAAAATAATACGA TAAGCGGGTTTGGTGCAATTGTAATCGAAACAAACGCGTAA Protein sequence : MLKEIDWRKSVVYQIYPKSFNDTTGNGIGDINGIIEKLDYIKLLGVDYIWLTPVYESPMNDNGYDISNYLEINEDFGTMD DFERLINVAHEKGIKVMLDIVINHTSTEHEWFKAARKSKDNPYRDYYFFKASEDGPPTNWHSKFGGNAWKYDSETDEYYL HLFDVSQADLNWDNPEVRQSLYRIVNHWIDFGVDGFRFDVINLISKGEFKDSDKIGKEFYTDGPRVHEFLHELNRQTFGN TDMMTVGEMSSTTIENCIKYTQPERQELNSVFNFHHLKVDYVDGEKWTNAKLDFHKLKEILMQWQRGIYDGGGWNAIFWC NHDQPRVVSRFGDDTSEEMRIQSAKMLAIALHMLQGTPYIYQGEEIGMTDPHFTSIAQYRDVESINAYHQLLSEGHAEAD VLAILGQKSRDNSRTPMQWSDDVNAGFTAGKPWIDISENYHQVNVRQALQNKDSIFYTYQKLIQLRHTHDIITYGDIVPR FMDHDHLFVYERHYKNQQWLVIANFSASAVDLPEGLACEGRVVIQTGTVENNTISGFGAIVIETNA |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 3e-120 | 49 |
